| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,266,058 | G→A | 5.0% | intergenic (+36/‑187) | yeiP → / → yeiQ | elongation factor P‑like protein/putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,266,058 | 0 | G | A | 5.0% | 521.9 / 9.1 | 159 | intergenic (+36/‑187) | yeiP/yeiQ | elongation factor P‑like protein/putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (71/80); new base A (5/3); total (76/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
CGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACAC > NC_000913/2265913‑2266206 | cGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCGTGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTccc > 1:8710/1‑150 (MQ=255) gCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCATAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAAATCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCTTGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCtt < 2:1605618/150‑1 (MQ=255) cGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGACAGCCTGAGCTATCCCttt < 2:1027239/150‑1 (MQ=255) 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taaaaaaGGGACAGCCTGAGCTATCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCTATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAAt > 2:161490/4‑150 (MQ=255) cAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAAt > 2:206274/1‑150 (MQ=255) cAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAAt < 2:1243509/150‑1 (MQ=255) gAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTAGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGAATGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAAttt > 2:1560065/1‑149 (MQ=255) gggATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTc < 2:1164946/150‑1 (MQ=255) 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aGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACttt < 2:1887396/150‑1 (MQ=255) tGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTacac < 1:1534204/150‑1 (MQ=255) | CGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACAC > NC_000913/2265913‑2266206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |