| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,199,608 | A→T | 8.3% | pseudogene (287/948 nt) | yehH → | DUF4132 family pseudogene; defective yehI paralog; molybdate metabolism regulator, first fragment; molybdate metabolism regulator, second fragment 2; yehI' molR mutations have phenotypes and the N‑terminal molR fragment of yehI' may be expressed and may have retained or evolved MolR function |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,199,608 | 0 | A | T | 8.3% | 234.4 / 9.7 | 93 | pseudogene (287/948 nt) | yehH | DUF4132 family pseudogene; defective yehI paralog; molybdate metabolism regulator, first fragment; molybdate metabolism regulator, second fragment 2; yehI' molR mutations have phenotypes and the N‑terminal molR fragment of yehI' may be expressed and may have retained or evolved MolR function |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/42); new base T (2/6); total (45/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.71e-01 | |||||||||||
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tGCGCCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCa < 1:1858687/150‑1 (MQ=255) ccgccgcTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCAc > 1:563864/1‑150 (MQ=255) cgccgcTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCAcc > 2:1161188/1‑150 (MQ=255) cgcTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCt > 2:626354/1‑150 (MQ=255) aggaagagCTGGAAGTTTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCTg > 2:649832/8‑150 (MQ=255) tGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCTGAc < 1:658897/150‑1 (MQ=255) ggTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCAAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCTGACg < 1:139549/150‑1 (MQ=255) agagCTGGAAGTTTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCTGACga > 2:1680220/4‑150 (MQ=255) cGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCTGACgatg < 1:707493/150‑1 (MQ=255) cTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCTGCCgatgat > 2:386562/1‑150 (MQ=255) aaaaCTTCCCGCGCTGCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTAGTCACTTCACCCGCCGTCTGATTGTGGGAGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGTCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGTTAACAGCTCCAGCACCGCTGACGATGATCttt < 1:329307/150‑1 (MQ=255) aaaaCTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCAGAAAACCACCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCTGACGATGATCttt > 1:809694/1‑150 (MQ=255) aaaaCTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGGCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCTGACGATGATCttt < 1:214491/150‑1 (MQ=255) aaaCTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTCGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCAACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACCGCTACAGCACTGCTGACGATCATCtatt > 1:1771830/1‑150 (MQ=255) aaCTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCTGACGATGATCTTTTc < 2:1535844/150‑1 (MQ=255) aCTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCTGACGATGATCTTTTCa < 2:192267/150‑1 (MQ=255) | AAACCGAACAAAAGCGATGATGAAACGCGGGCGAACGATGCGGTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCGCCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGCGCCGAAAACCAGCTACTGGCTTGCTTTCGCGTAGCAGAAGATAACAGCTCCAGCACCGCTGACGATGATCTTTTCA > NC_000913/2199460‑2199757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |