Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,009,733 | C→T | 5.3% | intergenic (+21/‑88) | yedF → / → yedK | putative TusA family sulfurtransferase/DUF159 family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,009,733 | 0 | C | T | 5.3% | 349.7 / 4.4 | 112 | intergenic (+21/‑88) | yedF/yedK | putative TusA family sulfurtransferase/DUF159 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (49/56); new base T (3/3); total (53/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGCGGAAGA > NC_000913/2009585‑2009882 | tCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGAccc < 1:1721115/150‑1 (MQ=255) tCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGAccc < 1:542714/150‑1 (MQ=255) tCCTGGAAGGGGTGAGAGACTGTCCGCAGTCGATCAATTATCTTCCACTGTATGCGCGTAATCAAGGCTATACGGTGCTGCATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGGTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGAccc < 2:148291/150‑1 (MQ=255) 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cccTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTAcc > 1:1235311/1‑150 (MQ=255) ccTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTAGCTTTGTATCAGATAGAGTTTACCCGCCCCCCCGCCTATTCGTTTGAGTATGAGCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGGCCAATCCCAACCGCGTGAAGATTAGCt > 2:512799/1‑150 (MQ=255) ccTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTATAAGTATGATCTAAGGAGGTATCTATTAGTGGACGCTTTGCACAATCCATAACGCGTGAAGATTACCt > 2:1260559/1‑150 (MQ=255) cTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCtt < 2:1369652/150‑1 (MQ=255) cATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGGTTCTATGTGTGGCCGCTGTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgc > 1:565323/1‑150 (MQ=255) 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cccACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGCGGAAg > 2:879035/1‑150 (MQ=255) ccACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGCGGAAGa > 2:1214592/1‑150 (MQ=255) | TCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGCGGAAGA > NC_000913/2009585‑2009882 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |