| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,488,063 | 0 | T | C | 7.5% | 386.3 / 16.9 | 133 | intergenic (+28/‑169) | ydcF/aldA | DUF218 superfamily protein, SAM‑binding/aldehyde dehydrogenase A, NAD‑linked |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (58/65); new base C (5/5); total (63/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TCCCCGCGGGCGAGATTTTATCGTTCACGTTGATTTTCCGGCAGAAGTCATCCATGCATGGCAAACGCTGAAACATGATGCGGTGCTCATCGAGGCGATGGAAAGTCGCTCGTTACGTTAAAAATTGCCCGTTTGTGAACCACTTGTTTGCAAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACGATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATA > NC_000913/1487915‑1488212 | gccccGCGGGCGAGATTTTATCGTTCACCTTGATTTTCCGGCAGAAGTCATCCATGCATGGCAAACGCGGAAACCAGATCCGGTGCTCATCGAGGCGATGGAAAGTCGCTCGTAACGTTAAAAATTGCCCGTATGTGAACCACTTGtttt < 2:103077/149‑2 (MQ=255)gacccGAGGGCGAGATTTTATCGTTCACGTTGATTATCCGGCAGAAGTCATCCATGCATGGCAAACGCTGAAACATGATGCGGTGCTCATCGAGGCGATGGAAAGTCGCTCGTTACGTTAAAAATTGCCCGTTTGTGAACCACTTGTTTg < 1:175786/148‑1 (MQ=255) ggCGAGATTTTATCGTTCACGTTGATTTTCCGGCAGAAGTCATCCATGCATGGCAAACGCTGAAACATGATGCGGTGCTCATCGAGGCGATGGAAAGTCGCTCGTTACGTTAAAAATTGCCCGTTTGTGAACCACTTGTTTGCAAACggg < 1:951014/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |