| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,931,836 | T→G | 6.0% | intergenic (+26/+29) | ygdG → / ← fucO | Ssb‑binding protein, misidentified as ExoIX/L‑1,2‑propanediol oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,931,836 | 0 | T | G | 6.0% | 247.8 / 3.2 | 99 | intergenic (+26/+29) | ygdG/fucO | Ssb‑binding protein, misidentified as ExoIX/L‑1,2‑propanediol oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/45); new base G (3/4); total (50/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CGAAAAGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCTTGCGTA > NC_000913/2931687‑2931983 | cGAAAAGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAAcgt > 1:247997/1‑150 (MQ=255) aaaGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAAcgtcgt < 1:122540/150‑1 (MQ=255) aGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTACCGGCGCGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTAt > 2:77766/1‑150 (MQ=255) cgcAAAAATTTAGAAACCCATACAGAGCTGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGACGTTTGCGGCGTATCCGGc < 1:693303/150‑1 (MQ=255) cgcAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGc < 2:247997/150‑1 (MQ=255) cgcAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGACGTTTGCGGCGTATCCGGc < 1:474480/150‑1 (MQ=255) cgcAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGGTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGACGTTTGCGGCGTATCCGGc < 1:147234/150‑1 (MQ=255) aGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGATAAGCCGCAAAAGTCGTATCCGGGCTTAT‑AACATc > 2:1796281/1‑150 (MQ=255) tataCCGATAAAGAGATGGAGTTTCTGTGCCGCGATATTGGCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCATACGTCGTATCCGGCTTTAT‑CACATCa < 1:928686/147‑1 (MQ=255) gAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACCTcc > 2:1423853/1‑149 (MQ=255) gAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCa > 1:1069935/1‑150 (MQ=255) gAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACACCa < 2:693836/150‑1 (MQ=255) aaCCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTTTACGGCATTTT‑GCCATCAgc > 2:641494/1‑150 (MQ=255) aaCCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAgc > 1:1183580/1‑150 (MQ=255) cccATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACTTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAgcgc > 1:1296731/1‑150 (MQ=255) cccATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAgcgc > 2:1033391/1‑150 (MQ=255) cccATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTACCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTTGTATCCGGCATTAT‑CACATCAgcgc > 1:1360367/1‑150 (MQ=255) ccATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGCTAAGCCGCCAACCTCGTATGCGGCGTTTT‑GACGACAgcgcc > 2:1856502/1‑149 (MQ=255) cATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑At > 2:1106787/1‑150 (MQ=255) aTAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCCAACCGCGTGTCGGGGCGTTT‑CACATCACCGC‑Ctt > 1:690189/1‑150 (MQ=255) tAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGCGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTCTGCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑Attt > 1:91606/1‑150 (MQ=255) tAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑Attt < 1:706717/150‑1 (MQ=255) aaaGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGACGGATACGCCGCAATAGTCGTATCCGGCATTAT‑GACATAAGCGC‑ATTTa > 1:217402/1‑150 (MQ=255) aaGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATACCGCATTAT‑CACAACAGCGC‑ATTTAc > 1:143997/1‑150 (MQ=255) aaGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTCCCCGCTTACAAACCGA‑TTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTAcc < 1:1574801/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCgg < 1:476427/150‑1 (MQ=255) gCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGTTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGt < 1:1531925/150‑1 (MQ=255) cGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTa < 1:664695/150‑1 (MQ=255) cGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGCATAAACCCCAAACGTCGTATACGGCCTTAT‑AACATAAGCGC‑ATTTACCAGGCCGTa > 2:2000780/1‑150 (MQ=255) ttCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGATACCCCGCAAACGGCGGATGCGGGAATAT‑TAAAAGAGCGCAATTTACCCGgggggtgg > 1:1727094/1‑146 (MQ=255) tCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGt < 1:713957/150‑1 (MQ=255) cTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTa > 1:1352448/1‑150 (MQ=255) cTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTCGTACGGTAACGGCGAGCCCGATTCGCCGCAAAAGTCGTATACGGCATTAT‑CACATCAGCCC‑AATTACCACGCGGTATGGTa > 2:1915399/1‑150 (MQ=255) gtgCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACCTAGTATCCGGCAATAT‑AACCTCAGCGC‑ATTTACCCGGCGGGATGGGaaa > 1:1254709/1‑150 (MQ=255) tgCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGGTACGCCGCCAACCTCGGTTACGGGATTAT‑GACATAACCGC‑ATTTAACAGGGGGTATGGTatac > 1:1773115/1‑147 (MQ=255) gCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCCAACGTCGGATCCGGCATTTTAGACA‑CAGCGC‑AGTTTCCCGGCGGGATGGTTAAGc > 1:791551/1‑150 (MQ=255) gCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACCTCCGCGC‑ATTTACCCGGCGGTATGGTAAAGc > 2:1376374/1‑150 (MQ=255) gCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGc > 1:1151797/1‑150 (MQ=255) ccGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACAAAAGCGC‑ATTTACCACGCGGTATTGTAAAGct > 1:156445/1‑150 (MQ=255) gATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGATACGCCGCAAACGTCGTATACGGCATTAT‑GACATCAGCGC‑CTTTACCACGCGGTATGGTTAAGCTCTAc > 2:379450/1‑150 (MQ=255) cccGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATcc < 1:1608096/150‑1 (MQ=255) cTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGCTTAGGCCCAAACGTACTCTCCGGCATTAT‑ACCATCAGCGC‑CTTTACCACGCGGGATTGTAAATCTCTAAAataaaaaaaa > 2:618896/1‑143 (MQ=255) tACTAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGGATCCGGCATTAT‑CACTTCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGc < 2:1046076/150‑1 (MQ=255) aCAACCCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAAATGCGGTTTGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCTC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAATCTCTGCAATATCCTCAAGCg < 2:1477270/150‑1 (MQ=255) cAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGt < 1:774672/150‑1 (MQ=255) aaaCCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGtt < 2:943192/150‑1 (MQ=255) aaaCCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGACGGATACGCCGCAAACGTCGTATCAGGCAGTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCCGTATGGTAAAGCTATACAATATCCTCAAGCGtg > 1:272400/1‑149 (MQ=255) aaCCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTg < 2:1739346/150‑1 (MQ=255) aaCCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATAAGCCGCAAACGTCGTATACGGGATTTT‑AACATAAGCGC‑ATTTACCACGCGGGATGGTAAAGCTAGAAAATATCCACAAGCGGTg > 2:815546/1‑150 (MQ=255) aCCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGc < 1:1033391/150‑1 (MQ=255) cGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCtt < 2:1770855/150‑1 (MQ=255) aTTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATTAGCCGCCAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑CTTTTACAGGCGGTATGGTAAATCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCttac > 1:546240/1‑148 (MQ=255) aTTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTATAGCTCTACAATATACTCAAGCGTTGCTTcc > 1:44384/1‑149 (MQ=255) tGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑AACATAAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAAAATACTAAAGCGTTGCTTCAcgc > 2:1836929/1‑150 (MQ=255) tGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTAGTATACGGCATTAT‑CAAAACACCGC‑ATTTACCCGGCGGTATGGTAAAGCGCTACAAAATCCAAAAGCGATGcataccgc > 2:967620/1‑143 (MQ=255) atCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTTGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGtt < 2:1344632/150‑1 (MQ=255) tCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTg < 2:1158695/150‑1 (MQ=255) tCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTg < 2:1181224/150‑1 (MQ=255) aCGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCa < 2:1171262/150‑1 (MQ=255) aCGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCa < 1:1106787/150‑1 (MQ=255) cAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATAAGCGC‑ATTTACCAGGCGGGATGGTAAAGCTCTACAATATACTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCCCCgg > 1:1892299/1‑150 (MQ=255) aaTTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTAACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGt < 2:1088146/150‑1 (MQ=255) aaTTTACAGCAATTGCGGTGGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGTTTGCCACCGGt < 1:167203/150‑1 (MQ=255) tACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGCTACGCCGCAAACGTCGTATCCGGGATTTT‑AACCTCAGCGC‑ATTTACCCGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATACACAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCCGGACaa > 1:1913126/1‑150 (MQ=255) tACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACaa > 2:1026957/1‑150 (MQ=255) cAGCAATTGCGGTTTGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAAc < 2:1097911/150‑1 (MQ=255) cAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAAc < 2:1991060/150‑1 (MQ=255) aGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAAca < 2:1061783/150‑1 (MQ=255) gCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCACGCGTTGGTTCACGCGGGTTGCCACCGGGACAAAcaa > 2:826067/1‑149 (MQ=255) gCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGATAACCCGCAAACGTAGTATACGGCATTAT‑AACCAAAGCGC‑AATTTGCAGGCGGTATGGGTAAACGGTAAAAAAAACACAAACGTTTGTTAACGCGGGTTTGCACCGGTACAAAcaa > 2:1556571/1‑149 (MQ=255) cGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAg < 2:896313/150‑1 (MQ=255) ttGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTgc < 2:1058654/150‑1 (MQ=255) aCGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCt < 1:1780379/150‑1 (MQ=255) ggTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTgc < 2:1042052/150‑1 (MQ=255) cGGCGAGCCGGATACGCCGCAATAGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGTTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAg < 2:515335/150‑1 (MQ=255) cGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAg < 1:1638061/150‑1 (MQ=255) ggCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGt > 2:1322423/1‑150 (MQ=255) cGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGc > 2:466362/1‑150 (MQ=255) gAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGcc > 1:851964/1‑150 (MQ=255) gCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCTGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCgg < 2:143997/150‑1 (MQ=255) gCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAATGCTCTACAATATCCTCAAGAGTTGCTTCACGCGGGTTGCCCCCGGTACATACTTCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCgt > 2:449091/1‑149 (MQ=255) ccGGATACGACGTTTGCGGCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGa > 1:1611546/1‑150 (MQ=255) cGGATACGCCGCAAAAGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑TTTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAAAATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGaa < 2:432213/150‑1 (MQ=255) ggATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACCTCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAAt > 2:810987/1‑150 (MQ=255) gATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATg < 2:1254709/150‑1 (MQ=255) gATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATg < 2:1730938/150‑1 (MQ=255) gATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATg < 1:1486535/150‑1 (MQ=255) tACGGCGCAAACGGCGGTTCCGGCATTTT‑GACTTGAGCGG‑ATTTACCATGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCCTTGCTTCACGCGGGTTGCCAACGGTACAAACATCATCCATTGCCGCCTTCGCCAGTGGCGGAATGTc < 2:488958/150‑1 (MQ=255) tACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTc < 2:135943/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTGCCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCt < 1:1556571/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCt < 2:574676/150‑1 (MQ=255) cgcAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCt > 1:214352/1‑150 (MQ=255) gcAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGATTGTCTTCCtt > 1:1238564/1‑150 (MQ=255) cAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGATTGTCTTCCTTg > 1:1226552/1‑150 (MQ=255) cAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCTTg > 1:722782/1‑150 (MQ=255) aaaCGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGG‑ATTATCGAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCTTGc < 1:1396467/150‑1 (MQ=255) aaaCGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCCGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCCCCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCATGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCTTGc > 2:1068752/1‑150 (MQ=255) aCGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCTTGCGt < 1:1360577/150‑1 (MQ=255) aCGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCTTGCGt < 2:156445/150‑1 (MQ=255) cgtcgtATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTAGCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAAAATCCTCAAGCGTTGCTTCCCGCGGGTTGCCAGCGGTACCAACATCATCCACTGCCGCCTGCTCCAGTGCCGGAATGTCTTCCTTGCGTa > 1:101736/1‑150 (MQ=255) | CGAAAAGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTAT‑CACATCAGCGC‑ATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCTTGCGTA > NC_000913/2931687‑2931983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |