| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3986248 = | 166 (1.690) | 8 (0.090) | 8/280 | 8.8 | 4.9% | intergenic (‑241/‑184) | aslA/glmZ | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase/sRNA antisense activator of glmS mRNA, Hfq‑dependent |
| ? | NC_000913 | 3986273 = | 157 (1.700) | intergenic (‑266/‑159) | aslA/glmZ | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase/sRNA antisense activator of glmS mRNA, Hfq‑dependent | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GAAATAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATTAATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3986405‑3986248‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tattaattgAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCA > NC_000913/3986273‑3986421 GAAATAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATAT > 2:1095044/1‑150GAAATAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATAT > 1:748940/1‑150 AAATAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATA < 1:1071051/150‑1 AAATAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATA < 1:354962/150‑1 AAATAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATA < 1:1349908/150‑1 AAATAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTATGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATA < 1:1343917/150‑1 ATAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATGCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATT < 2:921613/150‑1 ATAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATT < 2:563661/150‑1 ATAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATT < 1:535959/150‑1 TAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATTA > 1:1363750/1‑150 ACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATTAAT < 1:692852/150‑1 ACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATTAAT > 1:923928/1‑150 ATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATTAATTG < 2:1419071/150‑1 CCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATTAATTGAcg > 1:627999/1‑148 AATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACCCATATATTAATTGAATGAATTTTATCATTAATAATAAGTATTTGTAGGATCAAGCTCATGTTAAAT > 2:1166929/1‑150 TAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATATAGATCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTAat > 1:1452259/1‑148 TGAATGATAAAATTCAGTCAATTAATAACACAGATATTATTTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGAGCAAGCTCTGGTTAAATATTCCGTCAGGAAGTTATTACTCTGGAAGCAAAGAGGATTACAGATTTATATCA > 2:264604/1‑150 TGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAAa > 1:549515/1‑149 GATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATATCATAACA > 2:310480/1‑150 TTCATTCAATTAATAACACATATATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTA > 2:1547012/1‑150 TAACACATATATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAATTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATATCATAACAATTTTTAAGGTATGTTATTT > 1:1129468/1‑150 TATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCT < 2:1092324/150‑1 TATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGAACAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTGATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGGTAAGGGATGTTATTTCCAGATTCa > 2:604793/1‑149 ATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTC < 2:456243/150‑1 TAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACCGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTG < 2:1060202/150‑1 TAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTG > 1:831273/1‑150 TAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTG > 2:186904/1‑150 ATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTG < 2:209449/150‑1 TTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGG < 1:738852/150‑1 TGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGC > 1:1318359/1‑150 TGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGC > 1:1298731/1‑150 TGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCAGATTCTCTGTGGa > 1:321584/1‑149 GAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGTCA > 1:992816/1‑150 GAAATAACATCCCTTAACACTTGTTATGAGATAATTCTGTAATCCTCTTTGCTTCCTGAGTAATAACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATAACACATATATTAATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3986405‑3986248‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tattaattgAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCA > NC_000913/3986273‑3986421 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |