Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | NC_000913 | 1,888,032 | 0 | T | A | 5.4% | 399.5 / 6.7 | 135 | intergenic (‑41/+29) | rnd/fadD | ribonuclease D/acyl‑CoA synthetase (long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (68/59); new base A (4/4); total (72/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCATCGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTTCTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAACCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGTATCC > NC_000913/1887885‑1888180 | gTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCATCGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTTCTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTaa > 2:1838532/1‑150 (MQ=255) ggcgcGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTCTCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTGCACACAAAGAAGCCAGCGCATCGTCCGGGGGAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTTCTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAAc < 1:1215531/149‑1 (MQ=255) gcgcGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCATCGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTTCTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAAcc > 2:1349277/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |