| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | NC_000913 | = 3931842 | 250 (1.030) | coding (527/1869 nt) | kup | potassium transporter | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 326 total aligned reads displayed.
GCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAA > NC_000913/3931644‑3931942 | gcAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAAC < 1:1829069‑M1/150‑1 (MQ=255) tttttCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACcaggt > 2:1034679‑M1/1‑145 (MQ=255) tCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACgg < 2:3733645/150‑1 (MQ=255) tCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACgg < 2:2106463/150‑1 (MQ=255) tCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACgg < 1:919725/150‑1 (MQ=255) tCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACgg < 1:4304331/150‑1 (MQ=255) tCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACgg < 1:4201147/150‑1 (MQ=255) ggTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCTGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATg > 2:1740024/1‑150 (MQ=255) 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ttatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCg > 1:1572468/1‑150 (MQ=255) tatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTgcgc < 1:1643631/51‑1 (MQ=255) tatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCa > 1:3974699/1‑150 (MQ=255) atGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCAt > 2:1228827/1‑150 (MQ=255) gATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCAttt > 1:6738/1‑150 (MQ=255) aTTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATttc > 1:3738926/1‑150 (MQ=255) 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cAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATttcttc < 1:498843/150‑1 (MQ=255) aaaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTcc > 1:972311/1‑150 (MQ=255) aaaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTcc < 1:722661/150‑1 (MQ=255) aaaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTcc > 1:1503478/1‑150 (MQ=255) aaaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTcc > 1:513033/1‑150 (MQ=255) 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ccaggtcagcatgatcggcgcaaacagcttaccgaccatagccgtgccatgtttttgaatcataaataataaagtgagaacgataattgagaggggaactatccaggtatccagctgcggggcgacgatttccagaccttcaatggctga < 1:468951‑M1/150‑150 (MQ=255) | GCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAA > NC_000913/3931644‑3931942 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |