Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,292,997 | IS2 (–) +5 bp | 13.2% | intergenic (‑75/‑526) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1292997 = | 59 (0.240) | 13 (0.050) | 5/278 | NT | 17.5% | intergenic (‑75/‑530) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1293001 | 59 (0.240) | 5 (0.020) | 4/278 | NT | 7.6% | intergenic (‑79/‑526) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
AAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATT > NC_000913/1292854‑1293150 | aaGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGaa > 1:2326896/1‑150 (MQ=255) aGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAAt < 2:2023731/150‑1 (MQ=255) gtACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGgg > 2:4326573‑M2/1‑148 (MQ=255) gtACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTa < 1:2559845/150‑1 (MQ=255) tACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTaa > 1:3303957/1‑150 (MQ=255) gtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAg > 1:3414876‑M1/138‑150 (MQ=255) aCATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg < 2:2524169/150‑1 (MQ=255) aCATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg < 2:2055480/150‑1 (MQ=255) aCATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg < 2:1831103/150‑1 (MQ=255) aCATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg < 1:230446/150‑1 (MQ=255) aCATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg < 1:2170558/150‑1 (MQ=255) ttCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGgga > 2:3105968‑M1/1‑147 (MQ=255) ctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAAtt > 2:3615117‑M2/133‑150 (MQ=255) tctTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTAAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATATCAAACTTATAATGGGGTGGTTTGGTGAGGTAATAATAGATCCATAAATTCATTAGTGAAATAGACAGGAAAGggtgatgctg < 1:3845085‑M2/150‑11 (MQ=255) gCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaa < 1:4237372‑M2/150‑15 (MQ=255) gCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCaaaa < 2:1060360/150‑1 (MQ=255) tgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAtt < 2:2959865‑M2/25‑1 (MQ=255) tGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTg > 2:1356655/1‑150 (MQ=255) tGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTg > 2:1356919/1‑150 (MQ=255) aggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGt > 1:2094119‑M2/124‑150 (MQ=255) gcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTc > 1:1067203/1‑150 (MQ=255) gAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGggaaggtgcgaacaagtccc > 1:1698422‑M1/1‑130 (MQ=255) cacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTa > 2:2702014‑M2/118‑150 (MQ=255) tccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAttt < 2:3007506‑M1/36‑1 (MQ=255) tACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGg > 1:1529206‑M2/1‑149 (MQ=255) aCGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATAGTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaa < 1:2937748‑M2/150‑15 (MQ=255) acggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgc < 1:189871‑M2/41‑1 (MQ=255) gATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtga < 2:1115203‑M2/150‑6 (MQ=255) gATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtga < 2:675689‑M2/150‑6 (MQ=255) gttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgc < 1:1160256‑M2/150‑9 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgcc > 2:3283644‑M2/1‑138 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataa < 2:2244642‑M1/50‑1 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt > 2:564830‑M2/1‑107 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaa > 1:3782663‑M2/1‑136 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 2:21798‑M2/150‑45 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaac < 1:2687504‑M2/150‑16 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAatat < 2:1870062‑M2/54‑1 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga < 1:1552483‑M2/150‑47 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 1:3125103‑M2/1‑104 (MQ=255) aTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgt > 1:4000342‑M2/1‑120 (MQ=255) aTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaactta > 2:1928972‑M2/1‑132 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgagttagtgtatgatggtgtttttgagg < 2:1600717‑M2/150‑49 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttac > 1:1892631‑M2/1‑131 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttac > 2:3345993‑M2/1‑131 (MQ=255) tcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCtt < 1:61485‑M2/57‑1 (MQ=255) gTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagc > 2:3839688‑M1/1‑100 (MQ=255) gCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttag > 1:891496‑M2/1‑123 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg < 1:2892629‑M2/150‑59 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaaattactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg < 1:3524473‑M2/150‑59 (MQ=255) cGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc > 1:664132‑M2/1‑90 (MQ=255) tCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttc < 2:3447460‑M2/150‑64 (MQ=255) tCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:2606849‑M2/1‑104 (MQ=255) ttGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg < 2:3985039‑M2/150‑38 (MQ=255) tcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGa > 1:406878‑M2/76‑150 (MQ=255) gtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaaaa < 2:259041‑M2/78‑1 (MQ=255) tctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttttaggtgctccagtggcttctgtttatatcag < 2:2335761‑M2/150‑76 (MQ=255) tcAAACTTTTATTGGGGTTGTTTTTTTATTTAATAATAGATCCTTAATTTCAGTTGTGCAATAGCCTGGAATGTAAGGATTTAAAATTTGTTTTTTATTTTGTGCCGACAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGc < 1:1431354/150‑1 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgag > 1:1045253‑M1/1‑69 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTATCCAGAAAAGACGCGGc > 2:3722811/1‑150 (MQ=255) aCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtcc > 2:1686268‑M2/1‑69 (MQ=255) ttATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccct < 2:3914184‑M2/150‑84 (MQ=255) aaaagtaatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGTAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAg < 1:1364210‑M2/92‑1 (MQ=255) tGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgtt > 1:558949‑M2/1‑61 (MQ=255) ggggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTTAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct < 2:488148‑M2/150‑62 (MQ=255) tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAttt > 2:3958620‑M2/51‑150 (MQ=255) gggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt < 2:2496786‑M2/150‑63 (MQ=255) gggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt < 1:3101048‑M2/150‑63 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctg < 1:4276536‑M2/150‑66 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac > 1:884426‑M2/47‑150 (MQ=255) ggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcta > 2:2419664‑M2/1‑55 (MQ=255) ggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt > 2:1140616‑M2/1‑84 (MQ=255) gtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgcc > 1:593016‑M1/1‑58 (MQ=255) tctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgatga < 1:4123695‑M2/110‑1 (MQ=255) gAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca > 1:3692902‑M2/1‑76 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgcagca > 2:789195‑M2/31‑150 (MQ=255) agagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTATGggtgatgcttccatcttacttatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgtcttctttttctatcatctgtccctcctgttcttctactgacgtggtggtgcgtaa > 2:1025185‑M2/1‑36 (MQ=255) gagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg < 2:379949‑M2/150‑99 (MQ=255) agCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaccttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcgtctgtttctatcagctgtccctcctg < 2:1218385‑M2/150‑88 (MQ=255) agCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGa < 1:3351932/150‑1 (MQ=255) cTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGt < 1:2571513/150‑1 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaa < 2:3511457‑M2/150‑121 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca < 1:1126579‑M2/150‑92 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctataagctgtccctcctgttca < 1:1843478‑M2/150‑92 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacaga > 1:855667‑M1/1‑58 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacaga > 2:613994‑M1/1‑58 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacaga > 1:3578615‑M1/1‑58 (MQ=255) cAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcaga < 2:1698422‑M1/150‑124 (MQ=255) ttGTGCAATAGCCAGTAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgattgtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccacctattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcca > 1:1920130‑M2/1‑37 (MQ=255) ttGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcca > 1:752614‑M2/1‑37 (MQ=255) tgtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgg > 1:3419832‑M2/1‑48 (MQ=255) tgtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgg > 1:2729133‑M2/1‑48 (MQ=255) tgCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccgga > 1:1241691‑M2/1‑17 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg < 2:2688042‑M2/150‑108 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcaactgacggggtgg < 2:2822133‑M2/150‑108 (MQ=255) aGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgc > 1:2423356‑M2/1‑40 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaa > 2:3304458‑M2/1‑36 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctaatgacggggtggtgcgtaa < 1:2009082‑M2/150‑115 (MQ=255) cgaATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaac > 2:4146976‑M2/2‑35 (MQ=255) gtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgc < 2:2642537‑M1/150‑150 (MQ=255) gtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgc < 2:874985‑M1/150‑150 (MQ=255) | AAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATT > NC_000913/1292854‑1293150 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |