| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,423,531 | T→G | 6.2% | noncoding (12/120 nt) | rrfF ← | 5S ribosomal RNA of rrnD operon |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,423,531 | 0 | T | G | 6.2% | 235.4 / 5.9 | 81 | noncoding (12/120 nt) | rrfF | 5S ribosomal RNA of rrnD operon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (13/63); new base G (3/2); total (16/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.62e-01 | |||||||||||
CAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGT > NC_000913/3423382‑3423679 | cAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACt < 1:1760536/150‑1 (MQ=38) aaaGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTgc < 2:399291/150‑1 (MQ=37) aGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCCCACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGgccg > 2:60942/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTgccg < 2:1845327/150‑1 (MQ=37) aGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGgccg > 2:1009880/1‑150 (MQ=37) gCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTgccgcc < 2:1049245/150‑1 (MQ=37) cccAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCa < 1:428820/150‑1 (MQ=37) ccAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAg < 1:1571481/150‑1 (MQ=37) cAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGa > 2:259938/1‑150 (MQ=38) cAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGa < 1:15825/150‑1 (MQ=38) aGTCTTCAGACTGAGCCTTTTGGTTTATTTGATGTCTGGCAGTTACCTACTCTCGCATGGTGATACCCCACACTAACATCGGCGCTACGGCGTTTCCAGTCTGAGTTCGGAATGGCGTCAGGTGGGACCACCGCTCTAATGCAGCCAGAc > 2:1194603/1‑150 (MQ=11) gTCTTCCGCCTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCa < 1:1127677/150‑1 (MQ=255) gTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCa > 2:1127677/1‑150 (MQ=21) tGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTc < 1:570880/150‑1 (MQ=40) tGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTc < 2:168980/150‑1 (MQ=40) tGAGCCTTTTGTTGTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTTCTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTc < 2:790891/150‑1 (MQ=255) aGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTa < 1:1572085/150‑1 (MQ=255) ttGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGc < 1:1452103/150‑1 (MQ=255) tGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGcc < 2:703792/150‑1 (MQ=255) gTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCg < 2:52278/150‑1 (MQ=255) tGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTaa < 2:351907/150‑1 (MQ=255) tGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTaa < 2:796994/150‑1 (MQ=255) aTGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAAcc < 1:1121613/150‑1 (MQ=255) ggCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTaaaaa < 2:814523/150‑1 (MQ=255) gTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCTTCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGTGTCAGGTGGGACCACCGCTCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAgtgg < 1:552468/150‑1 (MQ=255) ttCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAgtggt < 1:1641384/150‑1 (MQ=255) ttCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGCCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAgtggt < 2:474536/150‑1 (MQ=255) tctcGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATAc > 2:1308529/1‑150 (MQ=255) cATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCaga < 2:1856142/150‑1 (MQ=255) cATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGACGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCaga > 2:1733705/1‑150 (MQ=255) aTGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCAGTTCTGAGTTCGGCATGGGGGCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCagag < 2:786443/150‑1 (MQ=255) aTGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCagag < 2:875796/150‑1 (MQ=255) ggggAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTc < 1:259938/150‑1 (MQ=255) gggAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCg < 2:812451/150‑1 (MQ=255) ggAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTGTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGa < 2:52415/150‑1 (MQ=255) gagaCCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGaa < 2:1702642/150‑1 (MQ=255) agaCCCCACACTACGATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAAc < 1:91116/150‑1 (MQ=255) agaCCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAAc < 2:1578197/150‑1 (MQ=255) agaCCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAAc < 1:254598/150‑1 (MQ=255) gaCCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACt < 2:458658/150‑1 (MQ=255) ccccACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTgg < 1:174559/150‑1 (MQ=255) ccccACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTgg < 1:1551320/150‑1 (MQ=255) cccACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTggg < 1:1259968/150‑1 (MQ=255) ccACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTgggg < 1:605880/150‑1 (MQ=255) ccACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTgggg < 1:71341/150‑1 (MQ=255) acacTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGAc < 1:649274/150‑1 (MQ=255) cTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTc < 1:345327/150‑1 (MQ=255) ccATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACATAAAAATTGTTGATCATACCCAGAGTCGAAATGGGGCCCACAcc > 2:1417808/1‑150 (MQ=21) tCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCtt < 2:545849/150‑1 (MQ=255) gcgcTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGGGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTAcc < 1:836580/150‑1 (MQ=255) cgcTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCa < 1:512282/150‑1 (MQ=255) gcTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCaa > 1:96/1‑150 (MQ=255) aCGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCGGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAggg < 1:1127521/150‑1 (MQ=255) gCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTGGTAAGGGTga < 1:1048875/150‑2 (MQ=255) ggttCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCGCACCCTTGGTAAGGGTgagg < 1:1494101/148‑4 (MQ=37) gTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTGGTAAGGGTgagg < 1:1779006/150‑4 (MQ=255) ttCACTTCTGAGTTCGGCATGGGTTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCAGCCGAACTTAAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGCGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGctc < 1:1636306/150‑1 (MQ=255) tCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGctct > 1:1330130/1‑150 (MQ=255) cACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTa < 1:22977/150‑1 (MQ=255) actcgagAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCAACGCTCTTCTTCAGCATGACAAATTCTTTTCAAATCTGCCGAACTTTAACCTAAACAGTTGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTAc < 2:1144276/144‑1 (MQ=37) aCTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTAc < 2:195357/150‑1 (MQ=255) cTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTAcc < 2:1103738/150‑1 (MQ=255) ttCTGCGTTCGGCCTGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGCACTTTAACCTAAAACGGGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCa < 2:442077/150‑1 (MQ=38) ttCTGAGTTCGGCATGGGGGCAGGGGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCa < 2:324546/150‑1 (MQ=255) tCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTAGCaa > 1:39206/1‑150 (MQ=255) aGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGa > 2:1741038/1‑150 (MQ=255) gTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAg > 2:130503/1‑150 (MQ=255) gTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAg < 1:1320467/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCATGGGGTCAGGGGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAg < 2:1221373/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCATGGGGTCAGGGGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAg < 2:1430290/150‑1 (MQ=255) tCGGAATGGGGTCAGGTGGGACCAACGAGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTGTATTCTGCCTAACTTTAACCTATAAAGTGGTGCTGATACCCATAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGcc < 2:517208/150‑1 (MQ=37) cGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGTCa < 1:750127/150‑1 (MQ=255) tcATGGGTTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAAACTAAAAAGTGGGGCTGATACCCAGAGTCGAACTGTGGAACTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCata < 1:1818368/149‑1 (MQ=38) gCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCata < 1:1446574/150‑1 (MQ=255) aTGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTACCCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGCCCTCACCCTTACCAAGGGTGTGCTCTACCAACTGAGCCATATc > 2:1796451/1‑150 (MQ=255) ggTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTa > 1:625092/1‑150 (MQ=255) ccaccGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGa < 1:610427/150‑1 (MQ=255) caccGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGAt < 2:1684512/150‑1 (MQ=255) accGCGCTACTGCAGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATg < 1:1493615/150‑1 (MQ=255) cgcTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTg < 1:1308529/150‑1 (MQ=255) aCTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAg < 1:587388/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGt > 1:1266625/1‑150 (MQ=255) | CAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGT > NC_000913/3423382‑3423679 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |