| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 998,450 | T→C | 5.9% | intergenic (+43/‑40) | elfA → / → elfD | laminin‑binding fimbrin subunit/putative periplasmic pilin chaperone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 998,450 | 0 | T | C | 5.9% | 452.1 / 12.1 | 154 | intergenic (+43/‑40) | elfA/elfD | laminin‑binding fimbrin subunit/putative periplasmic pilin chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (67/77); new base C (3/6); total (70/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.47e-01 | |||||||||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
ATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAG > NC_000913/998304‑998595 | aTGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCt < 1:212312/150‑1 (MQ=255) tGGAGATCATACGTTGAGTTTTAAATTTGATTATATCGCTACGGTGAAAGGGACATCAGGTAATGTGAATGCGGAAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTATTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTg < 2:359141/150‑1 (MQ=255) tGGAGATCAGACGTTTACTTTTAAAGTTTATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCAAATGTTCTg > 2:1165447/1‑150 (MQ=255) tGGAGAGCAGACGTTGAATTATAAAGTTCCTTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGCTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATAAACTATTAATATTTGTACTCATTAATTGTTTTATTTATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTg < 2:1222593/150‑1 (MQ=255) ggAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACACCTCCAGTGTTCTgg > 2:1093054/1‑150 (MQ=255) gaTCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCTGTAACAAATTTCCATATTAACTTTTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAgg < 1:1093925/150‑1 (MQ=255) gaTCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAgg < 1:1936678/150‑1 (MQ=255) gaTCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAgg < 2:1613019/150‑1 (MQ=255) aTCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAggg < 2:477055/150‑1 (MQ=255) aTCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAggg < 1:1701829/150‑1 (MQ=255) tCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAgggg < 1:1419834/150‑1 (MQ=255) tCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAgggg < 1:667441/150‑1 (MQ=255) tCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAgggg < 1:1788623/150‑1 (MQ=255) tCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATAGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGCAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAgggg < 2:1767992/150‑1 (MQ=255) cAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTTACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGa > 2:659806/1‑150 (MQ=255) gACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTATTGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTAATAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGata < 2:245149/150‑1 (MQ=255) ttGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCa < 2:1819060/150‑1 (MQ=255) tGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCat > 1:1888795/1‑150 (MQ=255) tGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTACAGTGTTATGGAGGGGATATTCat > 1:67808/1‑150 (MQ=255) cTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGTGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACACCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATAtt > 1:438816/1‑150 (MQ=255) ttttAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCTGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATAttt < 2:765401/150‑1 (MQ=255) tttAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATAtttt < 2:705586/150‑1 (MQ=255) tAAAGTTGATTATATCGCTACTGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTTAATGCTGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCACTCCAGTTTTCTGGAGTGGATATTCATAtttttt < 2:1467899/150‑1 (MQ=255) aaGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTaa < 2:1164424/150‑1 (MQ=255) aGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATCGGAATGCGGTAACAAAATTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAag < 2:395490/150‑1 (MQ=255) aGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACATCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAAATTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAag < 1:365799/150‑1 (MQ=255) gTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAaga > 2:435841/1‑150 (MQ=255) ttGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAagag < 1:703952/150‑1 (MQ=255) tatCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTAt > 2:939320/1‑150 (MQ=255) tatCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGCGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTAt > 2:1248556/1‑150 (MQ=255) gCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTCACTATTTAt > 2:1499391/1‑150 (MQ=255) gAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTTTTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACtt > 2:929403/1‑150 (MQ=255) aaaGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTg > 2:656722/1‑150 (MQ=255) aaGCGACTTCAGGTAATGTGAAAGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGATTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGc < 2:922970/150‑1 (MQ=255) aGCGACTTCAGGTAATGTTAATTCTGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCTAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCa < 1:167136/150‑1 (MQ=255) aGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCa > 2:1306804/1‑150 (MQ=255) aGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCAAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGAATATTTATGAAAACTTgaa > 1:1426927/1‑148 (MQ=255) aCTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTTTTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAAc < 2:1952766/150‑1 (MQ=255) cTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACa < 1:1789488/150‑1 (MQ=255) tCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACaaa > 1:904783/1‑150 (MQ=255) cAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTAATATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAg < 2:13949/150‑1 (MQ=255) aGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTGGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAgg < 1:941420/150‑1 (MQ=255) aGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAgg < 1:348381/150‑1 (MQ=255) aGGTAATGTGAATGAGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTATGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAgg < 1:106316/150‑1 (MQ=255) ggTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAggg > 1:69262/1‑150 (MQ=255) ggTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAggg > 1:790089/1‑150 (MQ=255) ggTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAggg > 2:1551068/1‑150 (MQ=255) ggTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAggg > 1:98681/1‑150 (MQ=255) gAATTCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGa < 2:459017/150‑1 (MQ=255) attctgTAACAAATTTCAATAATAACAATTATAAATAGAACTCATTAATTGTTTTATAAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGAcc < 1:1863306/145‑1 (MQ=255) tGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCg > 1:1994217/1‑150 (MQ=255) cGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTa > 1:1473444/1‑150 (MQ=255) cAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCAt > 1:1228777/1‑122 (MQ=255) cAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCAt < 2:1228777/122‑1 (MQ=255) cAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa > 1:480375/1‑150 (MQ=255) cAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa > 2:1029801/1‑150 (MQ=255) aaTTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGGTTAAc < 1:1383257/150‑1 (MQ=255) tttCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACgg < 2:1000565/150‑1 (MQ=255) tacATATTAACTATTATTAATATAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCa < 1:1752472/148‑1 (MQ=255) tatTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTATGCAGGGGATATTCATTTTTTTTAAGATTTACTATTTATGAAAACTTGAATAACAAAGGGAATTGTTACCGTAAGTTTAAAGGCAatat > 1:1078916/1‑150 (MQ=255) atTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACACCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGATTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATAtt > 1:375384/1‑150 (MQ=255) ttAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTa > 1:874596/1‑150 (MQ=255) tAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTACGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTAc < 2:194698/150‑1 (MQ=255) aaCTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTAca > 1:195726/1‑149 (MQ=255) aCTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTc < 1:1742410/150‑1 (MQ=255) cTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCa < 2:1408934/150‑1 (MQ=255) tattatTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTTACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAAAGGCAATATTAATCAg > 1:1089997/1‑150 (MQ=255) tattaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAgctg > 2:22092/1‑150 (MQ=255) attaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAgctgc > 1:74253/1‑150 (MQ=255) gAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCg > 2:483416/1‑150 (MQ=255) gAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCg > 1:1982502/1‑150 (MQ=255) cTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCAt > 2:1316988/1‑150 (MQ=255) cATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAAATTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGATCAACCGCATgg > 2:341461/1‑150 (MQ=255) tAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGggcg < 2:1994217/150‑1 (MQ=255) tAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGggcg > 1:398519/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTTATTAATTAGTACCCGTCGAGTGTGCTGGAGGGGATATTCATATTTTATAAGAGTGCCTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTACGTTTCACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGggcggc < 2:302746/150‑1 (MQ=255) ttGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCa < 1:795177/150‑1 (MQ=255) gTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAgg > 1:658773/1‑150 (MQ=255) gTTTAATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACATCCATAACAAACGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAgg < 2:106792/150‑1 (MQ=255) ttttATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGt > 1:31447/1‑150 (MQ=255) tttATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACCAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTa < 1:300308/150‑1 (MQ=255) ttattaATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTaa > 2:1094893/1‑150 (MQ=255) ttattaATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTaa > 1:481083/1‑150 (MQ=255) attaatttGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAg > 1:569139/1‑150 (MQ=255) taattaGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATTTTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGc > 2:84456/1‑150 (MQ=255) aGTACCCCTCCAGGGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGAt < 1:1491178/150‑1 (MQ=255) ttACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGAtt < 1:251358/149‑1 (MQ=255) tatccccTCCAGAACACTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGAtt > 2:1559071/4‑150 (MQ=255) gTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGATTTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGAtt > 1:1257731/1‑150 (MQ=255) gTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGAtt > 2:340877/1‑150 (MQ=255) aCCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTgg < 1:1729108/150‑1 (MQ=255) aCCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGAGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTgg < 2:978307/150‑1 (MQ=255) ccccTCCAGAACACTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGa > 2:36828/1‑150 (MQ=255) ccccTCCAGAACACTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGa > 2:824486/1‑150 (MQ=255) cccTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCAGAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGAc > 1:441280/1‑150 (MQ=255) ccTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACt > 2:23313/1‑150 (MQ=255) ccTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGAACGTAAGTTTAACGGAAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGAAGTTAAAGGCGGGATTCGACt > 1:1245378/1‑150 (MQ=255) cTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACtt > 1:436120/1‑150 (MQ=255) ccAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTgc > 2:1797837/1‑150 (MQ=255) aGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTATTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTTTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTgcag < 2:91595/150‑1 (MQ=255) | ATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAG > NC_000913/998304‑998595 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |