Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 209,171 | A→G | 5.0% | N184S (AAC→AGC) | accA → | acetyl‑CoA carboxylase, carboxytransferase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 209,171 | 0 | A | G | 5.0% | 268.6 / 3.0 | 98 | N184S (AAC→AGC) | accA | acetyl‑CoA carboxylase, carboxytransferase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/49); new base G (2/3); total (46/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |