| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 429,554 | A→T | 5.4% | Y17F (TAT→TTT) | secF → | SecYEG protein translocase auxillary subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 429,554 | 0 | A | T | 5.4% | 404.8 / 9.1 | 140 | Y17F (TAT→TTT) | secF | SecYEG protein translocase auxillary subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (78/52); new base T (3/5); total (81/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GCGACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGC > NC_000913/429405‑429701 | gCGACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTa > 1:654085/1‑150 (MQ=255) cGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGAc < 1:1510232/150‑1 (MQ=255) cGTAGATGTTTACAGAGATTGTCGGTAAGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGAGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGTCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCCCGGACGTAAAGTCTATGAc > 2:439814/1‑150 (MQ=255) ggcGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACt < 1:821571/148‑1 (MQ=255) cGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACttt < 2:1589588/150‑1 (MQ=255) cGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTATATGACttt > 1:1807830/1‑150 (MQ=255) gATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTa > 1:1539951/1‑150 (MQ=255) gATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTa > 2:49904/1‑150 (MQ=255) aTGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTAt > 2:143576/1‑150 (MQ=255) gTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCATAGACTTTacgg < 2:1946287/150‑4 (MQ=255) gTTTACCGAGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCATAGACTTTacgg < 2:538078/150‑4 (MQ=255) tttACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCATAGACTTTacggc < 1:1907648/150‑5 (MQ=255) ttACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATgcgc > 2:744351/1‑150 (MQ=255) tACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCt > 1:904267/1‑150 (MQ=255) ccGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGCAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGAGCTgg > 1:325879/1‑150 (MQ=255) ccGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTgg < 2:239494/150‑1 (MQ=255) ccGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTgg < 2:214729/150‑1 (MQ=255) ccGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTgg > 2:1335933/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAAACTCCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGACGAGTGCGATGTGGCACAGGAAAATACTGTTG‑AACAACTAAAACACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGAGCTgg > 1:342042/1‑150 (MQ=255) cgATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGac < 2:480066/150‑1 (MQ=255) cgATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGac < 1:1488597/150‑1 (MQ=255) gATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATTTACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATCACTGGATGCGCTGGGact > 1:1143924/1‑150 (MQ=255) gTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCTAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTg > 1:72555/1‑150 (MQ=255) gTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTg > 1:1372735/1‑150 (MQ=255) gTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTg > 1:1104804/1‑150 (MQ=255) ggTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTCCTGGGc > 1:386696/1‑150 (MQ=255) gTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑ATCAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCt > 2:426774/1‑150 (MQ=255) cgcgTGCCTTCTTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAATCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTc < 2:124532/150‑1 (MQ=255) cgTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCgg > 2:743241/1‑150 (MQ=255) tCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATctct > 1:1106453/1‑150 (MQ=255) tAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGt > 2:578680/1‑150 (MQ=255) aaaCCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTc > 2:1670000/1‑150 (MQ=255) aCCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACACCTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTctg > 1:1052457/1‑150 (MQ=255) aCCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTctg > 1:1012408/1‑150 (MQ=255) tGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTctgctg < 1:1326680/150‑1 (MQ=255) tGCTATATGGCGGCAAGCGAGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGGTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATTCGATGGGTCTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTctgctg > 1:279390/1‑150 (MQ=255) gCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGt < 2:562464/150‑1 (MQ=255) gCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGt > 2:1852680/1‑150 (MQ=255) cTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCATAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGtt < 1:1397445/150‑1 (MQ=255) cTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGGGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGtt < 1:525262/150‑1 (MQ=255) atGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGTAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATc < 1:1598397/150‑1 (MQ=255) atGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTTTGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATc < 1:957090/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCg > 2:265674/1‑150 (MQ=255) ggcggcACGCGCGTCAAGAATCTGTCAAGCTGAGGAGTGAGATGTGTAACAGGAATATAATGTTT‑AACAAATAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTTCTGGGCTTTCGTCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgc < 2:324669/150‑1 (MQ=255) ggcggcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgc > 2:63324/1‑150 (MQ=255) ggcggcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgc < 2:1950672/150‑1 (MQ=255) ggcggcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgc > 2:69334/1‑150 (MQ=255) gcggcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgct > 1:1643712/1‑150 (MQ=255) cggcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAAGATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTTATCgcgg > 1:371807/1‑148 (MQ=255) cggcAAGCGCGGCAAGAAGCTGGCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgctg < 1:1313287/150‑1 (MQ=255) ggcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgctgc < 1:869590/150‑1 (MQ=255) gTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGAGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGttat > 1:1396634/1‑150 (MQ=255) aagaagCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTtattat < 1:564397/150‑1 (MQ=255) agaagCTTTCAATCTGAGTAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCTGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATg < 1:1743510/150‑1 (MQ=255) agaagCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATg < 2:823346/150‑1 (MQ=255) agaagCTGTCAAGCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATg < 1:1056001/150‑1 (MQ=255) gCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCg > 1:150499/1‑150 (MQ=255) cTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGACATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGt > 1:279569/1‑150 (MQ=255) cAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTgcgc > 2:896698/1‑150 (MQ=255) cAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTgcgc > 1:1481539/1‑150 (MQ=255) tCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAATCCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGc < 1:1459548/150‑1 (MQ=255) gaggagTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCttt > 2:75168/1‑150 (MQ=255) gaggagTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCttt > 1:1293545/1‑150 (MQ=255) aggagTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTa < 2:686075/150‑1 (MQ=255) tgTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACt < 2:763616/149‑1 (MQ=255) agTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAAc < 1:714250/150‑1 (MQ=255) agTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTTAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACt < 1:143576/150‑1 (MQ=255) tGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTgg > 2:1862031/1‑150 (MQ=255) cGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTgggg > 1:406140/1‑150 (MQ=255) aTGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGc > 2:137056/1‑150 (MQ=255) tgGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGGCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTgg < 2:925424/150‑1 (MQ=255) gCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGAt > 2:841008/1‑150 (MQ=255) cacaGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGAtt > 2:1803274/1‑150 (MQ=255) aGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCa > 1:142018/1‑150 (MQ=255) ggAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCAc > 2:1477992/1‑150 (MQ=255) gAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTGCGGCATCTCTGGGCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCAcc < 2:1774168/150‑1 (MQ=255) ataCTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTACAGGCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGGTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCggtg < 2:891383/150‑1 (MQ=255) ataCTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCggtg < 1:557618/150‑1 (MQ=255) taCTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGCTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCggtgg < 2:933913/150‑1 (MQ=255) cTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTa > 1:1911294/1‑150 (MQ=255) ttG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTCTGACTTTATGCGCGGGGACTACTGGGCTTTCGGCTTCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTTTTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCGGGATTTCACCGGTGGTACgg < 1:159101/150‑1 (MQ=255) ttG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACgg < 2:1372735/150‑1 (MQ=255) ttG‑AACAACTAAACCACGGCCCTACAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGGATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACgg < 2:1490578/150‑1 (MQ=255) tG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGt > 2:794314/1‑150 (MQ=255) tG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGGCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTAATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGt < 2:169402/150‑1 (MQ=255) g‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGtt > 2:1640527/1‑150 (MQ=255) caacaatAACCCACGCCCGTCAAGTCTCTCTCTTAATGCGCGTGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAAGCGCTGCTATCGTTTTTATGGGCGGGCGCGGCTTTAACTGGGGGGTTCATTTCCCCGGTGGTACGGTTa < 2:329584/144‑1 (MQ=255) aacaacTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTa > 2:1016090/1‑150 (MQ=255) acaacTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTAt < 2:1552609/150‑1 (MQ=255) caacTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTAtt > 2:1066210/1‑150 (MQ=255) caacTAAACCACGGCCGTAAAGGCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTAtt < 2:1440232/150‑1 (MQ=255) acTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGa > 1:185935/1‑150 (MQ=255) aaaCCACGGCCGTAACCTCTATCACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTGCGGCAGCTCTGGGCTGCTGTGAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAAt < 2:325879/150‑1 (MQ=255) aCCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTa < 1:49904/150‑1 (MQ=255) cACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACg > 2:1657967/1‑150 (MQ=255) gcgcatAAAGTCATAGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTTACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTc > 1:1281034/6‑150 (MQ=255) gCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCg > 1:1669771/1‑150 (MQ=255) cgcatAAAGTCATAGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTCGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCg > 2:1271302/5‑150 (MQ=255) gcatAAAGTCATAGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGa > 1:533800/4‑150 (MQ=255) tCTATGACTTTATGAGCTGGGACTACTGGGCTTTAGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATAGCTTCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGTGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCgg < 1:827813/150‑1 (MQ=255) | GCGACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTG‑AACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGC > NC_000913/429405‑429701 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |