| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3621434 | NA (NA) | 8 (0.010) | 4/272 | NT | 100% | coding (2243/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3621460 | 0 (0.000) | coding (2269/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
ACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAA > NC_000913/3621311‑3621609 | accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGCAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG > 2:4684303‑M2/1‑150 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG > 1:2027009‑M2/1‑150 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:7064060‑M2/150‑1 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG > 2:2146300‑M2/1‑150 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 2:2932097‑M2/150‑1 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:6145051‑M2/150‑1 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:596839‑M2/150‑1 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:596821‑M2/150‑1 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:5081013‑M2/150‑1 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:4910371‑M2/150‑1 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:4879945‑M2/150‑1 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG > 2:5861841‑M2/1‑150 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 2:7819731‑M2/150‑1 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG > 1:3178751‑M2/1‑150 (MQ=255)accgcaccgTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG > 2:4684881‑M2/1‑150 (MQ=255) ttACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaatgcacctccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcgg < 2:2098075‑M2/150‑104 (MQ=255) ccGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggt < 2:1854348‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggt < 2:8887022‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggt < 2:8887040‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggt < 2:8887083‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcg > 2:20822‑M2/1‑26 (MQ=255) ccGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcg < 1:20822‑M2/71‑46 (MQ=255) ggCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgc < 2:4252493‑M2/150‑127 (MQ=255) cctgcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcggtgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtc < 2:3398946‑M2/147‑147 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtca < 2:9320045‑M2/150‑148 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtca < 2:9320349‑M2/150‑148 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtca < 2:7724530‑M2/150‑148 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtca < 1:9514476‑M2/150‑148 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtca < 1:9228958‑M2/150‑148 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtca > 1:2380245‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtca < 1:4187678‑M2/150‑148 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccgtcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtca > 1:3028733‑M2/1‑3 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcat < 1:5964542‑M2/150‑149 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcat > 2:928243‑M2/1‑2 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcat > 2:928177‑M2/1‑2 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcat > 2:9138786‑M2/1‑2 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcat > 1:2590509‑M2/1‑2 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcat < 2:8589893‑M2/150‑149 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcat > 1:9411972‑M2/1‑2 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcat > 1:6304946‑M2/1‑2 (MQ=255) gcctttctcatcctacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 2:254601‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcacctccacccggtgcccttcgctgttatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacgcttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 2:1862810‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 1:1970914‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 2:2497363‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 2:1528417‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 2:169874‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 2:1808697‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 1:8204028‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 2:1862798‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata < 1:3819745‑M2/150‑150 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 1:662827‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 1:662697‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 1:4854704‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 2:7559071‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata < 2:6613892‑M2/150‑150 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 1:4854794‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 1:5287134‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 2:4608870‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 1:6555292‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata < 1:6121969‑M2/150‑150 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata < 2:3368102‑M2/150‑150 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata < 2:3367802‑M2/150‑150 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 2:2266963‑M2/1‑1 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgaaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttcgtcatactgccaccgctctgcggtttcacccttcacggtgcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcata > 1:4854852‑M2/1‑1 (MQ=255) | ACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAA > NC_000913/3621311‑3621609 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |