| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,288,032 | 0 | C | A | 5.6% | 358.3 / 7.2 | 122 | intergenic (+22/‑58) | yraH/yraI | putative fimbrial‑like adhesin protein/putative periplasmic pilin chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/72); new base A (3/4); total (46/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATCACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAACCTTGTTGTGTAGCTTCTGTATTGGCCAGGCGCTTGCAGGAGGAATCGTTTTACAGCGAAC > NC_000913/3287883‑3288181 | tCCCGGCGGAATCCAATGGTTTTTTTATTGTTGACCTCATCGCTTACTACGAATGAAGCGTTGTTCCATCAGAAATCACCCCAGGGGAATCAGATGCTATCGGAAACGTACCGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGAcc < 1:1642728/150‑1 (MQ=255) cggcggAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATCACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGt > 2:515987/1‑150 (MQ=255) cAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTTTCAACCGTAGTTCCATCAGAAATCACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGATGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACAGGTCAGATAACGc < 2:208396/150‑1 (MQ=255) 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aaaTACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAACCTTGTTGTGTAGCTTCTGTATTGGCCAGGCGCTTGc < 1:743698/149‑1 (MQ=255) tACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAACCTTGTTGTGTAGCTTCTGTATTGGCCAGGCGCTTGCagg < 2:1762306/150‑1 (MQ=255) tACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAACCTTGTTGTGTAGCTTCTGTATTGGCCAGGCGCTTGCagg < 2:1485774/150‑1 (MQ=255) cGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTACTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAAGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCCGTGATATTAACCTTGTTGTGTAGCTTCTGTATTGGCCAGGCGCTTGCaggag > 1:572423/1‑150 (MQ=255) cGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTGTTCCTACCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAACCTTGTTGTCTAGCTTCTGTATTGGCCAGGCGCTTGCaggag > 1:303454/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |