| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,825,939 | 0 | T | A | 5.7% | 308.1 / 7.1 | 106 | intergenic (‑314/+16) | spy/astE | periplasmic ATP‑independent protein refolding chaperone, stress‑induced/succinylglutamate desuccinylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/47); new base A (2/4); total (55/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.25e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ATGGAGAGTGATGAGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAACGCTACCAACGGATTAGGGAATAACACATACTCTACATCATGGGTTACGGTAAAACGTTCCTCTCCGTCCTGCGCCAGCAATGTTCCTTTCT > NC_000913/1825793‑1826088 | aTGGAGAGTGATGAGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTc < 2:991480/150‑1 (MQ=255) agagTGTTGAGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGACCTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCg < 2:1093612/150‑1 (MQ=255) agagTGATGAGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCg < 1:49212/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |