Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,390,401 | C→A | 5.5% | intergenic (‑41/+56) | psd ← / ← rsgA | phosphatidylserine decarboxylase/ribosome small subunit‑dependent GTPase A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,390,401 | 0 | C | A | 5.5% | 393.6 / 9.4 | 140 | intergenic (‑41/+56) | psd/rsgA | phosphatidylserine decarboxylase/ribosome small subunit‑dependent GTPase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (69/63); new base A (4/4); total (73/67) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.44e-01 |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CCAGTTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGTTTCCGCGAT > NC_000913/4390252‑4390549 | ccAGTTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGcc > 2:1259231/1‑150 (MQ=255) ccAGTTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGcc < 2:1817034/150‑1 (MQ=255) ccAGTTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGcc < 1:677864/150‑1 (MQ=255) ccAGTTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGcc < 1:520139/150‑1 (MQ=255) ccAGTTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAAAGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGGTTTGTCGTTCCTGATCCGGcc > 2:1416731/1‑150 (MQ=255) gTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGcc > 1:1613837/1‑150 (MQ=255) tCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCg > 1:1200382/1‑150 (MQ=255) cAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCgg > 1:322598/1‑150 (MQ=255) gCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGAt < 2:65838/150‑1 (MQ=255) ccATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATc < 1:1565533/150‑1 (MQ=255) ccATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATc > 1:1383761/1‑150 (MQ=255) cATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATcc < 2:1963158/150‑1 (MQ=255) cATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATcc < 1:721749/150‑1 (MQ=255) cATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATcc > 1:208431/1‑150 (MQ=255) cATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATcc < 2:1125771/150‑1 (MQ=255) aTCCTGCCCGCGTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCATGTAGGCCGGATcag < 1:819931/150‑3 (MQ=255) aTCCGGCCCGCTTGCTTGCGCCCCACCCCGCCCGGCGAGTAAGCCCTAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCATGTAGGCCGGATcag < 1:1800999/150‑3 (MQ=255) ccTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑a < 1:351672/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCTCAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCCGCATGTAGGCCGGATcaggaacg < 2:1007263/150‑8 (MQ=255) cccGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑aaaaa > 1:1087951/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGATTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTCTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑aaaaaa > 1:1298211/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGACAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTATAGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTACTGATCCGGCCTAAATGCCGGATCCTG‑aaaaaa > 1:933174/1‑150 (MQ=255) cGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCCGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑aaaaaaa > 1:1556319/1‑150 (MQ=255) cGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑aaaaaaa > 1:1961515/1‑150 (MQ=255) gcttgcttGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGTCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAg < 2:1417262/150‑1 (MQ=255) cttgcttgCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACCTGCCGGATCCTG‑AAAAAAAgg > 2:648860/1‑150 (MQ=255) cttgcttgCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAgg < 2:585167/150‑1 (MQ=255) ttgcttgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAggg < 1:677256/150‑1 (MQ=255) ttgcttgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAggg < 1:827867/150‑1 (MQ=255) ttgcgtgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAACCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAggg < 2:1089370/150‑1 (MQ=255) atgcttgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAggg < 1:307254/149‑1 (MQ=255) gcttgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTATAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTTTCGTTCCTGATCAGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAggggc > 2:1226336/1‑149 (MQ=255) cttgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAATAAGGGGAc > 1:392360/1‑150 (MQ=255) cttgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGAc < 1:11181/150‑1 (MQ=255) ttgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACg > 1:1727408/1‑150 (MQ=255) ttgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGCCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACg > 2:168886/1‑150 (MQ=255) tgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGa > 1:1489236/1‑150 (MQ=255) tgcGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGGTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGa < 1:327334/150‑1 (MQ=255) cccAACCAGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCAGTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGAGCCGG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTa > 1:1918513/1‑150 (MQ=255) cAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAac > 1:1765177/1‑150 (MQ=255) cAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAac < 2:1488533/150‑1 (MQ=255) cccGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAacgac > 1:1143937/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGt < 2:527004/150‑1 (MQ=255) cAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTa > 1:1432329/1‑150 (MQ=255) aaGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGTGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTg > 2:258151/1‑150 (MQ=255) aaGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTg > 1:1543182/1‑150 (MQ=255) aaGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTg < 2:1531002/150‑1 (MQ=255) aaGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTg < 2:1659124/150‑1 (MQ=255) aGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgt > 2:1335151/1‑150 (MQ=255) ccATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgtca > 1:20953/1‑150 (MQ=255) cATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgtcag < 1:1233605/150‑1 (MQ=255) aGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgtcagtca > 1:1218369/1‑150 (MQ=255) gTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTgtcagtgcc < 1:1373057/150‑4 (MQ=255) tCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCg < 1:2006215/150‑1 (MQ=255) tCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCg < 2:1568360/150‑1 (MQ=255) tCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCg > 2:465700/1‑150 (MQ=255) gCAGAATGTACTGTATCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGTTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCGTCCGTAt < 1:448872/150‑1 (MQ=255) aGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCa < 2:800715/150‑1 (MQ=255) aGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCa < 1:1630636/150‑1 (MQ=255) gAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCTTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAg > 2:896235/1‑150 (MQ=255) aTGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCT‑CAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGACACTCATCCTTATCAGaaa > 2:140176/1‑150 (MQ=255) tACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTTATCCGGCCTAAATGCCGTATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACTACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAg < 1:945074/150‑1 (MQ=255) tACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAg > 2:431777/1‑150 (MQ=255) tACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAg < 1:1757302/150‑1 (MQ=255) cTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGtt > 2:1771017/1‑150 (MQ=255) tGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGGCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTGAAAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGtt < 2:1835852/150‑1 (MQ=255) cGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTAcg > 2:1136308/1‑150 (MQ=255) gAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGACGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTAcgc < 1:1409022/150‑1 (MQ=255) aGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGtt < 2:841072/150‑1 (MQ=255) tttAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGtttt > 1:1304283/1‑150 (MQ=255) tAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTa < 1:997914/150‑1 (MQ=255) aaTGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGGTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTAcc > 2:1722539/1‑150 (MQ=255) tGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGATTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCAG‑AAAAAAAGAGGACGATTCAAACCACGGTTAGCTTAATAGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTATATACGCGTATTTACCTg > 2:395348/1‑150 (MQ=255) aTTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTgcgc < 2:208431/150‑1 (MQ=255) aTTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGGTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTgcgc > 2:733814/1‑150 (MQ=255) tAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCAt > 1:977250/1‑150 (MQ=255) ggTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTc > 2:53425/1‑150 (MQ=255) tAGCCTCCAGTCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCa < 1:166757/150‑1 (MQ=255) aGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAg < 1:571258/150‑1 (MQ=255) aGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAg < 1:1259231/150‑1 (MQ=255) aGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGGTCCTGATCCGGCCTACATTCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGCCGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAg < 2:323937/150‑1 (MQ=255) aGCCTCCAGGCCATTGTTTTGGCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAg < 1:1259342/150‑1 (MQ=255) aGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACgg > 1:1514976/1‑150 (MQ=255) aGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACgg < 2:697855/150‑1 (MQ=255) ggCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGTGACGAATCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGATTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGt < 2:1808952/150‑1 (MQ=255) gCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCATGATCCTG‑AAAAAATGGGGACGATTCTAACGACTGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCAGTATCAGAAAAGTTTTTACTCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTg < 2:933174/150‑1 (MQ=255) ccATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGa < 2:1594896/150‑1 (MQ=255) ccATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGa > 1:1024775/1‑150 (MQ=255) cATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGAt < 2:638165/150‑1 (MQ=255) tGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCg < 1:465700/150‑1 (MQ=255) cGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCCTGCTTTCCAGAAGACGGTGATTGTTTTCGaaa > 1:317702/1‑150 (MQ=255) tCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACgg > 1:893357/1‑150 (MQ=255) ccTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACggg < 2:1919367/150‑1 (MQ=255) acTGATCCGGCCTACATTCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACggg < 1:719485/149‑1 (MQ=255) aggATCCGGCATGTAGGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGt > 2:352749/3‑150 (MQ=255) tGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAAGACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGtt > 1:91766/1‑150 (MQ=255) ggATCCGGCATGTAGGCCGGATCCTG‑AAAATAAGGGGACGATTCTAACGACGGGTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCCCCAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGATTACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGtt > 1:1484303/2‑150 (MQ=255) cGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAAAACGTGGATAGTTTTCGAAACGGGTATCcgc > 1:190010/1‑150 (MQ=255) ggCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGTTTCcgcg < 2:1087951/150‑1 (MQ=255) ccTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGTTTCCGCGAt < 2:417256/150‑1 (MQ=255) | CCAGTTTTGTCAGCCATCCTGCCCGCTTGCTTGCGCCCCAACCCGCCAGGCGAGTAAGCCATAGTTTCGGCAGAATGTACTGTAGCGAAAGTTTAAATGAATTTAACAAGGTAGCCTCCAGGCCATTGTTTTGTCGTTCCTGATCCGGCCTACATGCCGGATCCTG‑AAAAAAAGGGGACGATTCTAACGACGGTTAGCTTAATTGTCAGTCATCCGTATCAGAAAAGTTTTTACGCGTTTTTACCTGCGCCATGCTTTCCAGAATACGGTGATAGTTTTCGAAACGGGTTTCCGCGAT > NC_000913/4390252‑4390549 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |