Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,458,110 | C→A | 100% | T578T (ACC→ACA) | gspD → | general secretory pathway component, cryptic |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,458,110 | 0 | C | A | 100.0% | 365.2 / ‑6.7 | 113 | T578T (ACC→ACA) | gspD | general secretory pathway component, cryptic |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); major base A (61/48); minor base T (1/1); total (62/51) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
ACTATTCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACCGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAGCGCTGGT > NC_000913/3457964‑3458256 | cTATTCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCACCTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgc > 2:1640077/1‑150 (MQ=255) cTATTCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgc > 1:1693699/1‑150 (MQ=255) aTTCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgcgc > 1:1562412/1‑150 (MQ=255) ttCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAACCGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAATGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgcgcg < 1:1246973/150‑1 (MQ=255) ttCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgcgcg > 1:1836102/1‑150 (MQ=255) tCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGACACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgcgcgc > 1:1653921/1‑150 (MQ=255) tCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCGTGGGCGGATTGGTGGTTGATTTTTATAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTAGGATTGGCTATTTGCATTTTTTGGGGCAAAGATTCCGCTTTCCTTCAACAGGgcgcgc > 2:1163305/1‑150 (MQ=255) tCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgcgcgc > 2:1479698/1‑150 (MQ=255) cAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAACCGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCt < 2:1136678/150‑1 (MQ=255) cAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCt > 2:1613910/1‑150 (MQ=255) cAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCt < 1:1464770/150‑1 (MQ=255) aaaaCGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTa > 2:12528/1‑150 (MQ=255) aCGCCGTGCTGGTCAACACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCGGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAAc < 1:989546/150‑1 (MQ=255) aCGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTTGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAAc < 2:1781816/150‑1 (MQ=255) cGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACg < 1:1467560/150‑1 (MQ=255) tttcTGCTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCAGGGCGGATTGCTTGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTCGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAAc < 2:159667/147‑1 (MQ=255) gTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGAAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGTCGATATTCGTTTAGTGGGGCAACTCTGCCGCGATCCCTCCACAGAGCGCGCTAAACCCAAc > 2:339820/1‑150 (MQ=255) tGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGa > 2:1751085/1‑150 (MQ=255) tGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGa > 1:1785943/1‑150 (MQ=255) ggTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTACGAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTGGGCGCTATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTACCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTgct > 1:1857638/1‑148 (MQ=255) gTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGGGCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATg < 2:1790738/150‑1 (MQ=255) gcAAATCCGGTGAAACTGTGGTCCTGGGCGGAGTGCTGGATGATTTTTCTAAAGATCAAGTGTCAAATTTGCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACATAGCGCGCTAAACGCTACCTGATgg < 2:463834/149‑1 (MQ=255) cAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGt > 2:680523/1‑150 (MQ=255) aaaaCCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTa < 2:28808/150‑1 (MQ=255) aaaaCCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTa < 1:1402646/150‑1 (MQ=255) aaCCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTAtt < 2:1220478/150‑1 (MQ=255) ccGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTa < 2:1519518/150‑1 (MQ=255) ggTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAtc < 2:64637/150‑1 (MQ=255) tGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAtccg < 1:1151987/150‑1 (MQ=255) gAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAtccgt > 1:729923/1‑150 (MQ=255) gAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTATCTAAAGACCAACAGTCAAAGGATCCACTGCTTGGCGATAATCCTGTAGGGGGGAAACTCTTCCGCTATACCTCCACTGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTAGTTCtccgt > 2:287852/1‑150 (MQ=255) aaaCGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAtccgtc < 1:799688/150‑1 (MQ=255) gtggtCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCcgacg < 1:1846966/150‑1 (MQ=255) tggtCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCcgacga < 1:1547516/150‑1 (MQ=255) tCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTa > 2:624651/1‑150 (MQ=255) tCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTa < 1:1350973/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATc < 1:1660110/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCGATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATc < 1:1405677/150‑1 (MQ=255) tGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGGGACgatg < 2:244854/150‑1 (MQ=255) cTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACgatgat < 2:662137/150‑1 (MQ=255) gatgatTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGtt < 2:1468063/150‑1 (MQ=255) atgatTTTTCTAACGAGCAAGTGTCAAAGGTGCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACCGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTCTCCGTGACGATGATGttt < 2:1405274/150‑1 (MQ=255) atgatTTTTCTAAAGAGCCAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATCCCTCCACAGAGCGCGCTTAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGttt < 1:88263/150‑1 (MQ=255) aggatGTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAACGGTGCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTCGGGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGAGGGAATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGttt < 1:83959/148‑1 (MQ=255) tttttCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTGCCTCTGCTTGGCGATAATCCTTTAGTCGGGCAACTCTTCCGCTAAACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGAAGGTATTTCTCCGACCGACGAATAACCGTGACGATCATGTTTATCg > 2:1641258/1‑150 (MQ=255) ttttCTAAAGATGAATTTTCATAGGTTCCTATGCTTGGAGATAATCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATTGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGc < 1:160158/150‑1 (MQ=255) ttttCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGc < 1:345085/150‑1 (MQ=255) ttttCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATAATCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCCCAGAGCGCGGTAAACGCCACCTGAAGGTATTTCTACGTCCGAGGATTAACCGTGACGGTGATGTTTATCGc > 2:277192/1‑150 (MQ=255) 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agagCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTc > 2:1354973/1‑150 (MQ=255) agCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCGGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTTTCGCTCACTGTCaa > 2:866106/1‑150 (MQ=255) cAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGACAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCaaa‑a > 1:431875/1‑150 (MQ=255) aGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑aga < 1:1754171/150‑1 (MQ=255) tgtCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑Agaga < 1:578432/150‑1 (MQ=255) tgtCAAAGGCTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGTCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACTCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑Agaga < 2:1682023/150‑1 (MQ=255) gtCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGaa > 2:795337/1‑150 (MQ=255) gtCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGaa > 1:404500/1‑150 (MQ=255) gtCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGaa > 2:1521348/1‑150 (MQ=255) tCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGaaa > 1:567399/1‑150 (MQ=255) cAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAAt < 1:1097286/150‑1 (MQ=255) ccTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGAGGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATCCACCCGt > 2:1143414/1‑150 (MQ=255) ctctGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGtt > 2:1525786/1‑150 (MQ=255) gCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCg > 2:1612464/1‑150 (MQ=255) ttGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTc < 1:1822369/150‑1 (MQ=255) 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cTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCaacaac > 1:1203584/1‑150 (MQ=255) cTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCaacaac > 1:1245412/1‑150 (MQ=255) tttAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAacaaca > 1:1642385/1‑150 (MQ=255) tAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGc < 1:1572237/150‑1 (MQ=255) tAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGc > 1:1519375/1‑150 (MQ=255) tAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGc < 2:52023/150‑1 (MQ=255) gTGGGGCATCTCTTCTGCTATACGTCCCCTGAGCGCGCTAAACTGAACGTGAAGGTATTTTTCCGTCCGACGATAATCCGTGACTTTGATGTTTATCGGTCACTTTCAAA‑ATAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCTACAACAGCgg < 2:1002849/150‑1 (MQ=255) ggCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTACACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTAACGCGCACGGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCCGGAGCAAGAACAGCGGATCg > 2:78418/1‑150 (MQ=255) ggCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCg > 1:819698/1‑150 (MQ=255) ggCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCg < 1:795337/150‑1 (MQ=255) ggCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCg > 2:1279865/1‑150 (MQ=255) aaCTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACg > 2:334533/1‑150 (MQ=255) ctTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGaa > 1:1098348/1‑150 (MQ=255) ccGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAATAGA‑AATTACACCCGTAACGGACCGGACCACCAACGGCGGTTGGCCGGGaataa > 2:494846/1‑147 (MQ=255) cagagagccTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCa < 1:413993/143‑1 (MQ=255) gCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCaa > 2:1491910/1‑150 (MQ=255) ttaCCTCCACAGAGCGCGCTAAAAGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCTTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAg < 1:273894/149‑1 (MQ=255) taCATCCACAGAGCGCGCTAACCGAAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAgc < 1:339999/150‑1 (MQ=255) ccTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAgcgc > 1:856964/1‑150 (MQ=255) cTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGATACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAGCGCt > 1:293717/1‑150 (MQ=255) cacaGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAGCGCTGGt > 2:797738/1‑150 (MQ=255) cACCGAGCGCGCTAAACGCAACCTTATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAGCGCTGGt < 1:1163305/150‑1 (MQ=255) | ACTATTCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACCGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAA‑AGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAGCGCTGGT > NC_000913/3457964‑3458256 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |