| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,162,151 | 0 | G | C | 6.1% | 419.8 / 15.6 | 131 | intergenic (+21/+19) | yijD/trmA | DUF1422 family inner membrane protein/tRNA m(5)U54 methyltransferase, SAM‑dependent; tmRNA m(5)U341 methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (71/52); new base C (5/3); total (76/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.09e-01 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TACAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTAC > NC_000913/4162002‑4162300 | tACAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTg > 2:845371/1‑150 (MQ=255) cAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGgc > 2:532277/1‑150 (MQ=255) cAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGgc > 2:368118/1‑150 (MQ=255) 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ggCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCGATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTAAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTAc > 2:510892/1‑150 (MQ=255) ggCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTAc > 2:795184/1‑150 (MQ=255) | TACAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTAC > NC_000913/4162002‑4162300 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |