| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,834,232 | C→G | 5.2% | T107T (ACC→ACG) | norW → | NADH:flavorubredoxin oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,834,232 | 0 | C | G | 5.2% | 412.8 / 7.9 | 127 | T107T (ACC→ACG) | norW | NADH:flavorubredoxin oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (63/57); new base G (5/2); total (68/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
ACCTTACCCGCCAGACGGCGGGTGAATTTGCCGAGCAGTTTAATCTGCACCTGTTTCCACAAACCTGGGTGACGGATATCGATGCCGAAGCCCGTGTGGTGAAAAGCCAGAATAATCAGTGGCAATACGACAAGCTAGTACTGGCAACCGGTGCCAGTGCCTTTGTCCCGCCTGTGCCTGGGCGTGAGTTAATGCTGACGTTAAATAGTCAGCAAGAGTATCGCGCCTGTGAAACGCAACTGCGGGATGCCCGACGCGTGTTGATTGTTGGCGGTGGTTTGATTGGTAGCGAACTGG > NC_000913/2834084‑2834380 | aCCTTACCCGCCAGACGGCGGGTGAATTTGCCGAGCAGTTTAATCTGCACCTGTTTCCACAAACCTGGGTGACGGTTATAGATGCCGAAGCCCGTGTGGTGAAAAGCCAGAATAATCAGTGGCAATACGACAAGCTAGTACTGGCAACCg < 1:1197752/150‑1 (MQ=255) ccTTACCCGCCAGACGGCGGGTGAATTTGCCGAGCAGTTTAATCTGCACCTGTTTCCACAAACCTGGGTGACGGATATCGATGCCGAAGCCCGTGTGGTGAAAAGCCAGCATAATCAGTGGCAATACGACAAGCTAGTACTGGCAAcctg > 1:465988/1‑148 (MQ=255) ccTTACCCGCCAGACGGCGGCTGAATTTGCCGAGCAGTTTAATCTGCCCCTGTTTCCACAAACCTGGGTGACGGATATCGATGCCGAAGCCCGTGTGGTGAACAGCCAGAATAATCAGTGGCAATACGACAAGCTAGTACTGGCAACCgg > 2:1075517/1‑150 (MQ=255) 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aCCGGTGCCCGTGCCTTTGTCCCGCCTGTGCCTGGGCGTGAGTTAATGCTGACGTTAAATAGGCAGCAAGAGTATCGCGCCTGTGAAACGCAACTGCTGTATGCCCGTCGCGTGTTGATTGTTGGCGGTGGTGTGATTTGTAGCGATCTg < 2:1329554/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCCAGTGCCTTTGTCCCGCCTGTGCCTGGGCGTGAGTTAATGCTGACGTTAAATAGTCAGCAAGAGTATCGCGCCTGTGAAACGCAACTGCGGGATGCCCGACGCGTGTTGATTGTTGGCGGTGGTTTGATTGGTAGCGAACTgg < 2:806598/150‑1 (MQ=255) | ACCTTACCCGCCAGACGGCGGGTGAATTTGCCGAGCAGTTTAATCTGCACCTGTTTCCACAAACCTGGGTGACGGATATCGATGCCGAAGCCCGTGTGGTGAAAAGCCAGAATAATCAGTGGCAATACGACAAGCTAGTACTGGCAACCGGTGCCAGTGCCTTTGTCCCGCCTGTGCCTGGGCGTGAGTTAATGCTGACGTTAAATAGTCAGCAAGAGTATCGCGCCTGTGAAACGCAACTGCGGGATGCCCGACGCGTGTTGATTGTTGGCGGTGGTTTGATTGGTAGCGAACTGG > NC_000913/2834084‑2834380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |