Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,448,424 | 0 | T | A | 5.4% | 380.3 / 7.5 | 127 | intergenic (+189/‑23) | ytfP/chpS | GGCT‑like protein/antitoxin of the ChpBS toxin‑antitoxin system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (60/60); new base A (4/3); total (64/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.96e-01 |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |