| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,434,310 | C→T | 5.1% | intergenic (‑86/+648) | ynaE ← / ← ttcC | cold shock protein, Rac prophage/pseudogene, prophage Rac integration site ttcA duplication;Phage or Prophage Related |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,434,310 | 0 | C | T | 5.1% | 222.2 / 2.3 | 78 | intergenic (‑86/+648) | ynaE/ttcC | cold shock protein, Rac prophage/pseudogene, prophage Rac integration site ttcA duplication;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/39); new base T (2/2); total (37/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 | |||||||||||
CCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCC > NC_000913/1434198‑1434459 | ccACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTaga > 1:1566061/1‑150 (MQ=11)ccACTTTAGGGTCTCTTATGATTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATAGTATGTCTGATTCAGGATATATTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCATAATTTTATTaga > 2:1605813/1‑150 (MQ=11) ggTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGAATGACTa > 2:367580/1‑150 (MQ=17) tgtCTTTTGATTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTaaa > 1:1558249/1‑150 (MQ=32) gtCTTTTGATTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGACAATCCCTAATTTTATTAGAGAATGACTaaaa > 1:804545/1‑150 (MQ=17) cTTTTGATTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAAt < 1:1849698/150‑1 (MQ=32) tttGATTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGc < 2:835560/150‑1 (MQ=32) tttGATTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGc < 1:1595682/150‑1 (MQ=32) tGATTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTg < 2:1805713/150‑1 (MQ=32) ttttCATGAATATATTACTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCATAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGaa < 1:1286977/149‑1 (MQ=12) ttttCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATTTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGaa < 1:1293788/149‑1 (MQ=17) aTTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGaa < 2:145859/150‑1 (MQ=32) aTTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGaa < 2:1348357/150‑1 (MQ=32) tttCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAat < 1:1577870/150‑1 (MQ=32) tttCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCACTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAat > 1:802048/1‑150 (MQ=17) ttCATGAATATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAata < 1:1784305/150‑1 (MQ=17) ttCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAata > 1:955308/1‑150 (MQ=32) ttCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAata > 1:1553107/1‑150 (MQ=32) aTGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGa > 2:1628775/1‑150 (MQ=32) gAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGAAATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGTTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATa > 2:986902/1‑150 (MQ=17) tatTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCATGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCTTGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAg < 1:191378/150‑1 (MQ=17) atTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATTCATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGc < 1:731405/150‑1 (MQ=17) atTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGc < 1:457936/150‑1 (MQ=32) tCCTTAAAATATTATTGCTTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGCTTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGa < 2:175921/150‑1 (MQ=21) ccTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGaa > 2:6398/1‑150 (MQ=35) ccTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGaa > 1:558300/1‑150 (MQ=35) ccTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGaa > 2:374461/1‑150 (MQ=35) tAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTg < 2:1098477/150‑1 (MQ=37) aaaaTATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTCTGTCTGATTCATGTTATGTAGTCTTTTACATCTGTTTTGTCTGGGTTATTGGATAAGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGa < 1:1171009/150‑1 (MQ=11) aaTATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGGTATGGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGAtt < 1:1422220/150‑1 (MQ=255) ttGATTTTCATTGCGATCTTGTATGGCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTa < 1:456314/150‑1 (MQ=255) gATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGAGAAGTGATTATCAGTATg > 1:757487/1‑150 (MQ=17) aTTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGc < 1:1379419/150‑1 (MQ=37) aTTGCGATATTGTATGTCTGTTTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCa < 2:1535491/150‑1 (MQ=37) aTTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGAGTTATACATCGGTTTTGTCTTGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTCTTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGATCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCa < 2:616573/150‑1 (MQ=255) aTTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCa > 2:1776918/1‑150 (MQ=37) tGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTTGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCata > 2:1493880/1‑150 (MQ=37) tGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCATAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATTCTGAATATGATAAGGAGCGAATTGATTATCAGTATGCTCTTCata > 1:33574/1‑150 (MQ=255) atatTGTATTTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGTGTTATTCGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGc < 1:312034/150‑1 (MQ=255) ttGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTc > 1:1454342/1‑150 (MQ=37) tGTATGTCTGATTCAGGCTATGATGACTTATACATCGGTTTTCTCTGGCTTCTTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGAAAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATAAAGCCTCg < 2:1153404/150‑1 (MQ=11) tGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCg > 2:570714/1‑150 (MQ=37) tGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCg < 2:1583524/150‑1 (MQ=37) tGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATCAAAAGGAGCGAAGTGATTATCAGAATGCTGTTCATATAGCCTCg < 2:1851831/150‑1 (MQ=255) gTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGa < 1:1068082/150‑1 (MQ=37) aTGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAAt < 1:1730191/150‑1 (MQ=37) gTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTTTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTa > 1:264115/1‑150 (MQ=37) gTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTTTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTa > 1:1099233/1‑150 (MQ=37) gTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCACTCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGATGTTCATATAGCCTCGAAtaa > 2:158746/1‑148 (MQ=255) gTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTa > 1:418245/1‑150 (MQ=37) gTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTa < 1:1359408/150‑1 (MQ=37) tCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAg > 1:1080134/1‑150 (MQ=37) ttGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGt < 1:1079832/149‑1 (MQ=37) aTTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 2:1600498/150‑1 (MQ=37) taGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtgtg > 2:651954/2‑150 (MQ=37) cggATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGCTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAATATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATgtgt < 1:884325/149‑1 (MQ=255) aGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATgtgt < 2:378506/150‑1 (MQ=37) ggATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTTTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGtt < 2:1099233/150‑1 (MQ=37) ggATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTTTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGtt < 2:264115/150‑1 (MQ=37) gATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTTTta > 2:232603/1‑150 (MQ=37) gATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTta > 2:1037223/1‑150 (MQ=37) atGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtatat > 2:730525/1‑150 (MQ=37) tGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtatata > 2:27373/1‑150 (MQ=37) ttGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATg < 1:676300/150‑1 (MQ=37) tGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGa < 2:1212783/150‑1 (MQ=37) tGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGa > 1:808085/1‑150 (MQ=37) taCTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGat < 1:778527/149‑1 (MQ=37) gACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGat < 2:272777/150‑1 (MQ=37) gACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGat > 2:536853/1‑150 (MQ=37) aCTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGata < 2:655881/150‑1 (MQ=37) cTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGatat > 1:194260/1‑150 (MQ=37) tataCATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAg < 2:235504/150‑1 (MQ=37) ataCATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATTACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGt < 1:981344/150‑1 (MQ=37) aCATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTg > 2:1058895/1‑150 (MQ=37) cATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCTTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGa > 1:901696/1‑150 (MQ=37) cATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGAGTTATATATGATAAAGTTGa > 1:235962/1‑150 (MQ=255) aTCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGAc > 1:1483851/1‑150 (MQ=37) cGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACaa > 2:513392/1‑150 (MQ=37) cTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTTTTATATATTATATAGTTGACAATTTTTATca > 2:1382240/1‑149 (MQ=255) | CCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCCTTAAAATATTATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCC > NC_000913/1434198‑1434459 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |