| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 881,123 | G→A | 5.3% | G133S (GGT→AGT) | dacC → | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase; penicillin‑binding protein 6a |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 881,123 | 0 | G | A | 5.3% | 330.2 / 5.7 | 113 | G133S (GGT→AGT) | dacC | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase; penicillin‑binding protein 6a |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (50/57); new base A (3/3); total (53/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.19e-01 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGGTTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTACGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGC > NC_000913/880975‑881272 | tAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGGTTCATCGGTAATGTTCCTCAATCCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCgg < 2:548086/150‑1 (MQ=255) aTTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGGTTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAAt < 1:1713308/150‑1 (MQ=255) ttACACTCTACGATTTGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGCCGGGAAATCCGGCACTGCGTGTTTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGTGGTGATTATCCAGTCCGGTAATg < 1:947285/150‑1 (MQ=255) 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ggTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTACGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGc > 1:1068102/1‑150 (MQ=255) ggTAATGACGCATGTATTGCGCTGGCTGATTAGGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGTGCTGTTGAATGGTAATGACAAAAAACTGGGTCTGACCAACAGTTCCTTCCAGACGGTGCTCGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGc < 2:189059/150‑1 (MQ=255) | TAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGGTTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTACGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGC > NC_000913/880975‑881272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |