| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,266,052 | 0 | C | T | 5.7% | 495.2 / 10.2 | 158 | intergenic (+30/‑193) | yeiP/yeiQ | elongation factor P‑like protein/putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (71/77); new base T (5/4); total (76/82) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
GTAACAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAAC > NC_000913/2265904‑2266199 | gTAACAAACCGGCGACATTGAGCACTGGGCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCa < 1:1138434/150‑1 (MQ=255) gCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCATAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAAATCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCTTGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCtt < 2:1605618/150‑1 (MQ=255) cGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCttt < 2:1984844/150‑1 (MQ=255) 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tAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCatat < 1:1738391/150‑1 (MQ=255) gCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCGTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATaa > 2:891933/1‑150 (MQ=255) | GTAACAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAAC > NC_000913/2265904‑2266199 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |