| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,327,213 | C→T | 5.7% | T121I (ACC→ATC) | rluB → | 23S rRNA pseudouridine(2605) synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,327,213 | 0 | C | T | 5.7% | 286.5 / 4.3 | 91 | T121I (ACC→ATC) | rluB | 23S rRNA pseudouridine(2605) synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/45); new base T (2/3); total (42/49) | |||||||||||
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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CTATTACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTAAAA > NC_000913/1327064‑1327362 | cTATTACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTcaccac > 1:73596/1‑150 (MQ=255) tATTACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGCTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCaccacc > 1:814126/1‑150 (MQ=255) aCAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATg < 1:1260554/150‑1 (MQ=255) 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ggctgctgctgTGCACCACCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATg < 2:1426174/148‑1 (MQ=255) tCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATgg > 2:788308/1‑150 (MQ=255) gctgctgTTCACCACCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTTCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTcc > 2:138813/1‑150 (MQ=255) tgctgTTCACCACCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAGCGTGACTGTGCCGTGCGTGTATTTGGGCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGGTGGTAGATGGTCCgg > 1:1209488/1‑150 (MQ=255) cagTTCACCATCGGTGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCCCCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGTAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCa > 1:1146446/3‑150 (MQ=255) ccaccGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTATTGCACCCACGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGGGCGTGTAGTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCttttt > 2:1512746/1‑149 (MQ=255) ccaccGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTa > 1:1281904/1‑150 (MQ=255) ccaccGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTa > 1:686924/1‑150 (MQ=255) ccaccGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTa > 1:583870/1‑150 (MQ=255) caccGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATGTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTaa > 1:1757917/1‑150 (MQ=255) caccGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGCGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTaa < 2:1857831/150‑1 (MQ=255) caccGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAAAGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGGCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTTGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTaa < 1:1496268/150‑1 (MQ=255) accGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGGCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTaaa < 2:1633262/150‑1 (MQ=255) accGATGGTGAACTGGCAAAACGTTTAATGCACCCAATCCGTGAATTTGATCGTGAATATGCCGTGCGTGTATATGGTCAGGTTTACTACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTGGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTaaa < 2:1381291/150‑1 (MQ=255) accGAGGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTaaa < 1:1068150/150‑1 (MQ=255) ccGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTaaaa < 2:660437/150‑1 (MQ=255) ccGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTaaaa > 2:390154/1‑150 (MQ=255) | CTATTACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTAAAA > NC_000913/1327064‑1327362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |