Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,984,542 | T→A | 6.3% | Q489L (CAG→CTG) | aslA ← | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,984,542 | 0 | T | A | 6.3% | 1848.7 / 12.4 | 592 | Q489L (CAG→CTG) | aslA | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (164/351); new base A (46/2); total (239/353) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.42e-19 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 598 total aligned reads displayed.
GGATCTCCATATACGCGTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGGAAGAAGGATGTC > NC_000913/3984393‑3984691 | tctcCATATACGCGTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGat < 1:571773/150‑1 (MQ=255) ccATATACGCGTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCCACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATc > 2:8028677/1‑150 (MQ=255) atatACGCGTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCg < 2:6556726/150‑1 (MQ=255) tataCGCGTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTTAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGc < 1:8706282/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTg < 2:6114152/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTg < 2:5041166/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTg < 1:2599387/150‑1 (MQ=255) gcgTGCATTTTGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTgg < 1:315066/150‑1 (MQ=255) gcgTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTgg < 2:1443327/150‑1 (MQ=255) gcgTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTgg < 2:3145671/150‑1 (MQ=255) gcgTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCAATAATGTGCCGGTGAATACACCCGGATATACCCTCTgg > 1:5472735/1‑150 (MQ=255) gTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGt < 1:4359716/150‑1 (MQ=255) aTTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATaa < 2:8211226/150‑1 (MQ=255) tttCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGGATAAg > 2:5386468/1‑150 (MQ=255) ttCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGAACGGGGGAGAGGTTAAAAACCGACGATCCCGCCCTTTGCCAGAAGGTTGCGGTGAATACACCCAGATATACCCGCGGGGTATaacc > 2:7092203/1‑148 (MQ=255) ggTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGAACCCGCCGTTTGCATTACAGTGCCGGTGAATACACCCAGATATACGCTCTGGGTAAAAGCCTa > 2:7007234/1‑150 (MQ=255) gTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTaa < 2:5739766/150‑1 (MQ=255) gTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTaa < 1:3931593/150‑1 (MQ=255) gTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTACTGCGGATCGGTGTATATGTTAAACACCGACGAACCCGCCCTTTTCATTAAAGTTCCCGTGAAAACAACCAGATATACCCTAGGGGTATAAGCGTaa > 2:3260359/1‑150 (MQ=255) tAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTg < 1:9046161/150‑1 (MQ=255) gCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCt < 1:1209169/150‑1 (MQ=255) gCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCt < 1:4726415/150‑1 (MQ=255) gCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCt < 1:273117/150‑1 (MQ=255) acacCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATc < 2:8829512/150‑1 (MQ=255) cATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGTCGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGAc < 2:6005879/150‑1 (MQ=255) cATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGAc < 1:7790835/150‑1 (MQ=255) aTCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACg < 1:420838/150‑1 (MQ=255) aTCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACg > 2:644722/1‑150 (MQ=255) aTCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACg < 1:6006198/150‑1 (MQ=255) tCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGt < 1:5819725/150‑1 (MQ=255) tCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTAATGTGCCGGTGAAAACACCCTGATATACGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTTCTTAATAAGGACGt > 2:3627430/1‑150 (MQ=255) tCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCGTTCCGGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCCACCATCCCCCCGGTTGCAATATTTTGCCGGTGAATCCACCCAGAAATGCGCACGGGGTATAAGCCGAAGGGTGCTGGAACAGGAccg > 2:912542/1‑148 (MQ=255) actcgggCGCACGCCGAGGGAGTCGCGTTCCTGCGGATCGGGGTAGAGGGTAAACACCGACGCGCCCGCCGTGTGCATGACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGAGATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGAtc < 1:400596/145‑2 (MQ=255) aaTATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATa < 2:6650723/150‑1 (MQ=255) atatGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATAc < 1:8904405/150‑1 (MQ=255) tGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTg < 2:7423009/150‑1 (MQ=255) cgcACGCCGATGGAGTCGCTTTACTGCGGATCGGTGGAGAGGTTAAAAACCGACGAACCCGCCGTTTGCATTAAATTGCCCGTGAATACACCCGGATATACCCGCGGGGTATAAGCGGAAGGTTGCTGAATAAGGAACTGATaaattaac > 2:1779335/1‑143 (MQ=255) gcACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACt < 1:2674785/150‑1 (MQ=255) cGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGTTATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCAt < 2:7258471/150‑1 (MQ=255) cGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCAt < 2:783769/150‑1 (MQ=255) cGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCAt < 2:1363002/150‑1 (MQ=255) cGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCAt < 1:1439565/150‑1 (MQ=255) gcagATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCTGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATc < 1:8160112/147‑1 (MQ=255) gCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATc < 1:7456999/150‑1 (MQ=255) gCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCCCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCGGATATCCGCGCGGGGGATAAGCGGAAGGGTGCTGAATCAGGCCGTGATACTTGAActcctc > 2:522480/1‑150 (MQ=255) aTGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATa < 1:920747/150‑1 (MQ=255) cTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCAcagca > 1:6160853/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACagcagc < 1:5435744/150‑1 (MQ=255) ttCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACagcagc < 2:390173/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGa < 1:3749088/150‑1 (MQ=255) cTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGTATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGGTGCTGAATCAGGTCGTGATAATTGAACTCATACATAAGCACAGCAGCGAg > 1:4921404/1‑150 (MQ=255) cTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAg > 2:2810113/1‑150 (MQ=255) tGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCGGATATACGCGCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCGGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGt > 1:1630917/1‑150 (MQ=255) gATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTAc < 1:5232045/150‑1 (MQ=255) gATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTAc < 2:5316304/150‑1 (MQ=255) gATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTAc < 1:6859734/150‑1 (MQ=255) gtgtAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCAGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATACAAAAGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTg > 1:8482997/1‑150 (MQ=255) gtgtAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCCGTGAATCCACCCAGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCATCGAGTTTAACGTTg > 2:896668/1‑150 (MQ=255) tgtAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGa < 1:3677031/150‑1 (MQ=255) tgtAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGa < 2:8698487/150‑1 (MQ=255) tgtAGAGGATAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGa < 2:6916050/150‑1 (MQ=255) gtAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAg < 2:3986476/150‑1 (MQ=255) agagGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGa > 2:4574415/1‑150 (MQ=255) agGTTACACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAag < 1:1825439/150‑1 (MQ=255) agGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAag < 2:1158444/150‑1 (MQ=255) ttAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAagtag > 2:3820575/1‑150 (MQ=255) acacCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCt > 2:2923696/1‑150 (MQ=255) cgacgaTCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGc < 1:705257/150‑1 (MQ=255) cgacgaTCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGc < 1:5153372/150‑1 (MQ=255) cgacgaTCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGc < 1:6318070/150‑1 (MQ=255) cgacgaTCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTAACGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGc > 2:2055465/1‑150 (MQ=255) gacgaTCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGcc < 2:5527669/150‑1 (MQ=255) aTCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTAc < 2:4339854/150‑1 (MQ=255) aTCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTAc < 1:3422455/150‑1 (MQ=255) aTCCCGCCGTGTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTAc < 1:6530187/150‑1 (MQ=255) cgccgTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCAGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGtt > 1:7218785/1‑150 (MQ=255) gccgTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTa < 2:4735193/150‑1 (MQ=255) tGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGa > 2:8610712/1‑150 (MQ=255) tGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGa > 2:4118332/1‑150 (MQ=255) gCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGAc < 1:1041628/150‑1 (MQ=255) gCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGAc < 2:2840379/150‑1 (MQ=255) aCTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCAttt < 1:2351665/150‑1 (MQ=255) aCTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCAttt < 2:4912085/150‑1 (MQ=255) aCTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCAttt < 1:6723693/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGt > 2:12548/1‑150 (MQ=255) tgCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTc < 1:2473316/150‑1 (MQ=255) cGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCa < 1:1980948/150‑1 (MQ=255) cGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCa < 1:975012/150‑1 (MQ=255) cGGTGAAACCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCa < 1:9016164/150‑1 (MQ=255) gAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGgaa < 1:3799613/150‑1 (MQ=255) tCCACCCTGATGTCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGgaagaa > 1:7688724/1‑150 (MQ=255) tCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGgaagaa > 2:2281135/1‑150 (MQ=255) tCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGgaagaa > 1:2070200/1‑150 (MQ=255) tCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGgaagaa > 2:8505412/1‑150 (MQ=255) aCCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGGAAGAAGGa > 1:2219604/1‑150 (MQ=255) cccTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGGAAGAAGGAt < 2:9284638/150‑1 (MQ=255) cccTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGGAAGAAGGAt < 2:1652703/150‑1 (MQ=255) cccTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGGAAGAAGGAt > 1:8596112/1‑150 (MQ=255) tGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGGAAGAAGGATGTc < 1:3591534/150‑1 (MQ=255) tGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGGAAGAAGGATGTc < 1:4530685/150‑1 (MQ=255) | GGATCTCCATATACGCGTGCATTTCGGTCTGTAGCGGTACACCCATCGGAATATGGCGCACGCCGATGGAGTCGCTTTCCTGCGGATCGGTGTAGAGGTTAAACACCGACGATCCCGCCGTTTGCATTACTGTGCCGGTGAATCCACCCTGATATCCGCTCTGGGTATAAGCGTAAGGTTGCTGAATCAGGACGTGATACTTGAACTCATCCATACGCACAGCAGCGAGTTTACCGTTGAGGAAGTAGTGCTCGGCCTTACGGTTAGACTGACCATTTGTTCCCAGGAAGAAGGATGTC > NC_000913/3984393‑3984691 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |