| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,991,805:1 | +T | 5.0% | intergenic (+46/‑289) | ygeG → / → ygeH | SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,991,805 | 1 | . | T | 5.0% | 647.9 / 28.7 | 160 | intergenic (+46/‑289) | ygeG/ygeH | SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (89/63); new base T (6/2); total (95/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.09e-01 | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
AATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCC > NC_000913/2991656‑2991954 | aatgTTTCTATCACATTATTAAAAATTGTGAGTATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCACGCATATATTGAACTCTTAAACGATATTTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTGTAGTGCAGTTAAc < 2:240804/150‑1 (MQ=255) atgTTTCTATCACATTATTAACAATTTTGAGGATGATAGTGTTAATAGTAAAGCTAAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAc‑‑c < 1:1221230/150‑1 (MQ=255) atgTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAc‑‑c < 1:139996/150‑1 (MQ=255) gTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CAc < 1:1057651/150‑1 (MQ=255) tCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCATGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAAcc < 2:990928/150‑1 (MQ=255) tCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAAcc > 1:443291/1‑150 (MQ=255) cacaTTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑AACTATAACCa > 1:566991/1‑150 (MQ=255) aacaTTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCTCATGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCa < 2:975216/149‑1 (MQ=255) ttaACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACctc > 2:733163/1‑150 (MQ=255) taACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACctct > 1:1657706/1‑150 (MQ=255) aaCAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCtt < 1:818447/150‑1 (MQ=255) cAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTAt > 1:354809/1‑150 (MQ=255) aaTTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATg > 2:1453371/1‑150 (MQ=255) tgtgAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGttt > 2:922599/1‑150 (MQ=255) gtgAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGtttt > 2:945531/1‑150 (MQ=255) tgAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTc < 2:1805376/150‑1 (MQ=255) tgAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTc > 1:1783485/1‑150 (MQ=255) taGGATGATAGTGTTAAGAGTAAATCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGtttgcc < 1:294151/149‑4 (MQ=255) gAGGATGATAGTGGTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCt < 2:576461/150‑1 (MQ=255) atgatAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTaaa < 1:1029374/150‑1 (MQ=255) atgatAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTaaa < 1:1376628/150‑1 (MQ=255) gatAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATc < 2:1116943/150‑1 (MQ=255) atAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCa < 1:752490/150‑1 (MQ=255) agagTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTaa > 2:1027912/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAATCGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGATAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAAc > 1:722133/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAAc < 2:400749/150‑1 (MQ=255) gTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAAc > 2:1531338/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCCCCGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATATTGGCTAAGCAATACAATAATTTGGTTAAAATTGCTGGTTATTGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCCACCCCTCTTATGTTTTCTTAAATAAGCATCTTaaaaa > 2:1443262/1‑149 (MQ=255) aaGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGt < 1:1544061/150‑1 (MQ=255) cgcAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTaa > 1:1338287/1‑150 (MQ=255) cgcAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCAGTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTaa > 1:292642/1‑150 (MQ=255) gcAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAag > 1:176917/1‑150 (MQ=255) ggCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGc > 2:419933/1‑150 (MQ=255) ggCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGc > 1:1694614/1‑150 (MQ=255) tatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAATAGCATACta > 2:765157/1‑150 (MQ=255) atTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACtat < 2:1473140/150‑1 (MQ=255) tacaaCACTTAAACGAAAATTCAGAAGATAAAGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGATGGATATAGAGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCAAATGATTACTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACtata > 1:1616415/4‑150 (MQ=255) ctctTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCTCCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCa > 2:122648/1‑150 (MQ=255) ctTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCatt > 2:843360/1‑150 (MQ=255) tAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCattat > 2:834563/1‑150 (MQ=255) tAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCattat > 2:90139/1‑150 (MQ=255) tAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCaa < 2:1310626/150‑1 (MQ=255) ttCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTTCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGc < 2:1935489/150‑1 (MQ=255) ttCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGc > 2:546177/1‑150 (MQ=255) tCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGAATCTTAAAACAGTTAAGCGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGct > 1:285195/1‑149 (MQ=255) cAGAAGATAATGGCTAAGAATTACAATCATTTGGTTAAATTTTCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGAACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATATTAAAACAGTTAAGATCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGt > 1:659801/1‑150 (MQ=255) agaagaTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGtt < 2:1694614/150‑1 (MQ=255) aagaTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATATCCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTag < 1:657828/150‑1 (MQ=255) agaTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTaga > 1:692309/1‑150 (MQ=255) taTAATTGATAAGCATTACAATCATTTGTTTAAATTTGATGGTTATAGGGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTagag < 2:1443081/149‑1 (MQ=255) taTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTagag < 2:245946/149‑1 (MQ=255) aTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAgaga < 1:1027912/150‑1 (MQ=255) tAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGaa < 2:1494438/150‑1 (MQ=255) aaTGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAAc < 2:1743486/150‑1 (MQ=255) tGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACaa > 2:1456174/1‑150 (MQ=255) tgCTAAGCATTTCAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑AACTATAACCAGCAACTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAAt < 2:722133/149‑1 (MQ=255) ggCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAAt > 1:1743668/1‑150 (MQ=255) ggCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAAt > 1:1087213/1‑150 (MQ=255) cTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGAGTTAGAGAACAATCt > 1:1107415/1‑150 (MQ=255) tAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTa < 1:1576026/150‑1 (MQ=255) aGCATTACAATCATTTGTTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACt < 2:1614602/150‑1 (MQ=255) cATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACttt < 2:1338287/150‑1 (MQ=255) aTTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTa > 1:1121582/1‑150 (MQ=255) aTTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTAATTTa > 2:114956/1‑150 (MQ=255) ttACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCATTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTAt < 1:542932/150‑1 (MQ=255) aCAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCa > 1:900377/1‑150 (MQ=255) cAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCaa > 2:1671259/1‑150 (MQ=255) cAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCaa > 2:151126/1‑150 (MQ=255) cAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCaa > 1:1304824/1‑150 (MQ=255) aTCATTTGGTTAAATTTGCTTGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCaaaa < 1:508771/150‑1 (MQ=255) aTTTGGTTAAATTTGCTTGTTATAGTTCAGTTAAC‑‑AACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTg < 1:22459/150‑1 (MQ=255) aTTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTg > 2:1790845/1‑150 (MQ=255) aTTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTg < 1:733163/150‑1 (MQ=255) tttGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGa < 1:823001/150‑1 (MQ=255) gTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTtaataa > 2:1738683/1‑150 (MQ=255) gTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATaa > 1:1669663/1‑150 (MQ=255) ataTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTATA‑‑CACTATAAGCAGCTCCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAATAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGATCAATCTACTTTATCAAAATTGAATaatga < 1:1092747/148‑4 (MQ=255) aaaTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGc < 1:596004/150‑1 (MQ=255) aaaTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGc < 2:36203/150‑1 (MQ=255) aaTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTAAATGCGTTAGAGAACAAAATACTTTATCAAAAATGAATAAggat > 2:950912/1‑148 (MQ=255) tttGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTAt > 1:1592322/1‑150 (MQ=255) gtGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTAtt > 1:1480721/2‑150 (MQ=39) gCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTc > 1:1240316/1‑150 (MQ=255) gCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTc > 1:955258/1‑150 (MQ=255) cTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCa > 1:933082/1‑150 (MQ=255) ttATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGAtt > 1:1174263/1‑150 (MQ=255) ataGTGCATGTAAC‑‑CACTATAACAAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCAGCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCTTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTAc < 2:659801/150‑1 (MQ=255) aGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACAAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACAt < 2:808211/150‑1 (MQ=255) gTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATc > 2:46154/1‑150 (MQ=255) gTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATc > 1:44504/1‑150 (MQ=255) gTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATc > 1:50669/1‑150 (MQ=255) gTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATc > 1:589340/1‑150 (MQ=255) cAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACt < 1:244504/150‑1 (MQ=255) cAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACt > 2:79729/1‑150 (MQ=255) aGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTg < 1:1531338/150‑1 (MQ=255) aGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTg > 2:123955/1‑150 (MQ=255) gTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGa > 1:457371/1‑150 (MQ=255) gTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGATAAGAGCATACTATAAATCAAAATTTTTCAAAGCGTTAGAGAACAATCTACTATAACAAATTTGAATTAGGAAAATACACTTTACATCAGTGa > 2:1878292/1‑150 (MQ=255) c‑‑cACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTcc < 2:1566388/150‑1 (MQ=255) c‑‑cACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATAATATTTCAAAGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGATATTAAAGATTACATAACTCAATTca > 1:1123851/1‑149 (MQ=255) | AATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCC > NC_000913/2991656‑2991954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |