| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,382,133 | T→G | 5.4% | intergenic (+23/‑67) | degQ → / → degS | serine endoprotease, periplasmic/serine endoprotease, periplasmic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,382,133 | 0 | T | G | 5.4% | 420.9 / 10.5 | 142 | intergenic (+23/‑67) | degQ/degS | serine endoprotease, periplasmic/serine endoprotease, periplasmic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (65/69); new base G (5/3); total (70/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.85e-01 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
CATTGGCGTCAACCGCGATCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGC > NC_000913/3381984‑3382280 | cATTGGCGTCAACCGCGATCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCt < 2:1076470/150‑1 (MQ=255) tGGCGTCAACCGCGATCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTAc < 1:972513/150‑1 (MQ=255) tGGCGTCAACCGCGATCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGAAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTAc > 1:381093/1‑150 (MQ=255) ggCGTCAACCGCGATCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGATGATGCGTTAATGACGTAAACCGGGCAACAGGCTTACg > 2:131320/1‑150 (MQ=255) gTCAACCGCGATCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGTGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCAGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACgtgt < 2:854444/150‑1 (MQ=255) tCAACCGCGATCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGtgtg < 1:47897/150‑1 (MQ=255) cAACCGCGATCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCTTAAACCGGGCTTCAGGCTTACttgggt > 2:1945094/1‑147 (MQ=255) cAACCGCGATCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGAGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGa < 2:289435/150‑1 (MQ=255) aCCGCGAGCTGGTGAACTCGATTGCGGAAATGCGTACAGGGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTACACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATg < 2:1051024/150‑1 (MQ=255) aTCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGGGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGt < 2:1411787/150‑1 (MQ=255) tCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGtt < 1:213564/150‑1 (MQ=255) tCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGtt < 1:478255/150‑1 (MQ=255) cggtagAACTCGATTGCTGAAATTGGTAAAGTGCTGTCGGCAAAACCGGGCATCATCGCCCTGCAAATTGTAGGCGGCATTGTAAGCATCTATCTCCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCTGTCTTACGTGTGATGTCCGGTTa < 1:321383/145‑1 (MQ=255) cGGGTGAACTCGTTTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACAGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCAGGTTa > 2:726244/1‑150 (MQ=255) cGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTa < 2:1416845/150‑1 (MQ=255) cGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCACACGTAAGCCTGATGCCCGGttt < 2:27245/150‑2 (MQ=255) gTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACt < 2:1749945/150‑1 (MQ=255) aaCTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGt > 2:1427049/1‑150 (MQ=255) tCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGt < 2:1576203/150‑1 (MQ=255) tCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGt < 2:1815433/150‑1 (MQ=255) aTTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGACCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATATATCTGCTGATGAGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTAtg > 1:426998/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCACCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTAtg < 1:1290925/150‑1 (MQ=255) gCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTAtgctg > 2:1866266/1‑150 (MQ=255) gAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTAtgctgctg > 1:537333/1‑150 (MQ=255) gAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTAtgctgctg > 1:719707/1‑150 (MQ=255) gCGTAAAGTGCTGGCTGCAAAACAGTCCATCATAGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATTAAAGAATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACAGGGAATCATGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGtt < 1:1305562/150‑1 (MQ=255) gCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGtt > 1:1534115/1‑150 (MQ=255) gCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTAGCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCggt > 1:1333663/1‑148 (MQ=255) cGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAATCCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTGCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTc > 2:1360341/1‑150 (MQ=255) tAAAGTGCGGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATAGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTccc < 2:470805/150‑1 (MQ=255) cacaGTGCGGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCACTGAAAGCATCTATCTGCTGCTGCGTTCATGTCGTAAACCGGGCAGCAGGCTTACGGGTGCAGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCAGCCGTTccc < 1:244017/147‑1 (MQ=255) cTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTa < 1:923586/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTaa > 1:526749/1‑150 (MQ=255) ggcggcAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAAt > 2:1076935/1‑150 (MQ=255) ctgcAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGa < 1:1862316/148‑1 (MQ=255) cggcAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGa > 1:386555/1‑150 (MQ=255) ggcAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGAc > 1:1263005/1‑150 (MQ=255) ggcAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGATGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGAc > 1:1182023/1‑150 (MQ=255) gcAAAACCGGCCATCCTCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGGGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACg < 2:132757/150‑1 (MQ=255) gcAAAACCGGCCATCAACGCCCTGCAAATTCTACGCGGCAATGAAAGCATCTAACTGCTGATGCGGTAATTTCGTAAACCGGTCATCAGGCTTATGTGTGATGTCCGGTTAACTCGAGCTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTATTTAATGagg > 1:1330630/1‑148 (MQ=255) cAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACgg > 1:1216305/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGGCCATCATCGCACTGCAAATTGTACGCGGCAAGGAAAGCATCGATCTGCTGATGCGTTAATGGCGTAAACCGGTCAGCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGcc < 1:1820471/150‑1 (MQ=255) aaaCCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCt > 2:508856/1‑150 (MQ=255) aaCCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTc > 2:740978/1‑150 (MQ=255) ccGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAACCCGGGCATCCGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCca < 1:436072/150‑1 (MQ=255) cGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCcat > 1:795050/1‑150 (MQ=255) cGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCcat > 1:1960081/1‑150 (MQ=255) ggCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCATGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCcatc < 1:835748/150‑1 (MQ=255) gCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCcatca < 1:557041/150‑1 (MQ=255) gCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCcatca < 1:215383/150‑1 (MQ=255) gCCATCAGCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCGGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGGGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCcatca < 1:984857/150‑1 (MQ=255) ccATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAAATCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCcatcat > 2:731032/1‑150 (MQ=255) atcatcGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAAAGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGt < 2:339588/150‑1 (MQ=255) catcGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGttt > 1:1639841/1‑150 (MQ=255) catcGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGttt > 1:1954364/1‑150 (MQ=255) atcGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGTGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTtg < 1:414836/150‑1 (MQ=255) atcGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTtg < 2:537333/150‑1 (MQ=255) atcGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTtg > 1:25941/1‑150 (MQ=255) cGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTATTTAATGACGCCTCCATCATGTTtgtg > 2:704970/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGa > 2:1495588/1‑150 (MQ=255) cccTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGaa < 2:567126/150‑1 (MQ=255) ccTGCAAATTGTACGCGGAAATGAAAGCATATATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGTGTTACGTGTGATGTCCTGTTAACTCGTGGTATTCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAg < 2:956523/150‑1 (MQ=255) tGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGct > 2:904515/1‑150 (MQ=255) gCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGctc > 2:1361945/1‑150 (MQ=255) aTTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGGCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTAc < 1:1457156/150‑1 (MQ=255) ggCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCATCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTg > 1:679601/1‑150 (MQ=255) aaTGAAAGAATATATCTGCTGATGCTTTAATGTCGTTAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCTGTTAACTCGTTGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGa < 2:426998/150‑1 (MQ=255) aTGAAACCATCTATCTGCTGATTCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGAt < 1:1945094/150‑1 (MQ=255) gAAAGCATCTATCTGCTGATGCTTTAATGTCTGAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTGCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGACGTTCCA‑TTTTTTAATGTCGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTg < 2:1003811/150‑1 (MQ=255) gAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTg < 1:1763175/150‑1 (MQ=255) gAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGGGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTg < 1:1107776/150‑1 (MQ=255) aaaGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTgg < 2:1954364/150‑1 (MQ=255) agcagcTATCTGCTGATGCGTTAAGTGCGTCACCCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTAGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGTTTGGAt < 1:106686/150‑1 (MQ=255) aGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGAt < 2:381093/150‑1 (MQ=255) tgctgATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCAGCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCgg < 1:1410462/150‑1 (MQ=255) gctgATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACCTTACGTTGCGATTGGATTATTTGTAGgc > 2:69687/1‑150 (MQ=255) gATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCt > 2:1737299/1‑150 (MQ=255) aTGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTa < 2:1660082/150‑1 (MQ=255) cGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTc > 1:740616/1‑150 (MQ=255) aTGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTctgctg < 2:916082/150‑1 (MQ=255) cGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTg > 2:940819/1‑150 (MQ=255) cGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTg > 1:884472/1‑150 (MQ=255) cGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTg > 1:1782717/1‑150 (MQ=255) agttaaCCGGACATCACACGTAAGCCTGATGCCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTg > 2:1410852/5‑150 (MQ=38) agttaaCCGGACATCACACGTAAGCCTGATGCCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TGTTTTAATGAAGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGAGATTGGATTAATTGTCGTCGCTATTCTGCTGGTTg > 1:1005549/5‑150 (MQ=37) gTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTATTTGTCGGCGCTATTCTGCTTGTTGc > 1:742382/1‑150 (MQ=255) gTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGc > 1:1119009/1‑150 (MQ=255) aaaCCGGGCATCAGGCTTACGTGTGAGGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCAGCCGTGCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCAATCATGTTTGTGACGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTTGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCa > 1:1531671/1‑150 (MQ=255) aaCCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCAt < 1:175085/150‑1 (MQ=255) ccGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGc > 1:734521/1‑150 (MQ=255) ccGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTGTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGc > 2:1390751/1‑150 (MQ=255) cGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTAAGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGcc > 2:79107/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGc < 2:576402/150‑1 (MQ=255) aTCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGc > 2:474107/1‑150 (MQ=255) tCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGc < 2:1087578/150‑1 (MQ=255) tCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCt > 2:635091/1‑150 (MQ=255) cAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTg < 1:1866266/150‑1 (MQ=255) ggCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTgca > 1:731580/1‑149 (MQ=255) gCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTgcgc < 1:1076935/150‑1 (MQ=255) gCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTGTTAATGACGCCTCCATCATCTTAGTCCAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGAGCTATTCTGCTGTTTGCCATGCCTTCGCTgcgc > 1:820975/1‑150 (MQ=255) | CATTGGCGTCAACCGCGATCGGGTGAACTCGATTGCTGAAATGCGTAAAGTGCTGGCGGCAAAACCGGCCATCATCGCCCTGCAAATTGTACGCGGCAATGAAAGCATCTATCTGCTGATGCGTTAATGTCGTAAACCGGGCATCAGGCTTACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCC‑TTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGC > NC_000913/3381984‑3382280 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |