New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
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catcatGCTCGGCGGTGAAGCCAATgagcatgatgacaaacgtttttccccggtgggtattgatatagggaaccgaatggcggaatccctcgcccaactcggttttacgtaactttaccacggcacacctctttgcatgattattcgaaa < 1:238743‑M2/150‑126 (MQ=255) tcatGCTCGGCGGTGAAGCCATTgagcatgatgacaaacgtttttccccggtgggtattgatatagggaaccgaatggcggaatccctcgaccaactcggttttacgttcctttaccacggcacacctctttgcatgattattcgaaatt < 1:1232083‑M2/150‑128 (MQ=255) catGCTCaatggcttcaccgccgagcaggatgacaaacgtttttccccggtgggtattgatatagggaaccgaatggcggaatcccacgaccacctcgcgtgtacggtactgtaccacggcaccccgcattgcatgattattcgaaatta > 1:321635‑M1/1‑7 (MQ=255) tGCTCGGCGGTGAAGCCAGTGAGCATGAGAATTTCTCCAGTATCGTTAATGATATCGGGTTGTTGCACAGCCTCGGCATCCGTCTGGTGGTGGTCTATGGCGCACGTCCGCAGATCGACGCAAATCTGGCTGCGCATCACCACGAACCGc < 2:1371435/150‑1 (MQ=255) gCTCaatggcttcaccgccgagcatgatgacaaacgtttttccccggtgggtattgatatagggaaccgaatggcggaatccctcgaccaactcggttttacgttcctttaccacggcacacctctttgcatgattattcgaaattagtg < 2:433910‑M1/150‑147 (MQ=255) cTCaatggcttcaccgccgagcatgatgacaaacgtttttccccggtgggtattgatatagggaaccgaatggcggaatccctcgaccaactcggttttacgttcctttaccccggcacgcctctttgcatgattattcgaaattagtgt > 2:1881306‑M1/1‑3 (MQ=255) cTCGGCGGTGAAGCCATTGAGCATGAGAATTTCTCCAGTATCGTTAATGATATCGGGTTGTTGCACAGCCTCGGCATCCGTCTGGTGGTGGTCTATGGCGCACGTCCGCAGATCGACGCAAATCTGGCTGCGCATCACCACGAACCGCTg < 2:1502941/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTGAAGCCATTGAGCATGAGAATTTCTCCAGTATCGTTAATGATATCGGGTTGTTGCACAGCCTCGGCATCCGTCTGGTGGTGGTCTATGGCGCAAGTCCGCAGATCGCCGCAAATCTGGCTGCGCATCACCACGAACCGCTg > 2:774458/1‑150 (MQ=255) cTCGGAGGTGAAGCCATTGAGCATGAGAATTTCTCCAGTATCGTTAATGATATCGGGTTGTTGCACAGCCGCGGCATCCGTCTGGTGGTTGTCTATGGCGCAAGTCCGCAGATCGACGCAAATCTGGCTGCGCATCACCACGAACCGCTg < 2:1301408/150‑1 (MQ=255) tCGGCGGTGAAGCCATTGAGCATGAGAATTTCTCCAGTTTCGTTAATGATATCGGGTTGTTGCACAGCCTCGGCATCCGTCTGGTGGTGGTCTATTGCGCACGTCCGCAGATCGACGCAAATCTGGCTGCGCATCACCACGAACCGCTGt < 1:1109066/150‑1 (MQ=255) caatggcttcaccgccgagcatgatgacaaacgtttttccccggtgggtattgatatagggaaccgaatggcggaatccctcgaccaactcggttttacgttcctttaccacggcacacctctttgcatgattattcgaaattagtgtat > 2:1861159‑M1/1‑1 (MQ=255) caatggcttcaccgccgagcatgatgacaaacgtttttccccggtgggtattgatatagggaaccgaatggcggaatccctcgaccaactcggttttacgttcctttaccacggcacacctctttgcatgattattcgaaattagtgtat > 1:1479549‑M1/1‑1 (MQ=255) | AAAAAACAGAATAAAAATACACTAATTTCGAATAATCATGCAAAGAGGTGTGCCGTGGTAAAGGAACGTAAAACCGAGTTGGTCGAGGGATTCCGCCATTCGGTTCCCTATATCAATACCCACCGGGGAAAAACGTTTGTCATCATGCTCGGCGGTGAAGCCATTGAGCATGAGAATTTCTCCAGTATCGTTAATGATATCGGGTTGTTGCACAGCCTCGGCATCCGTCTGGTGGTGGTCTATGGCGCACGTCCGCAGATCGACGCAAATCTGGCTGCGCATCACCACGAACCGCTGTA > NC_000913/2949188‑2949486 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |