| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1486986 = | 97 (0.820) | 5 (0.050) | 5/256 | NT | 5.3% | intergenic (+23/‑249) | hrpA/ydcF | putative ATP‑dependent helicase/DUF218 superfamily protein, SAM‑binding |
| ? | NC_000913 | 1487021 = | 88 (0.810) | intergenic (+58/‑214) | hrpA/ydcF | putative ATP‑dependent helicase/DUF218 superfamily protein, SAM‑binding | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACGATTTCCTCCTTT > NC_000913/1486872‑1487170 | tGCGCGTTTGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTtta > 1:401262/1‑150 (MQ=255)tGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTtta > 2:1469148/1‑150 (MQ=255)caagccttacatatcttttaaggaaatgctgtagataaacattattcatcttgcagcagagaattgtatttttctgaattcctgaatttttacccttaccgttttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTtta > 2:1168563‑M1/115‑150 (MQ=255) gcctgacatatcttttaaggaaatgctgtagataaacattattcatcttgcagcagagaattgtatttttctgaattcctgaatttttacccttaccgttttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTttatta > 2:1943757‑M1/112‑150 (MQ=255) cgTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTaa > 2:1006403/1‑150 (MQ=255) ttagttaCTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCCATTTCAGAAAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAAtt < 1:448670/150‑1 (MQ=255) agttaCTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCt > 2:805892/1‑150 (MQ=255) acatatattttaaggaaatgctgtagataaacattattcatctagcagcagagacttgtatttttctgaattcctgaatttttacccttaccgttttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCt > 1:1860878‑M1/107‑150 (MQ=255) gttaCTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTa > 1:1523981/1‑150 (MQ=255) catatcttttaaggaaatgctgtagataaacattattcatcttgcagcagagaattgtatttttctgaattcctgaatttttacccttaccgttttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTa > 2:1577822‑M1/106‑150 (MQ=255) gCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATACGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTACCCCTGCTAGTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCAGTTAGCGCCGTGTTTTTTATTAATTCTAAATCGGtt > 2:71728/1‑149 (MQ=255) tCAACAACTTTGTACGCCTTATGCTCTTTCCGATAAGCGTATTTTTCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTTATAAAGAAAAAACCCGGTAAGGATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAg < 1:283561/150‑1 (MQ=255) caacaaCTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAgg > 1:716652/1‑150 (MQ=255) caacaaCTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAgg < 1:1430471/150‑1 (MQ=255) caacTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTa > 2:1698438/1‑150 (MQ=255) aacTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTaa > 2:1662973/1‑150 (MQ=255) tGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCGTGATATAGAAAAATCCCGGTAAGCATTTAGCGCAGGGTTTTTTATTTATTCTAAAACGGTAAGGGTatatat > 1:106588/1‑145 (MQ=255) tGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTGATTCTAAAACTGTAAGGGTAAAAAt > 1:27951/1‑150 (MQ=255) 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tCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATa < 1:1252450/150‑1 (MQ=255) cAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGACTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCTCCGGGTTTTTTATTAATTCTATAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATAc < 1:1186263/150‑1 (MQ=255) cAGATAAGCGTATTTTGCAGGAGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATAc < 2:1289815/150‑1 (MQ=255) aGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTTGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCTGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACa > 2:888292/1‑150 (MQ=255) aaGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCAGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGCGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATtc > 2:1910405/1‑150 (MQ=255) aGCGTATTTTGCGGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGTGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATtct > 2:1170891/1‑150 (MQ=255) aGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTACGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTATAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAAttag > 2:1249021/1‑148 (MQ=255) ttATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctg < 1:463922/149‑1 (MQ=255) tATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctgc < 1:1396561/150‑1 (MQ=255) tATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctgc < 2:1788800/150‑1 (MQ=255) 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tttttATTAATTCTAAAACGGTAAGTGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACGATTtcct < 1:311810‑M2/145‑1 (MQ=255) ttttATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACGATTtcctc < 1:24783‑M2/146‑1 (MQ=255) ttttATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGAGGAGTGGCGGTTAAGGACATACGATTtcctc > 1:1346951‑M2/5‑150 (MQ=255) tttATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACGATTtcctcc > 2:227553‑M2/4‑150 (MQ=255) attaATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACGATTTCCTCCttt > 1:744626/1‑150 (MQ=255) attaATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACGATTTCCTCCttt > 2:1336215/1‑150 (MQ=255) attaATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCATTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGATAAGGACATACGATTTCCTCCttt > 2:953803/1‑150 (MQ=255) | TGCGCGTTAGTTACTTCGCTCAACAACTTGGTACGCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACGATTTCCTCCTTT > NC_000913/1486872‑1487170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |