| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4344813 = | NA (NA) | 4 (0.040) | 3/260 | NT | NA | intergenic (+23/+116) | melB/yjdF | melibiose:sodium symporter/DUF2238 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 4344842 = | NA (NA) | noncoding (28/95 nt) | RIP327 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP327 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAAGCGAGCGAGGAATAT > NC_000913/4344693‑4344988 | ggATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 1:1846198/1‑150 (MQ=255)ggATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 2:613667/1‑150 (MQ=255)ggATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 2:621978/1‑150 (MQ=255)ggATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGAGATGTTTATCAGGCCAc > 1:1916729/1‑150 (MQ=255)ggATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGATCATGCTGATAATCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 1:1346101/1‑150 (MQ=255) agctacgtcgcgttggcttgataaccggataacaacttgcgatttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAAGCCACg > 1:939602‑M1/120‑150 (MQ=255) atccagatccaTCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGAAGCGATATGTTTATCAGGCCACGt > 2:44291/1‑150 (MQ=255) cagatccaTCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACAGCCCGAGCCTGTTCATGCAGATATTACGGTCGGTGCAGTGAGTGATGAGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGACCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCCcttctt > 1:1002804/1‑150 (MQ=255) agatccaTCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTta > 2:1988933/1‑150 (MQ=255) gatccaTCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaa > 2:631037/1‑150 (MQ=255) tccaTCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCTTGCTGATATTCCGGGCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTTGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatg < 2:1884394/150‑1 (MQ=255) ctgctgGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgtaatg > 1:1041312/1‑150 (MQ=255) ctgctgGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgtaatg > 2:1095123/1‑150 (MQ=255) 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atCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCa > 2:763561/1‑150 (MQ=255) tCGCAAAGTACCGCCCGAGGCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAATGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCaa < 2:1955881/150‑1 (MQ=255) gCAAAGTACCGCCCGAGCGTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGAAATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAAt > 1:1529733/1‑150 (MQ=255) aggaCCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTg < 1:564922/147‑1 (MQ=255) gTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGTACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCATGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGt > 2:90074/1‑150 (MQ=255) tACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTa < 2:1838795/150‑1 (MQ=255) tACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTa > 1:931314/1‑150 (MQ=255) aCCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAg > 2:760149/1‑150 (MQ=255) aCCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAg < 1:302165/150‑1 (MQ=255) aCCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAg < 1:713873/150‑1 (MQ=255) 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aaaaTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAg < 2:1857594/150‑1 (MQ=255) cgtggcttgataaacatatcgcatcaggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAATCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAACGCGACGTAGCt > 1:939602‑M2/32‑150 (MQ=255) TGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTgg > 1:949653‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTggc < 1:448550‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTggcgg > 1:1421502‑M1/1‑150 (MQ=255) CCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTggcgg > 2:79096‑M1/1‑150 (MQ=255) CCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTggcgg < 2:1014159‑M1/150‑1 (MQ=255) CTGATGCGATATTGTTATCAGGCCAAGTCATAATGAAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGCAATTCAAGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTggcggc > 2:288070‑M1/1‑150 (MQ=255) TGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCa > 2:1305858‑M1/1‑150 (MQ=255) GATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCaa > 1:1988933‑M1/1‑150 (MQ=255) TGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATTCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATg > 2:167301‑M1/1‑150 (MQ=255) gCGATATGTTTATCAGGCCATGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGa < 1:90074/150‑1 (MQ=255) gCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACTAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAACGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGa > 1:333281/1‑150 (MQ=255) atatGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAag < 1:1668663/150‑1 (MQ=255) atatGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCGTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAag < 2:1512479/150‑1 (MQ=255) atGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAagcg < 1:44291/150‑1 (MQ=255) tttATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAagcgagc < 1:436092/150‑1 (MQ=255) tttATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAagcgagc < 1:1187422/150‑1 (MQ=255) ttATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAagcgagcg < 1:1938888/150‑1 (MQ=255) ggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAAGCGAGCGAGGAat > 1:549958‑M2/6‑150 (MQ=255) ggccaCGTATTAATGTAATGCTTTGGTTTTGCAATTTTTTTAGTCCGTATAAGGAATTCTCGAGGCATCCGGAATCAACAAATCGCAAGTTGTTTTCCGGTTATCATGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAAGCGAGCGAGGAat < 2:1002804‑M2/145‑1 (MQ=255) ccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAAGCGAGCGAGGAatat > 1:902353‑M2/4‑150 (MQ=255) | GGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATCAAGCCAAAGCGCCGTAGCTGGCGGCAATGAAAGCGAGCGAGGAATAT > NC_000913/4344693‑4344988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |