| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,567,467 | G→T | 5.1% | intergenic (‑327/+37) | dosC ← / ← yddW | diguanylate cyclase, cold‑ and stationary phase‑induced oxygen‑dependent biofilm regulator/liprotein, glycosyl hydrolase homolog |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,567,467 | 0 | G | T | 5.1% | 1705.8 / 51.3 | 471 | intergenic (‑327/+37) | dosC/yddW | diguanylate cyclase, cold‑ and stationary phase‑induced oxygen‑dependent biofilm regulator/liprotein, glycosyl hydrolase homolog |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (236/210); new base T (14/11); total (250/221) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 477 total aligned reads displayed.
TTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGCACAGCATCGTTAA > NC_000913/1567318‑1567616 | tttttCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTaa < 1:525702/150‑1 (MQ=255) ttttCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTaaa > 1:7199479/1‑150 (MQ=255) tCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCa < 1:7542888/150‑1 (MQ=255) ggTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGACGGTGGGTAAAGCAcc > 1:4871842/1‑150 (MQ=255) gACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGCTAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGc < 1:4248373/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGCTTTACCCACCGGCt < 2:5655191/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGCTTTACCCACCGGCt < 2:9007553/150‑1 (MQ=255) aGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTg > 1:3969961/1‑150 (MQ=255) gCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGt < 2:7986395/150‑1 (MQ=255) cGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGtt > 1:6937878/1‑150 (MQ=255) cGAAGATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGtt < 2:4745642/150‑1 (MQ=255) gAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTa < 1:9339104/150‑1 (MQ=255) aaTATCGTTTGTTTTTTAATATTAATACATTTTTTTTTGGGTTTTATGGCTTTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCTTGATTTTTTGTGGGATATTTTATGTGGGTAACAAGCGGGTGGTTAAAGCACCGGCTTGTTAc < 1:5475444/150‑1 (MQ=255) atCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTGCaaa < 1:1019904/150‑1 (MQ=255) atCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACaaa < 2:8566813/150‑1 (MQ=255) tGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTGTAAGAGGGCAACAAGCCGGTGGGTAATGCACCGGCTTGTTACAATGTAAGa > 2:6827589/1‑150 (MQ=255) ggTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGaa > 1:3820829/1‑150 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAAt < 1:4298164/150‑1 (MQ=255) ttttCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTTGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATgg < 2:7751386/150‑1 (MQ=255) tttCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATggg < 1:4420730/150‑1 (MQ=255) ttcatattcataCATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGa < 2:8714478/150‑1 (MQ=255) ttcatattcataCATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGa < 1:3509886/150‑1 (MQ=255) aTTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGcccc > 1:19941/1‑150 (MQ=255) tttttATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCa > 2:4915226/1‑150 (MQ=255) tttttATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCa > 2:3827368/1‑150 (MQ=255) tttttATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCa > 2:2335323/1‑150 (MQ=255) tttttATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCa > 2:6899076/1‑150 (MQ=255) ttttATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAg > 2:3083133/1‑150 (MQ=255) ttaGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACt > 2:6626745/1‑150 (MQ=255) ttaGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACt > 2:4406669/1‑150 (MQ=255) ggATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGc > 1:7922679/1‑150 (MQ=255) gATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCa < 1:6113498/150‑1 (MQ=255) gATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCa < 1:2997174/150‑1 (MQ=255) ttATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGAt < 2:6326841/150‑1 (MQ=255) ttATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAAATGCCCCAGCGACTTTGCAGAt > 1:3419645/1‑150 (MQ=255) tATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATa < 1:2835485/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAg < 2:6500284/150‑1 (MQ=255) ggCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAATCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCt > 2:8626336/1‑150 (MQ=255) ggCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCt < 1:8970069/150‑1 (MQ=255) tGTTTATCTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGTGTAACTAGCCGGTGGGTTAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCtttc < 2:81283/150‑4 (MQ=255) tttAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCg > 1:1483412/1‑150 (MQ=255) ttAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGc < 1:1547892/150‑1 (MQ=255) tAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCt < 2:5942341/150‑1 (MQ=255) tAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCt > 1:471804/1‑150 (MQ=255) tAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCt < 2:9165838/150‑1 (MQ=255) aaCTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCtg > 2:7528213/1‑149 (MQ=255) cTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAAc > 1:6061372/1‑115 (MQ=255) cTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCttgt < 2:599503/150‑1 (MQ=255) cTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCttgt > 2:2725117/1‑150 (MQ=255) cTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCttgt < 2:5040071/150‑1 (MQ=255) tAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCttgtt > 2:6451292/1‑150 (MQ=255) tAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCttgtt > 2:5819106/1‑150 (MQ=255) tgttgtTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGTGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTAACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGt < 1:6319511/150‑1 (MQ=255) tgGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCt > 2:5511832/1‑150 (MQ=255) gTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGc < 1:9204047/150‑1 (MQ=255) gTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGc < 1:5546354/150‑1 (MQ=255) gTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGc > 2:1058279/1‑150 (MQ=255) ttAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCg > 2:619047/1‑150 (MQ=255) ttAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCg > 2:4526134/1‑150 (MQ=255) tttGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGttt > 1:2429549/1‑150 (MQ=255) ttGACTTAAGTTATCATGATTATTAGTGGGTTAGTTTTAGAGGGTAACAAGCCGTTGGGTACAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGTGAGTTTATCTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGtttt < 1:181639/150‑2 (MQ=255) ttGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTa < 2:2094414/150‑1 (MQ=255) tGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTAt < 1:1571206/150‑1 (MQ=255) gACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATggg < 1:3692288/90‑1 (MQ=255) gACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATggg > 2:8333164/1‑90 (MQ=255) aCTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTACAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTc < 1:6400838/150‑1 (MQ=255) cTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCa > 1:2680716/1‑150 (MQ=255) ttAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAg > 1:1300588/1‑150 (MQ=255) gtaagCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAg > 1:1398435/1‑150 (MQ=255) gCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCt < 2:3306296/150‑1 (MQ=255) cATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTc > 2:2543346/1‑150 (MQ=255) tGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCAc > 1:8647603/1‑150 (MQ=255) tGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCAc > 2:2169703/1‑150 (MQ=255) gATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACg < 1:8444865/150‑1 (MQ=255) gATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACg < 1:7670573/150‑1 (MQ=255) attattAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACgg > 1:6581047/1‑150 (MQ=255) ttattaGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGa > 2:1272000/1‑150 (MQ=255) tattaGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGaa > 2:3782014/1‑150 (MQ=255) aGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCCTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCACTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAg > 2:2011998/1‑150 (MQ=255) tGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCg < 1:7085222/119‑1 (MQ=255) ggATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATgg > 2:7344919/1‑150 (MQ=255) ggATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATgg > 1:8007062/1‑150 (MQ=255) gATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGt > 1:679137/1‑150 (MQ=255) gATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGt > 2:2860647/1‑150 (MQ=255) gATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGt < 2:4190438/150‑1 (MQ=255) gATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGt < 1:3083133/150‑1 (MQ=255) aTAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTg > 2:1717830/1‑150 (MQ=255) gTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCg < 2:4120929/150‑1 (MQ=255) tttAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGc > 1:5664625/1‑150 (MQ=255) tttgTAACAAGCCGGTGCTTTACCCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAAttt > 1:8811834/4‑150 (MQ=39) gTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCgg < 1:2592345/150‑1 (MQ=255) aaCAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGc > 1:2220981/1‑150 (MQ=255) aaCAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGc > 1:701757/1‑150 (MQ=255) aCAAGCCGGTGCTTTACCCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGca > 1:8190804/1‑150 (MQ=255) aaGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGcaca < 1:6196013/150‑1 (MQ=255) aaGCCGGTGCTTTACCCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGcaca > 2:7833073/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGCACAGc > 1:2139112/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGCACAGc > 2:5257736/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGCACAGCATCGTTaa > 2:3636438/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGCACAGCATCGTTaa < 2:1398435/150‑1 (MQ=255) | TTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGCACAGCATCGTTAA > NC_000913/1567318‑1567616 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |