| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
CGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAC > NC_000913/2817793‑2818089 | cGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATT < 2:3256855‑M1/150‑1 (MQ=255)cGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATT > 2:3897035‑M1/1‑150 (MQ=255) gatgaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCTTGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACt < 1:1398056/147‑1 (MQ=255) gaggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCCGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACt < 2:2567542/150‑1 (MQ=255) atgaTTCGAACCTCCGACCGCTAGGTTCGTAGCCGTGTTCTCTTTGCATCTGAGCTACTGATTCATCGTGATCACTTATTCTACTGCTGATATTGAGACCGCTACTAAAGCCATATCAATTATGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTc < 1:607413/148‑1 (MQ=14) ggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCg < 1:963911/150‑1 (MQ=255) aaCCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCg < 2:1732336/150‑1 (MQ=255) aCCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCAATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCgg < 1:1627945/150‑1 (MQ=255) cTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCt < 2:4064959/150‑1 (MQ=255) ccGACCTCTCGGTAAGTAGCCTAGTACTCTATCCACATGAGCAACTCATTCATCCCCAAAACATATTCTACATATCATATTGATAAATATAATAAAGAAATATAAATTAATAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCg < 1:3966371/150‑1 (MQ=12) ccGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCTTCTGAGCTACGTATTCATCGTGACAACATATTCTACTGCTGATATTGATACCTCTACTAACGCCATATCAATTAATAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCg < 1:1701801/150‑1 (MQ=17) ccGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCg < 1:659470/150‑1 (MQ=255) ccGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCg < 1:2851907/150‑1 (MQ=255) ccGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCg < 2:284659/150‑1 (MQ=255) gCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTc > 2:835996/1‑150 (MQ=255) cTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCg < 1:2539928/150‑1 (MQ=255) tCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCgg < 1:3523645/150‑1 (MQ=255) cGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCggg < 1:4139517/150‑1 (MQ=255) 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tctATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTAATTCAACTCCTGATATTGATACCGCAACTAGAGACATATCAATTAAGAGAAGGTGGATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTATAGCAACGt > 2:215428/1‑150 (MQ=17) aTCGAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTat < 1:1142173/150‑1 (MQ=255) aTCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTat > 2:1186259/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTatc > 2:3945141/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTatca > 1:427373/1‑150 (MQ=255) 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aTCCGGGAGGATTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagct > 1:3606636‑M1/1‑13 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagct < 1:2480996‑M1/58‑46 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagct > 2:2480996‑M1/1‑13 (MQ=255) tCCGGGAGGATTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcc > 1:3459594‑M1/1‑12 (MQ=255) cGGGAGGATTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcagg < 1:1647197‑M1/133‑124 (MQ=255) gggAGGATTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctct > 1:757719‑M1/1‑9 (MQ=255) gggAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAAcc > 1:1075189/1‑150 (MQ=255) gaggaTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctcg < 1:1001236‑M1/150‑144 (MQ=255) gaggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTc < 1:4237102/150‑1 (MQ=255) ggtttcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggttgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttctgcctctcggc < 2:4165525‑M1/147‑146 (MQ=255) gaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGa < 1:3707653/150‑1 (MQ=255) gaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGa < 1:1186259/150‑1 (MQ=255) aTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctcggcca < 1:1288213‑M1/150‑148 (MQ=255) | CGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAC > NC_000913/2817793‑2818089 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |