| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 639,654 | 0 | T | C | 5.2% | 460.8 / 11.1 | 153 | intergenic (+146/‑99) | ahpC/ahpF | alkyl hydroperoxide reductase, C22 subunit/alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (70/74); new base C (4/4); total (74/79) | |||||||||||
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Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
TAAATTTCCTTCGTCTTTCACGCCATAGCGGCGTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAAACTCAACTCAAGGCTTACCTTGAGAAATTG > NC_000913/639506‑639803 | tAAATTTCCTTCGTCTTTCACGCCATAGCGGCGTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGtgctg < 2:1557770/150‑1 (MQ=255) aaaTTTCCTTCGTCTTTCACGCCATAGCGGCGTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGtgctgc < 2:1041373/150‑1 (MQ=255) gtCCTTCGTCTTTCACGCGCTAGCGGCGTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCTCTTACTTGTGTAAGCTCCCTGGGATTCACCGCCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTGCGGCAATGCACCTAATTCTTCGGGTGCTTCGGCa < 2:297781/149‑1 (MQ=255) 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cgAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACaaa < 1:659931/150‑1 (MQ=255) cTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAACGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGaaa > 2:28001/1‑150 (MQ=255) ttCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATGCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCGTGCAGGAGGATGTTTAACGACCAGGAGATAAACATGAGCGCCACAAATATGtaaa > 2:334604/1‑150 (MQ=255) tCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAaac < 1:201511/150‑1 (MQ=255) gAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAaactca < 1:743179/150‑1 (MQ=255) gAAATTCACCTAATGCTTCGCGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTTCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCAGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAaactca < 1:285684/150‑1 (MQ=255) aaaTTCACCTAATTCTTCTCGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTACCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTTCATGATTATGTTTTAATCCCAGGAGATAAACAAGCTCGACACAAATATGAAaactcaa > 2:1223613/1‑150 (MQ=255) aaaTTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAaactcaa > 2:1862606/1‑150 (MQ=255) aTTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAaactcaacg > 1:1340424/1‑149 (MQ=255) aTTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAAACTCAACTCAAGGCTTa < 2:1289559/150‑1 (MQ=255) aaatcGGGTGCCGCAGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAAACTCAACTCAAGGCTTAcc > 2:612403/4‑150 (MQ=255) ttcGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAAACTCAACTCAAGGCTTACCtt > 1:702406/1‑150 (MQ=255) gggTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACTCAAATATGAAAACTCAACTCAAGGCTTACCTTgag > 2:1613399/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCATTTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAATGTCAACTCAAGGCTTACCTTgaga < 1:1570316/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAAACTCAACTCAAGGCTTACCTTgaga > 2:385833/1‑150 (MQ=255) tgcGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAAACTCAACTCAAGGCTTACCTTGAGAAATTg > 2:1282171/1‑150 (MQ=255) tgcGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAAACTCAACTCAAGGCTTACCTTGAGAAATTg > 2:590167/1‑150 (MQ=255) | TAAATTTCCTTCGTCTTTCACGCCATAGCGGCGTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAGAGGCCGCTTGCATGATGATGTTTAAAGCCCAGGAGATAAACATGCTCGACACAAATATGAAAACTCAACTCAAGGCTTACCTTGAGAAATTG > NC_000913/639506‑639803 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |