Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 66,534 | T→G | 6.8% | K6T (AAA→ACA) | araD ← | L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 66,534 | 0 | T | G | 6.8% | 2065.1 / 37.3 | 654 | K6T (AAA→ACA) | araD | L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (222/374); new base G (56/2); total (278/376) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.07e-20 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 677 total aligned reads displayed.
TATCGTCAGCGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAAT > NC_000913/66385‑66683 | atCGTCAGCGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑ttt < 2:1561355/150‑1 (MQ=255) tCGTCAGCGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTg < 2:7386808/150‑1 (MQ=255) tCGTCAGCGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTg > 1:2453333/1‑150 (MQ=255) cGTCAGCGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTga < 1:9321082/150‑1 (MQ=255) gTCAGCGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTgag > 1:2004047/1‑150 (MQ=255) cAGCGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGAt < 1:8385852/150‑1 (MQ=255) cAGCGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGAt < 2:8107796/150‑1 (MQ=255) cAGCGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGAt < 1:4081667/150‑1 (MQ=255) gCGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGAtct > 2:1053441/1‑150 (MQ=255) cGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGAtctt > 1:7532096/1‑150 (MQ=255) cGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCACCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGAtctt < 1:8691296/150‑1 (MQ=255) ggTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCACATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TGGGAGAtcttc > 1:8561948/1‑150 (MQ=255) gTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCCTGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGAtcttct < 2:7895701/150‑1 (MQ=255) cATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTaa < 1:5556958/150‑1 (MQ=255) cATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTaa < 1:733616/150‑1 (MQ=255) tGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCCGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTCATACCTGGCG‑GGGGAGATCTTCTAACa > 1:4832408/1‑150 (MQ=255) gCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGtt < 2:5658224/150‑1 (MQ=255) cTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTg > 1:7604933/1‑150 (MQ=255) tGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGa < 2:1196338/150‑1 (MQ=255) gTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGAc < 2:2157792/150‑1 (MQ=255) cGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCtt < 2:4846070/150‑1 (MQ=255) gACGCCGGAAGGTTTGATCACAACGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTc < 1:915315/150‑1 (MQ=255) ccGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGc < 2:8888271/150‑1 (MQ=255) cGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGcc > 2:5221074/1‑150 (MQ=255) ggAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCg < 2:7093321/150‑1 (MQ=255) ggAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCg < 1:2905911/150‑1 (MQ=255) ggAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TGGGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCg > 1:6305036/1‑150 (MQ=255) gAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCgg > 1:620431/1‑150 (MQ=255) aaGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCGTTTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCgg < 2:3203775/150‑1 (MQ=255) gTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATgc > 2:4651403/1‑150 (MQ=255) tttGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGGTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGGTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATgcg > 2:5424563/1‑150 (MQ=255) ttGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATgcgc < 1:7934750/150‑1 (MQ=255) ttGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCAGGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCATCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGACGGATgcgc > 2:1798944/1‑150 (MQ=255) 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aCGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCg < 2:856034/150‑1 (MQ=255) gccgcGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGc > 2:9604798/1‑150 (MQ=255) gccgcGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TGTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGc > 1:215761/1‑150 (MQ=255) cgcgCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCt < 1:9638287/150‑1 (MQ=255) cTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACaa < 1:5969154/150‑1 (MQ=255) tCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGtt > 2:3485420/1‑107 (MQ=255) cgcgATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACaaaa < 2:6252025/150‑1 (MQ=255) cgcgATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACaaaa < 1:1523134/150‑1 (MQ=255) cgcgATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TGTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACaaaa > 1:3828198/1‑150 (MQ=255) gcgATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAAt < 2:3038393/150‑1 (MQ=255) cgATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATc > 2:5989103/1‑150 (MQ=255) cgATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATc < 1:1893885/150‑1 (MQ=255) gATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCg > 2:8620218/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGc < 2:6049651/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCgt < 2:6948228/150‑1 (MQ=255) 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cccATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGa > 2:2992202/1‑150 (MQ=255) cccATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGa < 2:1897546/150‑1 (MQ=255) gtgAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAACTCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACgcgc < 2:255429/150‑1 (MQ=255) tgAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAATATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGAcgcgac > 2:1318182/1‑148 (MQ=255) tgAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACACAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGcc > 2:6406729/1‑150 (MQ=255) 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ttttGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTg > 2:8816289/1‑150 (MQ=255) ttttGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TGTGAGATCTTCTAACATTTTGACTCCGTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATAGCAGCGTGTAGGCCAGATAATACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGGTg > 1:664494/1‑150 (MQ=25) gggCCGCGCCAGGGTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGTCTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGTTAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAAt < 2:6669660/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAAAAAGTTGAATCCATAGTGCCGGAGGCGCTTTGCTTATCCCGCCTACAAAAACGCAGCGGGGAGGCCGGATAAGACGCGCCAGCGGCGCATCAGGCGGTGAATGc > 1:2334134/1‑150 (MQ=255) gCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TGTGAGATATTCTAACATGTTGAATACATAGTGCCGGATGCGCGTTGCTTATACGGCCTACAAAATCGCAGCGGGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGGTGAATGc > 1:6050893/1‑150 (MQ=18) cAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGTTGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGcc < 1:6871798/150‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCg < 2:7604044/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCgg < 1:1188074/150‑1 (MQ=255) cgcCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TGGGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGGTGCGCTTTGCATATCCGGCCTAACAAATCGCAGCGGGTTGGCCGGTGAATACGCGCCCGCGGCGCATCAGGCGTTGGATGCCggg > 1:5823826/1‑149 (MQ=255) gcCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TGTGAGATCTTATAAAAAGTTTAAAACATAGTTCCCGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTAAAAAAACCCAGCGTGGAGGCCGGATAAGAAGCGCCATCGGCGCAGAAGGCGTTGAATTCCGGAt > 1:7786314/1‑150 (MQ=12) ccAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATg < 1:1052634/150‑1 (MQ=255) tGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGACTGCCGGATGCGCttt < 2:4234112/150‑1 (MQ=255) gCTTCTAATCCCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGc < 2:9436046/150‑1 (MQ=255) ttCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCtt > 2:9086433/1‑150 (MQ=255) aaTACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATcc < 2:3652818/150‑1 (MQ=255) tcccTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTGGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCgg < 2:5024540/148‑1 (MQ=255) aCCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGc < 2:7967774/150‑1 (MQ=255) aCCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGc < 1:5325068/150‑1 (MQ=255) aCCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGc < 2:9129643/150‑1 (MQ=255) aCCTGGCG‑TTAGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGc < 1:4361427/150‑1 (MQ=255) ccTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGcc < 1:5732727/150‑1 (MQ=255) tGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTa > 2:7283095/1‑150 (MQ=255) tGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGGGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCGTTGCTTATCCGGCCTa > 2:3304694/1‑150 (MQ=255) g‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACaaa > 1:3697899/1‑150 (MQ=255) g‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACaaa > 2:5792880/1‑150 (MQ=255) tttGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACaaaa > 1:4175835/1‑150 (MQ=255) tttGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACaaaa < 2:4194183/150‑1 (MQ=255) | TATCGTCAGCGGTCATGACGCTGTAATCGACGCCGGAAGGTTTGATCACAAAGACGCCGCGCTCGCGATCAACGGCGCTGACGTTGCCCCATGTGAGCGTGACCAGGTTGTGTTTTGGCAGCGCCAGGTTGGCTTCTAATACCTGGCG‑TTTGAGATCTTCTAACATGTTGACTCCTTCGTGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAATCGCAGCGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAATGCCGGATGCGCTTTGCTTATCCGGCCTACAAAAT > NC_000913/66385‑66683 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |