Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,062,356 | C→A | 7.5% | intergenic (+21/+35) | asnV → / ← ldtA | tRNA‑Asn/L,D‑transpeptidase linking Lpp to murein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,062,356 | 0 | C | A | 7.5% | 308.4 / 13.7 | 107 | intergenic (+21/+35) | asnV/ldtA | tRNA‑Asn/L,D‑transpeptidase linking Lpp to murein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (57/42); new base A (4/4); total (61/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.34e-01 |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCA > NC_000913/2062209‑2062503 | cccTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTa > 2:1532954/1‑150 (MQ=255) ccTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAg < 2:1841977/150‑1 (MQ=255) cTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGc > 1:710886/1‑150 (MQ=255) cATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑tt > 1:1747762/1‑150 (MQ=255) aTCACCATGCACTGCCATTAATCTGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTTCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑ttt < 1:1256653/150‑1 (MQ=255) cACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑ttttt > 2:1663541/1‑150 (MQ=255) aCCATGCACTGCCAATAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTAGAAAGCAGGC‑tttttt < 1:690985/150‑2 (MQ=17) cATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTAGAAAGCAGGC‑ttttttga < 1:1669176/150‑4 (MQ=17) cATGCACTGCCATTAAAATGCGCCCCGTTCACCCGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGATCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTAGAAAGCAGGC‑ttttttga < 1:646982/150‑4 (MQ=17) tGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCttt < 2:1092458/150‑1 (MQ=255) tGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCttt < 1:655723/150‑1 (MQ=255) gCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTc < 2:936863/150‑1 (MQ=255) cACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATACCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGCACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCt > 2:1045057/1‑150 (MQ=255) acggCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGAAGTTCAGTCGGTAGAACGGCTGACTGTTAATCAGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTa < 2:67712/147‑1 (MQ=255) aCTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTa < 2:1048320/150‑1 (MQ=255) gCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGCCTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCGAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTTCTTTCTTGCAGGC‑TGTTTGCTTTCTAAtt > 1:408709/1‑150 (MQ=18) gCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAAtt > 2:521263/1‑150 (MQ=255) cATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTAc > 2:1309093/1‑150 (MQ=255) cATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTGAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCGGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTAc > 1:16586/1‑150 (MQ=255) tAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCaa < 1:101507/150‑1 (MQ=255) tGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTATAACGGCGGCCTGTTAATCCGTATGTCACTGGGTCGAGTCCAGTCCGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGctc > 1:324320/1‑150 (MQ=255) gcCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTa < 1:87027/150‑1 (MQ=255) ccccGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGATCTTaa > 1:1480348/1‑150 (MQ=255) cccGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTaaa < 1:1165352/150‑1 (MQ=255) cccGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTaaa > 1:1198677/1‑150 (MQ=255) cccGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTaaa < 2:461320/150‑1 (MQ=255) cGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAAc < 2:1747762/150‑1 (MQ=255) cGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAAc < 2:1025610/150‑1 (MQ=255) acacGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTg < 2:1711338/150‑1 (MQ=255) ttCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGa < 1:594582/150‑1 (MQ=255) ttCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGa < 1:602557/150‑1 (MQ=255) ttCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGa < 2:752221/150‑1 (MQ=255) ccTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAAc > 1:1831535/1‑150 (MQ=255) ctctGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCAGCTATCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTATTAAAACATCTGTCTTTAAca > 2:1846533/1‑149 (MQ=255) ctGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAg < 2:440287/150‑1 (MQ=255) tAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAAc < 2:732666/150‑1 (MQ=255) gTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTATTGCACCAGAACTa > 1:1837091/1‑150 (MQ=255) gTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TATTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTa > 1:1844258/1‑150 (MQ=255) cAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAAtt > 1:1760121/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAAttt > 1:1382137/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAAATCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCGCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAAttt < 2:1672315/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGGAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTATAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTg < 2:1745159/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTg < 1:1869466/150‑1 (MQ=255) cGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGca > 1:1493432/1‑150 (MQ=255) gTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGcaca < 2:411223/150‑1 (MQ=255) gAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCACCGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGc > 2:176153/1‑150 (MQ=255) gAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGc > 2:1828496/1‑150 (MQ=255) gAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGc > 1:564053/1‑150 (MQ=255) aCGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTATTAAAACATCTGTCTTGAACCAGATCTAATTTTAACAGGCAt > 2:892534/1‑150 (MQ=255) cggcggACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCAtt > 1:833288/1‑150 (MQ=255) ggcggACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCCGAACTAATTTGCACAGGCATTc > 2:1195978/1‑150 (MQ=255) ggcggACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TGTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTc > 2:276465/1‑150 (MQ=255) gcggACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTcc < 2:1214654/150‑1 (MQ=255) gcggACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTcc < 2:473130/150‑1 (MQ=255) cTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACAAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGAtg > 2:1436380/1‑149 (MQ=255) tGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCg > 1:1235198/1‑150 (MQ=255) gTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGa < 2:1035274/150‑1 (MQ=255) gTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGACAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGa > 2:1001640/1‑150 (MQ=255) tAATCCGTATGTCACTGGTTAGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGATTTCTAGCAGTC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCAGATCGACg > 1:252649/1‑150 (MQ=255) cGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCa > 2:997023/1‑150 (MQ=255) gTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTCAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCaa < 2:701820/150‑1 (MQ=255) gTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACgca > 1:1112550/1‑150 (MQ=255) gTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACgca > 1:1301948/1‑150 (MQ=255) tCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCGCAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACgcag > 2:1792297/1‑150 (MQ=255) tCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTgcg > 2:1627178/1‑150 (MQ=255) tCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTgcg < 2:1812160/150‑1 (MQ=255) gAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGcgcg > 1:1467903/1‑150 (MQ=255) gAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGcgcg > 2:379535/1‑150 (MQ=255) aGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCAGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGa > 2:1572178/1‑150 (MQ=255) tCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGAtt > 1:562109/1‑150 (MQ=255) gTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACa < 1:995985/150‑1 (MQ=255) tCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACAt < 2:1480348/150‑1 (MQ=255) gaggagCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCaa > 1:768471/1‑150 (MQ=255) ggagCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTAGCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAAct < 2:324320/150‑1 (MQ=255) gagCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCACTATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAActt > 2:946930/1‑150 (MQ=255) ccAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTGTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAActtctt < 2:677940/150‑1 (MQ=255) ccAAATTCAAAAAAGCCAGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACGAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAActtctt < 2:1237006/150‑1 (MQ=255) cAAAATCAAACAACCCTGCTTTCTAGCATGC‑TTTTTGCTTTCAAATTACCACCGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGACCTAATTTGCACAGGCAGTCACGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTg < 2:243167/150‑1 (MQ=255) aaaTTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGc > 2:1784173/1‑150 (MQ=255) aTTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGccc > 2:1812321/1‑150 (MQ=255) aTTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGccc > 1:545729/1‑150 (MQ=255) aTTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATATGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAAGTTCTTGcgc > 2:365269/1‑148 (MQ=255) gcaaaaaGCCTGCTAGAAAGCAGGCTTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGt > 2:466593/3‑150 (MQ=255) cAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGtt > 1:243538/1‑150 (MQ=255) cAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTGGCGCGATTTACATCAACTTCTTGACAGtt > 1:457627/1‑150 (MQ=255) cAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATAGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCACGtt > 1:953746/1‑150 (MQ=255) caaaaaGCCTGCTAGAAAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTg > 2:1297183/2‑150 (MQ=255) caaaaaGCCTGCTAGAAAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTg > 2:1261600/2‑150 (MQ=255) aaaaaaGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTg < 2:481862/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTg < 1:1001640/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCCTGCTAGAAAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATTGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGa > 1:1496244/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCTACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCTATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATa > 1:1278125/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAAATACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGAtgt < 2:507346/150‑3 (MQ=255) gCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAAc < 2:1524519/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTGTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGATCCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATaaaa > 1:85907/1‑149 (MQ=255) ccTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACg < 2:476366/150‑1 (MQ=255) tGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGcc > 1:1764097/1‑150 (MQ=255) gCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGccc > 2:1597683/1‑150 (MQ=255) cTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCg > 1:1032929/1‑150 (MQ=255) ttCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCa < 1:715843/150‑1 (MQ=255) | CCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCA > NC_000913/2062209‑2062503 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |