| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,981,102 | T→A | 5.7% | V72V (GTT→GTA) | yifK → | putative APC family amino acid transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,981,102 | 0 | T | A | 5.7% | 378.9 / 6.2 | 128 | V72V (GTT→GTA) | yifK | putative APC family amino acid transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/78); new base A (3/5); total (45/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GGGGCACCATTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGA > NC_000913/3980954‑3981248 | ggggCACCATTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTATCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAaccggtta < 2:1635139/150‑1 (MQ=255) ggCACCATTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAaccggttacc < 2:598493/150‑1 (MQ=255) ggCACCATTGGCGTCGGCCGGATTATGGGGGCCGCCAGTTCCCTGAAATGGGCCGGGCCAGCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCCTCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGGTCCTCGAaccggttacc < 1:947471/150‑1 (MQ=255) gCACCATTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAaccggttaccg > 1:729662/1‑150 (MQ=255) ccATTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATGCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGGTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCCAaccggttaccgggt > 2:1117063/1‑148 (MQ=255) cATTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGgttc > 1:1006936/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGTCTGCCTGTTTCTGGGGGCCGCCAGGACCCTGCAATGGGCCGGGCGATCAGTATTGTGGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGGCTTTTTCCTCATGCGTGCAATGGGCGATATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGgttcg < 2:1530846/150‑1 (MQ=255) aTTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGgttcg < 2:597044/150‑1 (MQ=255) tGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATGCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTGCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTAACCGgttcgag < 1:84991/150‑3 (MQ=255) tGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTAACCGgttcgag < 1:549401/150‑3 (MQ=255) tGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTAACCGgttcgag < 1:1022354/150‑3 (MQ=255) ggCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTACTCGAACAGGTTACCGgttcgtta > 1:1535382/1‑149 (MQ=255) gaggcGGCCTGTTTATGGGCGCCGACAGTACCCTGAAATGGGCGGGGTCATACGTATTGTGGGCCTATATCATCGCCGGGCTGGTCGGATTTTTCATCCTGCGTTCAATGGGGGAAATGTTGTTGCCCTAACCGGTAACCGgttcgtggt < 2:1426430/146‑4 (MQ=255) gCGTCGGCCTGTTTTTGGTGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGttcgttcg < 1:12574/150‑1 (MQ=255) gCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGttcgttcg < 1:969705/150‑1 (MQ=255) gCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGttcgttcg < 1:958159/150‑1 (MQ=255) gCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGttcgttcg < 1:711450/150‑1 (MQ=255) cGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGc > 2:1273959/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCTGTTTTTGCGGGCCGCCAGTACCCTGAACTGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGcc < 2:1368543/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTAACCGgttcgaggaac < 2:1792060/150‑7 (MQ=255) tCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCg < 1:1743780/150‑1 (MQ=255) ggCCTGTTTATGGTGGCCGCCTGTACCCTGAATTGGGCCGGGGAATCCGTATTGTTGGATTATATCATCGACGGGCTGTTCGTTTTTTTCATCTTTCGTTCAATGGGGGATATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGtt < 1:1577493/150‑1 (MQ=255) ccTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTTTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTa < 2:968808/150‑1 (MQ=255) tGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATg < 2:625423/150‑1 (MQ=255) tGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGATGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATg > 1:1479975/1‑150 (MQ=255) tttATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATgcg < 1:1346115/150‑1 (MQ=255) tttATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATgcg < 2:32183/150‑1 (MQ=255) tATGGGGGCCGCCAGTACCTTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCa > 2:42940/1‑150 (MQ=255) tATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCa < 1:967054/150‑1 (MQ=255) gggtgCCTCCAGTACCCTGAAATGGTCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATTTCATCGCCGGGCTGTTCGTCATTTTCATCAAGCTTTCAATTGGCGAAATTTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCg < 2:1168769/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCAGTACCCTGAACTGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTta < 2:622550/150‑1 (MQ=255) gccgccAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTtat > 2:1257189/1‑150 (MQ=255) ccgccAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTtata < 1:1521124/150‑1 (MQ=255) ccgccAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTtata > 1:610854/1‑150 (MQ=255) cgccAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTatat < 2:501751/150‑1 (MQ=255) cAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAg < 2:912249/150‑1 (MQ=255) cTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTGTTTCATCATGCGGTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTAGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCTTTATATGAGCCCGttg > 1:1799242/1‑149 (MQ=255) aaTGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCCTGGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTg < 1:371271/150‑1 (MQ=255) aTGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGTGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTgg < 1:711430/150‑1 (MQ=255) tGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGc < 2:74208/150‑1 (MQ=255) ggccgggccATACGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTa > 2:412902/1‑150 (MQ=255) gccgggccATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTAt > 2:749800/1‑150 (MQ=255) gccgggccATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTAt < 1:652252/150‑1 (MQ=255) aTCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGGTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGc < 1:892580/150‑1 (MQ=255) ccgttatgttgGCCGATATCATCGCCGGTCTGATCGTCTTTTTCCTCATGCGTTCAATGGGCGAACTGTTGTTCCTCGAACCGGGTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCt < 2:1615589/144‑1 (MQ=255) gTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTgg < 1:439678/150‑1 (MQ=255) gTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTgg < 2:846266/150‑1 (MQ=255) tATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGGTCGGCTTTTTCATCATGCGTGCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGt < 1:104587/150‑1 (MQ=255) ttgttgGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTTTCTCACCGCCTGGTCt > 2:1547045/1‑150 (MQ=255) ttgGCCTATATCATGTGCGTTCTGTTCGTCTTTTTCTTCTTGCTTTCTATGGGCGAAATGTTGTTCCACGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTTTGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTAc < 1:521244/150‑1 (MQ=255) tgtccTATATCATCGCACGGCGGTTCGTCTTTATCTTCATGCGTGCTATGTGCGATATGTTGTTCCTCTAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTATATGCGCATCTTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCAATCTCACCGCCTGGTCTTACt < 2:394235/147‑1 (MQ=255) ccTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGt > 1:613272/1‑150 (MQ=255) ccTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGt > 2:1553613/1‑150 (MQ=255) taatcatcGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATACTCGGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGGTATATGTGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTa < 2:1416132/148‑1 (MQ=255) atatCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTAACCGCCTGGTCTTACGGGTTTa > 2:498585/1‑150 (MQ=255) tatCATCGCCGGGCTGTTCGTATTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTAACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGATACCGTTCTTTTGCTATCTAACCGGCTGGTCTTACTGGTTTAt > 2:1282746/1‑150 (MQ=255) tatCATCGCCGGGCTGTTCGGCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATTGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTAt < 2:1796931/150‑1 (MQ=255) tcatcGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTAtgt < 1:1784383/150‑1 (MQ=255) tcatcGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTAtgt < 2:1035502/150‑1 (MQ=255) catcGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTAtgtg < 1:1037667/150‑1 (MQ=255) atcGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTgg < 2:707531/150‑1 (MQ=255) cGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGAt > 1:1319417/1‑150 (MQ=255) ccGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATgg > 2:1218526/1‑150 (MQ=255) cGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGc < 1:42940/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGc > 1:1831472/1‑150 (MQ=255) ggCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCgg < 2:307271/150‑1 (MQ=255) ggCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTCTATGTGGATGGCgg < 1:1220885/150‑1 (MQ=255) gCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTAAATGGGCGAAATGTAGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCCCCGTTTATGCGCATCGTTATAAGACCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCATACTGTGTTATGTGGATGGCGGt > 2:1667276/1‑150 (MQ=255) tGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTgg < 1:1392075/150‑1 (MQ=255) tGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTgg < 1:1131916/150‑1 (MQ=255) tCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTCCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGa > 1:1447522/1‑150 (MQ=255) tCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCTCATCGTTATATGATCCAGTTCTTTGGCTATCTCACAGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTAGATGGCGGTGGGGAtct > 1:95342/1‑150 (MQ=255) cTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGAtctc > 1:353622/1‑150 (MQ=255) tttCTTAATGCGTGCAATGGTCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGGCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGa < 2:181184/150‑1 (MQ=255) atcatGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCCCCGCCTGGTCTTACTGGTGTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATc > 2:790560/1‑150 (MQ=255) catGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCAc > 1:1265769/1‑150 (MQ=255) atGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTAGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCAcc < 1:1684896/150‑1 (MQ=255) tGCGTTCCATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCg < 1:354430/150‑1 (MQ=255) cAATGGGCGAAATGATGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCTCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTTGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTg < 1:1097731/150‑1 (MQ=255) tGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCg > 1:1660932/1‑150 (MQ=255) gCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGttt < 1:749800/150‑1 (MQ=255) gCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCGTACTGGTTTTTGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGatt > 1:1835738/1‑150 (MQ=255) cGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCCCCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGCTCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTa > 2:786673/1‑150 (MQ=255) aaaTGTTGTTCCTCGCACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATg < 2:306730/150‑1 (MQ=255) aaaTGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCATTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATg < 2:1640137/150‑1 (MQ=255) tgttgtTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCGTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCAGTGGCGTTTATGTcc > 2:389474/1‑150 (MQ=255) tgttgtTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTcc > 1:1279827/1‑150 (MQ=255) gttgttCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCa < 1:1058199/150‑1 (MQ=255) gttCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGtt > 1:1235078/1‑150 (MQ=255) gcgaacGAACCGGTACCCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTTCTGGTTTATGTGGATGGGGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGGGTTTATGTCCAGTTc > 2:543410/6‑150 (MQ=255) tCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCt > 1:215774/1‑150 (MQ=255) tCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCt < 1:785259/150‑1 (MQ=255) ccTCGAACCGGTTCCCGGGTCGTTCGCCGGTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTAGCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTg < 1:221341/150‑1 (MQ=255) ccTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTg < 2:1062619/150‑1 (MQ=255) ccTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTg > 1:522677/1‑150 (MQ=255) cTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATAGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTATATGTGGATGGAGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCTTTTATGTCCAGTTCTgg > 1:1515022/1‑150 (MQ=255) atcaccggttaccggttCGTTCGCCGTTTATGCGCTTAGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATTTCCATTTCTGGtt < 2:1872841/147‑1 (MQ=255) cgtgtaccggatCGTTCGCCGTTTCTGCGCATCGGTAAATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCACACCTCCTTGTCTTACTGGTGTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGTCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTACCgg < 2:477665/146‑1 (MQ=255) ggttaccggttCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGga > 2:208/1‑150 (MQ=255) ggttaccggttCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGGCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGga > 1:1016979/1‑150 (MQ=255) | GGGGCACCATTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGA > NC_000913/3980954‑3981248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |