| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,470,436 | C→A | 12.3% | Q436K (CAA→AAA) | gtrS → | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,470,436 | 0 | C | A | 12.3% | 1096.9 / 38.6 | 374 | Q436K (CAA→AAA) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (109/204); new base A (56/3); total (167/207) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.09e-19 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 381 total aligned reads displayed.
CTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGT > NC_000913/2470287‑2470585 | ctctTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATc < 2:6600827/150‑1 (MQ=255) tctTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTAAAAGAAATCa > 1:2207448/1‑150 (MQ=255) ctTTTTGTAATATCTCAATTTTATGTTTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCaa < 2:3326080/150‑1 (MQ=255) ctTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCaa < 2:8568196/150‑1 (MQ=255) ttttGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGa < 2:4569660/150‑1 (MQ=255) ttGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACa < 1:7939982/150‑1 (MQ=255) gAATATATCATTTTTATGTGTCATTTTTCGGGTAATGATTTAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTAGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCTAAGAAATCAAGACAATa < 2:2017466/150‑1 (MQ=255) atCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTTTAAAATAATTAAAATAAAAAAAAAAAATATCGa > 1:2536988/1‑150 (MQ=255) atCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGa < 2:6425462/150‑1 (MQ=255) atCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGa < 1:4349350/150‑1 (MQ=255) atCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGa < 2:4231968/150‑1 (MQ=255) tctcAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGAt < 2:5626435/150‑1 (MQ=255) tctcAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGAt < 1:7027499/150‑1 (MQ=255) tcAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑ATTATAAAATAATTAAAAGAAATAAAGAAAAAAGCGaatt > 2:3642167/1‑147 (MQ=255) cAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAATAAAACAAGACAATAGCGAtttg > 1:7596427/1‑147 (MQ=255) ttttATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAg < 1:487844/150‑1 (MQ=255) ttttATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAg < 2:5186009/150‑1 (MQ=255) tttATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTAAAAGAAATAAAGACAATAGCGATGTaaatc > 2:5100722/1‑148 (MQ=255) tgtCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAg < 1:2028875/150‑1 (MQ=255) gtCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGt < 2:9684286/150‑1 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTTA‑TTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGACAAAATCGATTTAAATCACAAAttt > 1:4852117/1‑150 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGtt < 2:3122697/150‑1 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGtt < 1:6204929/150‑1 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTAAAATAAATCAAGACAAAAGCGCTGTAAAGCACTAAggt > 1:1533174/1‑148 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTAAAACAAATCAAGAAAAAATAGATTTAAATAACTATGtt > 2:8942573/1‑150 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGttt < 2:6274469/150‑1 (MQ=255) ttttCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTaaa < 1:4540007/150‑1 (MQ=255) ggggAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTgcg < 2:7731247/150‑1 (MQ=255) gggAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTgcgc < 1:7728853/150‑1 (MQ=255) gAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTgcgcgc < 2:954752/150‑1 (MQ=255) ggATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑ATTATAAAATAAATAAAATAAAAAAAAAAAAAAGCGATGTTAAGCACTAAGTTTAAATTTCGCGCCaa > 1:5040176/1‑150 (MQ=255) gATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAAt < 1:1131979/150‑1 (MQ=255) ataGAGAATTAATCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAT‑TTTATAATATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGTTGTATAGCTCTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCAt < 2:9388354/150‑1 (MQ=255) agagATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAAAAAATAAAAGAAATAAAGAAAAAATCGATTTTAAACACAAAGTTTAAATTTGGCGCCAAtgcggg > 1:3055687/1‑145 (MQ=255) gagaTTTAAGCCAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGgc < 1:5872552/150‑1 (MQ=255) agaTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTTATAAAATAATTCAAATAAATCAAGTCAAAAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGgc > 2:8086254/1‑150 (MQ=255) aTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTTTAAAATAAATAAAATAAAAAAATACAAAATAGAAGTAAAGAACAAAGTTTAAATTTCGAGCCCCACAAGgcgcg > 1:6549727/1‑150 (MQ=255) aTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGgcgcg > 2:5343556/1‑150 (MQ=255) aagcaagcATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTTA‑TTTATAAAATAATTAAAATAAAACAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAAATTCGCGCCAAACAAGGCGCGccca > 2:2824118/1‑150 (MQ=255) agcaagcaTATAATTGGAATGTATATTTCGTTCGACCATTCCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACaa < 2:1071284/150‑1 (MQ=255) gcaagcaTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTTA‑TTTATAAAATAAATAAAATAAATAAAAACAAAATCGATGTTAAGCACTAACTTTAATTTTCGCGCCGGGCATGGCGCGCACaaa > 1:1617456/1‑149 (MQ=255) aagcaTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTTA‑TTTATAAAATAATTAAAATAAAAAAATACAAAAGCGAAGTAAAAAACAAAGTTTAAATTTAGCGCCACTCATGGCGCGCACAAGCt > 1:4052503/1‑150 (MQ=255) atttGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATAcc < 2:779123/150‑1 (MQ=255) atttGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTAAAATAAATAAATACAATATCGATGTAAATCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATAcc > 2:8016167/1‑150 (MQ=255) ttGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCaa > 2:2464504/1‑150 (MQ=255) gggATTGTTTTTTTGGTGCGACGTTTGGTTATACATAACTGTGGTTTTTTTAT‑TTTATAAAATAATTATAAGAAATCAAGAAATTCGGGTTTTAACGCATTTTGTTTATTTTGGGCGCCATTCTGGGCGCGCACAAGCTATAATACCAAc < 1:1886027/149‑1 (MQ=255) tGTATTTTTGTTTCGACCTTTGCTTATACTTAACTTTGGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATATTTCAAAGAAATCAAGACTATAGCGATGTAAAGCACTATGTTTAATTTGCGGGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAt < 1:6860091/150‑1 (MQ=255) aTTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAATAAAACAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCGCACGCTATAATACCCACCAAAtgtg > 2:9446343/1‑147 (MQ=255) tttttCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGACAAAAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTTCGCGCCAAACATGGCGCGCACAAGCTATAAAAACAACCTAAtttat > 2:5412777/1‑148 (MQ=255) ttttCGTTCTACCTTTGCTTATACATAACAGTCTTTTTTTTAA‑TTTAAAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATTTAAAGCAATAATTTTAAATGGCGCGCAAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTtctc < 1:1676328/150‑1 (MQ=255) tttCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTTA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcc < 2:2332719/150‑1 (MQ=255) tttCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcc < 2:266988/150‑1 (MQ=255) ttcgttcgACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAAACAAGACAAAAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAATTctcct > 2:7937509/1‑150 (MQ=255) tcgACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCctct < 2:7704648/150‑1 (MQ=255) gACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAAAATCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCGATAATACCAAACAAATTTATCCTCCTCTTa > 2:6240845/1‑150 (MQ=255) ccTTTGATTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAATAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTaga < 1:3688098/150‑1 (MQ=255) ttGCTTATACATAACAGTCTTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTg < 2:7603403/150‑1 (MQ=255) cTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACt < 2:1240253/150‑1 (MQ=255) ttATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAATAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTTCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATAACAACCTAAATTCTCCTCCGCTTAGAGTGACta > 2:577332/1‑150 (MQ=255) tataCATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAATAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACtat < 1:2336280/150‑1 (MQ=255) tataCATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACtat < 1:2418582/150‑1 (MQ=255) aTAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATAtctc < 2:1898536/150‑1 (MQ=255) cAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGa < 1:5670804/150‑1 (MQ=255) gTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCACTCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGaa > 1:7352337/1‑150 (MQ=255) tttttttAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCCATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAAt > 1:3298686/1‑150 (MQ=255) tttttttAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAAt < 2:6990464/150‑1 (MQ=255) tttttttAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAAt > 1:4701860/1‑150 (MQ=255) ttttAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGc < 1:8758203/150‑1 (MQ=255) tttAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCg < 2:73068/150‑1 (MQ=255) tttAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCg > 1:3990907/1‑150 (MQ=255) tttAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCg < 1:7434342/150‑1 (MQ=255) tttAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCg < 2:9120354/150‑1 (MQ=255) tttAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCg < 1:577332/150‑1 (MQ=255) a‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTAt < 2:8330973/150‑1 (MQ=255) tttATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTAtt > 1:3924117/1‑150 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt < 1:972124/150‑1 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt < 1:7982194/150‑1 (MQ=255) aataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTCTAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATc > 2:2195772/1‑150 (MQ=255) aataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATGTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGAAAGAATTGCGGTATTGACTATc > 2:1532718/1‑150 (MQ=255) aataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGCAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATc < 2:1838512/150‑1 (MQ=255) ataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCa > 1:5208218/1‑150 (MQ=255) ataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCa > 1:2981432/1‑150 (MQ=255) aatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCaaa < 2:2916314/150‑1 (MQ=255) ttCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCACTCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg > 1:9262717/1‑150 (MQ=255) ttCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg > 1:8482850/1‑150 (MQ=255) tctaaGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGc < 1:8076137/147‑1 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGc > 2:8208005/1‑150 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGc > 2:8370234/1‑150 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGc < 1:6288633/150‑1 (MQ=255) cAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGcc > 2:7451163/1‑150 (MQ=255) aaaGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGccc > 1:9062487/1‑150 (MQ=255) aaaGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGccc > 1:350289/1‑150 (MQ=255) aaGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCACCCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCt > 2:6833880/1‑150 (MQ=255) aaGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCt > 1:8330182/1‑150 (MQ=255) aaGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCt < 2:38477/150‑1 (MQ=255) aaGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCt > 2:8837377/1‑150 (MQ=255) aGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTg < 2:4113590/150‑1 (MQ=255) gAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGa > 2:6060830/1‑150 (MQ=255) aTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTc < 2:2536935/150‑1 (MQ=255) aTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTc < 2:6870433/150‑1 (MQ=255) | CTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAA‑TTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGT > NC_000913/2470287‑2470585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |