| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,512,729 | T→A | 5.3% | intergenic (‑23/‑313) | mntH ← / → nupC | manganese/divalent cation transporter/nucleoside (except guanosine) transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,512,729 | 0 | T | A | 5.3% | 372.2 / 7.0 | 126 | intergenic (‑23/‑313) | mntH/nupC | manganese/divalent cation transporter/nucleoside (except guanosine) transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (59/59); new base A (2/5); total (61/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GAATATTGGTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTAC > NC_000913/2512580‑2512876 | gAATATTGGTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCt > 2:1365562/1‑150 (MQ=255)gAATATTGGTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCt > 1:1751600/1‑150 (MQ=255) ttGGTCGCAAAGTTACCGGGATCGATAAAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCt < 2:833394/150‑1 (MQ=255) ggTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGAGCGCAGCCCGTCCGCAGCAACTCTCAAATCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTAt > 1:1876074/1‑150 (MQ=255) gTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATg < 2:588302/150‑1 (MQ=255) tCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGt > 2:1090529/1‑150 (MQ=255) cGCAAAGTTACCGGTATCGATATAACCAATCGCCGCAATTAACGCAGGTACGATTAATGAGAGCCTCATCTTGCGCGCCTCCCGTCAGCTGCTACTATCAACGCTATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGtt < 2:1335764/150‑1 (MQ=255) cGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGtt < 1:137975/150‑1 (MQ=255) cGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACAACTCGCCGCAATGAACGCCGGTCCCATTAATGCGAGACTCATGTTGCGCGGCGCCAGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGtt < 2:939817/150‑1 (MQ=255) gCAAAGTTACCGGGATCGGTATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGttt < 1:586049/150‑1 (MQ=255) cAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCAAAGGCTATGtttt < 2:486849/150‑2 (MQ=255) cAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCAAAGGCTATGtttt < 2:697500/150‑2 (MQ=255) cAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGACGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATTCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTc < 1:534422/150‑1 (MQ=255) aaGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCAt < 1:380722/150‑1 (MQ=255) aGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATg < 1:1495376/150‑1 (MQ=255) aGTTAACGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATg < 2:940596/150‑1 (MQ=255) ttACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCAAAGGCTATGttttagagg < 1:750566/150‑7 (MQ=255) ccGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATg > 1:1134069/1‑150 (MQ=255) ccGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGGTTCATGCTATg > 1:491185/1‑150 (MQ=255) ccGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCATCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATg > 2:1737041/1‑150 (MQ=255) ggATCGATATAACCAATCTCCGCAATGAACGCAGGTCCCATAAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCa < 1:94710/150‑1 (MQ=255) ggATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCa > 1:115144/1‑150 (MQ=255) tCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAAc > 1:1864779/1‑150 (MQ=255) tCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAAc > 2:1057332/1‑150 (MQ=255) gATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACga > 1:1411596/1‑150 (MQ=255) atatAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACgag > 2:780198/1‑150 (MQ=255) atatAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACgag < 2:124943/150‑1 (MQ=255) taACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTCCCTCTAAAACATAGACTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCCAACGAGAAt > 2:534219/1‑150 (MQ=255) cAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGAtt > 1:1075408/1‑150 (MQ=255) cAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCACCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGACAATGAtt > 1:848813/1‑150 (MQ=255) aTCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAGAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTAt < 1:877746/150‑1 (MQ=255) ccgcAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCaaa > 1:515804/1‑150 (MQ=255) ccgcAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCaaa > 2:138870/1‑150 (MQ=255) ctcactGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGAGCGCAGCCCGTCCGCTGATACTATCAACTCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAAt < 1:1082903/145‑1 (MQ=255) gcAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCCTCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCACAtt > 1:124266/1‑150 (MQ=255) cAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTc > 2:476765/1‑150 (MQ=255) aaTGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCa > 2:1772694/1‑150 (MQ=255) aaCGAAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATATTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAAGTCAATTa > 2:518714/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAAt < 1:1707644/150‑1 (MQ=255) cccATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATtg < 2:781777/150‑1 (MQ=255) cccATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTAGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCAATAAAATGGATtg > 2:474581/1‑150 (MQ=255) ttAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTgtggt < 2:852946/150‑1 (MQ=255) tGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGAtt < 2:791736/150‑1 (MQ=255) ccTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTg < 1:138870/150‑1 (MQ=255) ccTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTg < 2:572291/150‑1 (MQ=255) cTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCCTCTTGTGCCTCTAAAACATCGCCTTTGCTATGGTTCCTGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTTAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGa > 2:278797/1‑150 (MQ=255) cTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGa < 2:1134069/150‑1 (MQ=255) tCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGAt < 2:669015/150‑1 (MQ=255) tCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGa > 2:1321957/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGAcc < 2:393535/150‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGATATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCa > 2:1102970/1‑150 (MQ=255) gccgccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGAtt < 1:3257/150‑1 (MQ=255) gccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATg < 2:49583/150‑1 (MQ=255) gccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATg < 2:734912/150‑1 (MQ=255) gTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTa < 2:119335/150‑1 (MQ=255) aCTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACAAAGCCTTAGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGAtt < 2:639167/150‑1 (MQ=255) tctcAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGATAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATtga < 2:1276157/150‑1 (MQ=255) cAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAATATtgatga > 1:1236511/1‑150 (MQ=255) cgcgATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAATTGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAATATTGATGACtt > 1:1832761/1‑150 (MQ=255) cgcgATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACtt < 1:499674/150‑1 (MQ=255) cgcgATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACtt > 1:1791350/1‑150 (MQ=255) tAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATg < 2:1459732/150‑1 (MQ=255) tAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATg < 1:386816/150‑1 (MQ=255) aGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAAttt > 2:829038/1‑148 (MQ=255) aGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATCTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgt > 2:694003/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATAATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgtt > 2:1425031/1‑150 (MQ=255) ttCATCTTGTGCCTCTAAAAAATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGTTTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAACGATTGATGACTTGAATgttatgg < 2:1360450/149‑1 (MQ=255) gTCATCTTGTGCCTCTATAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAATCGAGAATGATTATCTAATTCATTTAATTGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatgg < 1:474581/150‑1 (MQ=255) gTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatgg > 1:1104237/1‑150 (MQ=255) gTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatgg < 2:1751600/150‑1 (MQ=255) cATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatggtt > 2:960365/1‑150 (MQ=255) cATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatggtt > 2:1790578/1‑150 (MQ=255) aTCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGATTgttatggtta > 1:432128/1‑150 (MQ=255) ctagtgCCTCTAAAACATAGCCGTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatggttatg < 1:91237/147‑1 (MQ=255) tgtgCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGtt > 1:1309510/1‑150 (MQ=255) gttccTCTTATACATATCATTTTCTATGTTTCATGCTATGCCATACGAGTATGATAATCAAATTCATTTAAAAGGATTGTGGTGATTGCTTTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAATATTGATGAATTGAATGTTATGGTTATGttt < 2:1733702/147‑1 (MQ=255) tgCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTa > 2:1235733/1‑150 (MQ=255) gCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGTTTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTaa > 1:965285/1‑150 (MQ=255) ccTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAAt > 2:349004/1‑150 (MQ=255) gcatgaaaCATAGCAAAGGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATg > 1:1328900/6‑150 (MQ=255) ctctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATTATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGGTATGTTTAATg < 1:518714/150‑1 (MQ=255) ctctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTGATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATg < 2:4645/150‑1 (MQ=255) ctctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATg > 1:1197086/1‑150 (MQ=255) ctctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATg < 2:491185/150‑1 (MQ=255) tctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGt > 2:1610066/1‑150 (MQ=255) ctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGtt > 2:1048917/1‑150 (MQ=255) ctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACAAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTTATTGTTATGGTTATGTTTATTGtt > 1:1245644/1‑150 (MQ=255) atgaaaCATAGCAAAGGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGtt > 1:437299/4‑150 (MQ=255) tAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTa < 2:115144/150‑1 (MQ=255) aaaaCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAg < 1:938537/150‑1 (MQ=255) aaaaCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATAATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAg < 2:507743/150‑1 (MQ=255) aaaaATAGCTTTTGCTATGTTTCATGGTATTCAAAACGAGAATTATTATCAAATTCATTTTAATGGATTGTGGTGTTTTCTCTTATAGACCAGGATTATTACTACGATAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGc < 1:893677/150‑1 (MQ=255) aaaCATTGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGACAATCGAGAATGATTATCAAATTCATTTATATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTTAGAATAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGc < 1:935169/150‑1 (MQ=255) aaCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGATATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGAGTACGAGAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGca < 1:534219/150‑1 (MQ=255) aTAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACAt > 1:427732/1‑150 (MQ=255) aGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACAttt < 1:1693796/150‑1 (MQ=255) aGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACAttt > 2:802213/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTa > 2:1691870/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTa > 1:615622/1‑150 (MQ=255) ccTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTaa > 1:693074/1‑149 (MQ=255) | GAATATTGGTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTAC > NC_000913/2512580‑2512876 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |