| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,290,450 | C→T | 5.4% | intergenic (‑270/‑50) | yejO ← / → narP | pseudogene, autotransporter outer membrane homology;putative transport; Not classified; putative ATP‑binding component of a transport system/response regulator in two‑component regulatory system with NarQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,290,450 | 0 | C | T | 5.4% | 446.2 / 9.7 | 148 | intergenic (‑270/‑50) | yejO/narP | pseudogene, autotransporter outer membrane homology;putative transport; Not classified; putative ATP‑binding component of a transport system/response regulator in two‑component regulatory system with NarQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (71/68); new base T (3/5); total (75/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
TGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGAGCTTGATCCTGGCTCTGAA > NC_000913/2290301‑2290598 | tgattTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGAGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTAcc < 1:268124/150‑1 (MQ=255) attTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATTAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCaa < 1:278802/150‑1 (MQ=255) ttttAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgc < 2:14354/150‑1 (MQ=255) ttAGTTTTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgcta < 2:798216/150‑1 (MQ=255) gttgatTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAAATCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTATCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTGGTAacgctacca < 1:1573196/150‑3 (MQ=255) ttgttTTTCTTGATGAGAATCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTGGTAacgctaccag < 2:1357214/150‑4 (MQ=255) tgttTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCGGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTACCGTTACCAACGCTACGCTc > 2:1637424/1‑150 (MQ=255) tgttTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTGGTAacgctaccagg < 1:1759071/150‑5 (MQ=255) tgttTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTc > 2:1592117/1‑150 (MQ=255) tgttTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTc > 1:935277/1‑150 (MQ=255) gttTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCa < 1:553452/150‑1 (MQ=255) gttTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCAAAAGCGAACGACAGGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAAAGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCa > 1:422678/1‑150 (MQ=255) tttttCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCaa > 1:1726789/1‑150 (MQ=255) tttttCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATACCGTCTTTAAAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTGGTAacgctaccaggcg < 2:771395/150‑7 (MQ=255) tttCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACCCTACGCTCAAAc > 1:873431/1‑150 (MQ=255) ttacTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAAc < 1:1018613/147‑1 (MQ=255) ttGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATaa > 1:1134011/1‑150 (MQ=255) ttGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATaa > 1:1909629/1‑150 (MQ=255) tgatgaGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATAAACGATCCTGTTAGCGTTCCCAACGCTACGCTCAAACATAAt > 2:308560/1‑150 (MQ=255) tgaGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGAt > 1:340269/1‑150 (MQ=255) gaAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCt < 2:1810252/150‑1 (MQ=255) aaGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCta < 2:484331/150‑1 (MQ=255) aaGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCta < 2:163840/150‑1 (MQ=255) tGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGACTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCtaataa > 1:1372202/1‑150 (MQ=255) aTGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATaaaa > 1:239282/1‑150 (MQ=255) aTGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATaaaa > 1:210091/1‑150 (MQ=255) cAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCt > 1:2016334/1‑150 (MQ=255) cAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCt > 2:702610/1‑150 (MQ=255) cAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCt > 2:623190/1‑150 (MQ=255) cAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACAAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAAccg > 2:695469/1‑149 (MQ=255) aTTCCGTCTTTATAATGGAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAgg < 2:302720/150‑1 (MQ=255) tCCGTCTTTATAATGAAAATTATGCAAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACTCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGgag < 1:101952/150‑1 (MQ=255) ttttATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGTTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGactac < 1:1761228/149‑1 (MQ=255) cTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGactac < 1:1129376/150‑1 (MQ=255) tttATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGactact > 1:242051/1‑150 (MQ=255) aatataATGAAAATGATGCCAACGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTAACCAACGCAACTCACAAACATAAACATTCTAATAAAACCTAAGGAGactact > 2:1875309/3‑150 (MQ=255) ataATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATg < 2:1903994/150‑1 (MQ=255) aaTGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGcc > 2:1921042/1‑150 (MQ=255) tGAAAATGATGCAAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGTGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTg < 2:376513/150‑1 (MQ=255) gAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTTTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTATCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACATCAGGATACAACTATGCCTGa > 1:380724/1‑150 (MQ=255) gAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGa > 2:22509/1‑150 (MQ=255) gAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGa > 2:1661012/1‑150 (MQ=255) aaaaTGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGaa < 2:629410/150‑1 (MQ=255) aaaTGATGCCAAAGCTAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAg < 1:143054/150‑1 (MQ=255) aaaTGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAg < 2:1427484/150‑1 (MQ=255) aaaTGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAg < 2:1151161/150‑1 (MQ=255) aaTGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGc < 2:404734/150‑1 (MQ=255) aaTGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTAAAATGCCTGAAGc > 1:1350757/1‑150 (MQ=255) tgatgCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAACCCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCaa > 2:1133576/1‑150 (MQ=255) tgatgCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCaa < 2:749489/150‑1 (MQ=255) tgatgCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTAAGATCAAACATAATTATGCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCac > 2:114624/1‑149 (MQ=255) gatgCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAac < 2:1749771/150‑1 (MQ=255) gatgCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAac < 2:1081911/150‑1 (MQ=255) atgCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAaca < 1:1404043/150‑1 (MQ=255) tgCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAacac > 1:381849/1‑150 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCt > 1:1708718/1‑150 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCt < 1:817327/150‑1 (MQ=255) gCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCa < 1:864757/150‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGtg < 1:1646493/150‑1 (MQ=255) aCGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATTGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGtg < 1:335148/150‑1 (MQ=255) cGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGtga > 1:1690353/1‑150 (MQ=255) gACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGtgat < 2:1503155/150‑1 (MQ=255) aCAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGCAGCAACACCTTTTCAGGtgatg > 2:1295129/1‑150 (MQ=255) cAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCAATACATAAAATGGGGTAAAATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCATGAAGCAACAACTTTTCAGGtgatga > 2:1133602/1‑150 (MQ=255) aaGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCGTTTCAGGTgatgat > 1:524318/1‑150 (MQ=255) gTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAATATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATtgt < 2:792230/150‑1 (MQ=255) gTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGga > 2:855020/1‑150 (MQ=255) ttttCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGgatgat < 1:650354/150‑1 (MQ=255) ttttCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGgatgat < 1:264566/150‑1 (MQ=255) ttttCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGgatgat < 2:1068129/150‑1 (MQ=255) tttCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGatc > 1:808263/1‑150 (MQ=255) tCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTAAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACATTTTCAGGTCATGATTGTGGATGatcat > 2:1239383/1‑150 (MQ=255) tACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAGCACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCAc < 1:350169/150‑1 (MQ=255) tGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTAt < 2:1581849/150‑1 (MQ=255) gTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATg > 1:1569262/1‑150 (MQ=255) tCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGc > 1:993917/1‑150 (MQ=255) tacataAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGAcg > 1:1929425/1‑150 (MQ=255) acataAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGAcgc < 1:1442987/150‑1 (MQ=255) acataAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGATACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTAAGGTGATGATTGTGGAAGATCATCCACTTATTCGAcgc > 2:427330/1‑150 (MQ=255) cataAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGAcgcg > 1:921022/1‑150 (MQ=255) ataAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCgg < 1:730001/150‑1 (MQ=255) ataAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCgg < 1:325766/150‑1 (MQ=255) aaaTGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGgtgt < 2:822716/150‑1 (MQ=255) tGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCg < 1:952563/150‑1 (MQ=255) gggggGAACATTCACGCGCCTGTTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTATCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCg < 2:328553/149‑1 (MQ=255) gggTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTc < 1:1746873/150‑1 (MQ=255) ggTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTAC‑ATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAg < 2:391676/150‑1 (MQ=255) gTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAg < 1:1351967/150‑1 (MQ=255) aCATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTa < 2:2000160/150‑1 (MQ=255) cACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGa > 1:278745/1‑150 (MQ=255) tgagcgTAGCGTTGGTAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGAGCCTg > 2:612474/6‑150 (MQ=255) ccTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGATGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGAGCTTGa < 2:242051/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGAGCTTGAt > 1:1626341/1‑150 (MQ=255) gcgTAGCGTTGGTAATGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGAGCTTGATc > 2:1550816/3‑150 (MQ=255) ggTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGAGCTTGATcc > 2:1346651/1‑150 (MQ=255) ggTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGAGCTTGATcc < 2:1532359/150‑1 (MQ=255) cgTAGCGTTGGTAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGAGCTTGATcc > 1:604303/2‑150 (MQ=255) tAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGAGCTTGATCCTg < 2:523136/150‑1 (MQ=255) gCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGAGCTTGATCCTGGc < 2:1562784/150‑1 (MQ=255) cGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGGTCGTCAGTTACTGGAGCTTGATCCTGGct > 2:1784142/1‑150 (MQ=255) | TGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCAAACATAATGATTCTAATAAAACCTCAGGAGACTACTATGCCTGAAGCAACACCTTTTCAGGTGATGATTGTGGATGATCATCCACTTATGCGACGCGGTGTTCGTCAGTTACTGGAGCTTGATCCTGGCTCTGAA > NC_000913/2290301‑2290598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |