Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,009,731 | A→G | 5.1% | intergenic (+19/‑90) | yedF → / → yedK | putative TusA family sulfurtransferase/DUF159 family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,009,731 | 0 | A | G | 5.1% | 339.7 / 5.5 | 116 | intergenic (+19/‑90) | yedF/yedK | putative TusA family sulfurtransferase/DUF159 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/59); new base G (3/3); total (53/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.07e-01 |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
AATCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGCG > NC_000913/2009583‑2009877 | aaTCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGAc < 2:1867814/150‑1 (MQ=255) tCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGAccc < 1:542714/150‑1 (MQ=255) tCCTGGAAGGGGTGAGAGACTGTCCGCAGTCGATCAATTATCTTCCACTGTATGCGCGTAATCAAGGCTATACGGTGCTGCATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGGTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGAccc < 2:148291/150‑1 (MQ=255) 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aGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATAACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAg > 1:931110/1‑150 (MQ=255) aTCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACACTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTa < 2:582294/150‑1 (MQ=255) cccTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTAcc > 1:1235311/1‑150 (MQ=255) ccTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTAGCTTTGTATCAGATAGAGTTTACCCGCCCCCCCGCCTATTCGTTTGAGTATGAGCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGGCCAATCCCAACCGCGTGAAGATTAGCt > 2:512799/1‑150 (MQ=255) ccTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTATAAGTATGATCTAAGGAGGTATCTATTAGTGGACGCTTTGCACAATCCATAACGCGTGAAGATTACCt > 2:1260559/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |