| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 517,383 | 0 | A | T | 6.2% | 340.2 / 9.9 | 112 | intergenic (+21/+42) | fetB/ybbN | iron export ABC transporter permease; peroxide resistance protein/DnaK co‑chaperone, thioredoxin‑like protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (62/43); new base T (3/4); total (65/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.04e-01 | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
CAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGTTTTATAATTCGCGCCACCAGTTGGTGGTGACGCAATTGAAGAAGAAATGATGCGATGCCGGATGCGCAGCATCGCATCCGGCGTTGTGGTTCATGTGCCGATCAACGGAATATCAATACAACAATGCATACAGCTGGCGGCGATACTTCGACGCCAGTGCATCACCCGTACCCAGCGCAGCGAGGATCTCCTGGAACGTTTTACGCGTCTGACCGTCTGC > NC_000913/517234‑517532 | cAGATTATGGTGCCCTTTATGCTGCTCTCACCCGCCAGCGTGTCGTCCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTCAGTTTTATAATTCGCGCCCCCAGTTGGTGGGGACGCAATTGAAGAAGAAAAGATGCGATGCCGGATGCgcagca < 2:116252/150‑1 (MQ=255) aGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGTTTTATAATTCGCGCCACCAGTTGGTGGTGAGGCAATTGAAGAAGAAATGATGCGATGCCGGATGCGCAgcat > 2:927995/1‑150 (MQ=255) aGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGTTTTATAATTCGCGCCACCAGTTGGTGGTGACGCAATTGAAGAAGAAATGATGCGATGCCGGATGCGCAgcat > 1:977193/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |