New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 4240190 = | NA (NA) | noncoding (34/37 nt) | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
Only 100 of 789 total aligned reads displayed.
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agcaAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTAGATTTTTAGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGTGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTg > 2:201546/1‑150 (MQ=255) gcaAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGc < 2:45042/150‑1 (MQ=255) gagtgacgtcatagcagtacctccttcacagtggcgagcttcctgtataacgcaaaaatgtgacggagatctatattttttgtgtatgttttgttcaacctggatttggagcgcgcctccaccaaagccggatatacctacccgtagGcc > 1:1870933‑M1/148‑150 (MQ=255) gagtgacgtcatagcagtacctccttcacagtggcgagcttcctgtataacgcaaaaatgtgacggagatctatattttttgtgtatgttttgttcaacctggatttggagcgcgcctccaccaaagccggatatacctacccgtagGcc > 1:3465663‑M1/148‑150 (MQ=255) caAACTAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGcc < 1:7178072/150‑1 (MQ=255) 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tCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCAACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCg > 1:2409502/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGcc > 1:2836842/1‑150 (MQ=255) | AGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCAC > NC_000913/4240008‑4240306 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |