New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3621534 | NA (NA) | 5 (0.050) | 4/262 | NT | 100% | coding (2343/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | = 3621592 | 0 (0.000) | coding (2401/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
CCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGG‑CAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAG > NC_000913/3621443‑3621740 | ccGGTGAGCGTCAGAAGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGTGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGG‑CAGCGGTT < 2:1336075‑M2/150‑1 (MQ=255) cTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGG‑CAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgct < 1:835321‑M2/150‑87 (MQ=255) cGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGG‑CAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcacc < 2:1018675‑M2/150‑91 (MQ=255) cGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGG‑CAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtatggtctcatgctgccataacagtgattccttctgcgggtgatacacagtctgacgctcacc < 2:1293001‑M2/150‑91 (MQ=255) gAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGG‑CAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccg < 2:1209510‑M2/150‑92 (MQ=255) gCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCGGTATACAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctccccggtca < 2:1238853‑M2/150‑96 (MQ=255) atcccgcggggcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgc > 2:255701‑M2/6‑11 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgtgtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgccct < 2:1781265‑M2/150‑143 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgccct < 1:315543‑M2/150‑143 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgccct < 2:1444197‑M2/150‑143 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccg < 1:335541‑M2/150‑143 (MQ=255) aGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgccctt > 2:774392‑M2/1‑7 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccccccggtgcccttc < 2:141237‑M2/150‑145 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttc < 2:959112‑M2/150‑145 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttcagtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctatctcatcatacctgtaatgcaccgccaaccgctgcccttc < 2:1424129‑M2/150‑145 (MQ=255) gCGGATcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttc < 1:1053553‑M2/150‑145 (MQ=255) ccgGGTcgccagcccctgcgcggtgtacgcatgtctgggctcatgctgccagagcagtgcggccgtctgcgggtgaggcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttc > 2:320046‑M2/2‑6 (MQ=255) ggTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgc < 2:32990‑M2/150‑147 (MQ=255) gTTcgcgagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgct < 2:300326‑M2/150‑148 (MQ=255) gTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgct > 2:1992816‑M2/1‑3 (MQ=255) gTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgct > 1:365654‑M2/1‑3 (MQ=255) gTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgct > 2:462238‑M2/1‑3 (MQ=255) ttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctg > 2:999967‑M2/1‑2 (MQ=255) ttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctg > 1:1347297‑M2/1‑2 (MQ=255) ttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatggctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctg > 2:1384597‑M2/1‑2 (MQ=255) | CCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGG‑CAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAG > NC_000913/3621443‑3621740 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |