New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 1428264 | NA (NA) | 47 (0.500) | 15/286 | 6.5 | 87.5% | noncoding (531/1196 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 2066866 | 7 (0.070) | noncoding (488/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
TTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTcttggt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1428116‑1428264 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAAGAGCGGCCTGACCCACA < NC_000913/2066866‑2066712 TTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTC > 1:1219380/1‑150 TTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGGCTGATGCATCTCCGGCTCGCGTTGCTGCTCTTTGTTC > 2:1105392/1‑150 TTGAGGTCATGCGCGTTGGCCGCGGGTGTGACCAGGCTGGGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTACATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTC < 1:153930/150‑1 gGAGGGCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCT < 2:1210797/149‑1 TGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCT < 1:1549936/150‑1 TGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCT < 1:833692/150‑1 gtGGTGATGCTCGTTGGCCGCGGTCGTGACCAGGCTGTGGCTGAGGCCACTGTTGGCAGCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCGACTGTTTGCCTTTCTTGGTCTGATGGATCTCCGGTTCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTT < 2:524159/148‑1 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CAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAA < 1:1175491/150‑1 CAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAA < 1:1158040/150‑1 CAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGG‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAA < 1:873094/150‑1 AGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAAC < 1:497375/150‑1 AGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAAC < 1:594949/150‑1 AGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGGCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAAC < 1:665061/150‑1 GGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACA < 1:1393087/150‑1 GCCACTCTTGGCTTCGACACCTTTGTGGGCCTTGATGCCAAAGTGCCACTGATTGGCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCGAGCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAA < 2:97072/150‑1 GCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGG‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAA < 1:1099688/150‑1 ACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAAAGA < 1:31449/150‑1 ACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAAAGA < 1:663889/150‑1 ACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCAAGCCAAAGTGCCACTGATTACCTTTCTTCGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAAAGA < 1:161707/150‑1 CATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAAC < 2:634507/150‑1 GTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAAAAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATG > 2:1588177/1‑150 TTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCACTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAAGAGCGGCCTGACC < 2:113661/150‑1 TGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATAATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAAAGATCAGCAACGCGAGCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTAGCATGAAGTCCAACATTGGTGTCGCTGCCAACAGGGGCCAGACac > 2:106720/1‑148 GT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAAGAGCGGCCTGACCCAC > 2:1394823/1‑150 T‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAAGAGCGGCCTGACCCACA > 2:562093/1‑150 TTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTcttggt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1428116‑1428264 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGGT‑‑‑‑C‑‑GATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAAGAGCGGCCTGACCCACA < NC_000913/2066866‑2066712 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |