| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,313,208 | 0 | T | A | 5.8% | 564.5 / 16.1 | 197 | intergenic (‑30/+134) | rbfA/infB | 30s ribosome binding factor/translation initiation factor IF‑2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (92/92); new base A (5/7); total (97/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.67e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
CCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACG > NC_000913/3313060‑3313356 | ccGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGtt < 2:2009454/150‑1 (MQ=255)ccGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGtt > 2:781285/1‑150 (MQ=255) cGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGttt > 2:270170/1‑149 (MQ=255) 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tggtCATCTTCCCCAGCCGAGCATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGATCTTTATCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGTGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCtttt < 2:334744/150‑1 (MQ=255) tggtCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCtttt > 1:1719565/1‑150 (MQ=255) gtCATCATGCGAAGGCGTGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGATCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAATTTCTTTCGCCATAATATATTCTCCTGACAAAAAAGCGTCTAACAGCCCCtttttt < 1:446494/150‑2 (MQ=255) tcatcaTGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTAACAGCCCCttttttg < 1:1194833/150‑3 (MQ=255) catcatGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTaaa > 2:1144631/1‑150 (MQ=255) catcatGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTaaa > 2:155924/1‑150 (MQ=255) catcatGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCAGAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCATTTTaaa > 2:310689/1‑150 (MQ=255) cccAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAaattaatt > 1:1510901/1‑150 (MQ=255) cccAGGAGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTTCATTTACTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTATACATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAaattaatt < 1:1204602/150‑1 (MQ=255) cAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTc < 1:1418746/150‑1 (MQ=255) 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aaaaGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAg < 2:1939135/150‑1 (MQ=255) aaaaGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGAGTAAACGCCTTATCACGCATGGACACCTAAAAACCTTAAg > 1:93253/1‑150 (MQ=255) aaaGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAga < 1:97132/150‑2 (MQ=255) aaaGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGc < 2:1209669/150‑1 (MQ=255) ggggCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGGGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAAt < 2:1297997/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |