| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,648,319 | C→T | 5.2% | noncoding (26/84 nt) | agrB → | antisense sRNA antitoxin for the DinQ toxin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,648,319 | 0 | C | T | 5.2% | 343.3 / 3.4 | 115 | noncoding (26/84 nt) | agrB | antisense sRNA antitoxin for the DinQ toxin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (69/38); new base T (3/3); total (73/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATA > NC_000913/3648170‑3648467 | tatGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTccagc > 1:1382991/1‑150 (MQ=255)tatGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGAGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTccagc > 2:1387357/1‑150 (MQ=255) atGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCATGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAATAACTATCTCACTccagcc < 2:362838/150‑1 (MQ=255) 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TATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATA > NC_000913/3648170‑3648467 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |