New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	NC_000913	= 1428264	NA (NA)	45 (0.340)	9/286	9.9	87.0%	noncoding (531/1196 nt)	IS5	repeat region
	?	NC_000913	= 2066866	7 (0.050)					noncoding (488/1195 nt)	IS5	repeat region
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.

GTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTG  >  NC_000913/2066717‑2066874                                                                                                                                                      |         ggcAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAg          <  1:1007354/148‑1 (MQ=17)  ccagccggCTCTTGGCATCGACACCATTGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGGCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAgg         <  1:170605/143‑1 (MQ=2)     ggCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCGTTTCTTGGTCTGATGCATCTACGGATCGAGTTGCTGCTGTTTGTTCTTTGTCGAGCTCGGTGCCTGAATGATGGTGGCCTCGACCAAGGTGc      >  1:2069526/1‑150 (MQ=11)     ggCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTCTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGc      >  1:1904786/1‑150 (MQ=17)      gCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGCTTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGcc     >  1:887626/1‑150 (MQ=17)        cGCTCTTGGCATCGTCTACATTGTTGTCGTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTGTCTTGGTCTGATTAAGCTCCGGATCGCGTTGCTGCTATTTGTTCTTTGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCtt   <  2:200313/150‑1 (MQ=11)         gCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTg  <  1:2066623/150‑1 (MQ=11)         gCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTg  <  1:2197695/150‑1 (MQ=11)                                                                                                                                                      |         GTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTG  >  NC_000913/2066717‑2066874

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.