Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,292,997 | IS1 (+) +9 bp | 51.6% | intergenic (‑75/‑522) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 43 (0.170) | 29/278 | NT | 47.7% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 1292997 = | 44 (0.180) | intergenic (‑75/‑530) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
* | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 51 (0.200) | 35/278 | NT | 52.0% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1293005 | 44 (0.180) | intergenic (‑83/‑522) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
GTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTT > NC_000913/1292858‑1293152 | gtACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTa < 1:4056039/150‑1 (MQ=255) gtACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTa < 1:4211722/150‑1 (MQ=255) gaCATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTaa < 2:2480576/149‑1 (MQ=255) gtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAg > 1:3414876‑M1/138‑150 (MQ=255) gtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAg > 1:3790068‑M1/138‑150 (MQ=255) aCATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg < 2:2055480/150‑1 (MQ=255) aCATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg < 2:1831103/150‑1 (MQ=255) ttCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGaa > 2:2948020/1‑150 (MQ=255) ctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAAtt > 2:1610838‑M2/133‑150 (MQ=255) ctTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTACTAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCa > 2:281326/1‑150 (MQ=255) ctTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgc > 1:1702695‑M2/1‑139 (MQ=255) ttGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCaa < 1:4089547/150‑1 (MQ=255) gCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaa > 1:2414789‑M2/1‑136 (MQ=255) cTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAtt < 1:898629/150‑1 (MQ=255) cTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAtt < 1:374928/150‑1 (MQ=255) tgagcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGTTGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCATTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTAAAAATTg > 2:1356690/4‑150 (MQ=255) gcgcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGt < 2:1061671/150‑1 (MQ=255) gcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttact < 2:3417706‑M2/150‑21 (MQ=255) gcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTc > 1:1067203/1‑150 (MQ=255) cacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTa > 2:3901273‑M2/118‑150 (MQ=255) tccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAttt < 2:2667498‑M1/36‑1 (MQ=255) aCGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATAGTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaa < 1:2937748‑M2/150‑15 (MQ=255) gATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtga < 2:675689‑M2/150‑6 (MQ=255) gATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtga < 2:1115223‑M2/150‑6 (MQ=255) gttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgc < 1:1160256‑M2/150‑9 (MQ=255) ttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgct > 1:1498168‑M2/1‑141 (MQ=255) gggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaa < 2:1383371‑M2/47‑1 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgc > 1:1549835‑M2/1‑139 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcagttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAATTTGTTGTTTATTTTGTGCCGCCaataa < 2:422541‑M1/50‑1 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataa < 2:2244642‑M1/50‑1 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataa < 1:399354‑M1/50‑1 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt > 2:564830‑M2/1‑107 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 2:21798‑M2/150‑45 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaac < 1:2687504‑M2/150‑16 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAatat < 2:1870062‑M2/54‑1 (MQ=255) gAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAatat > 2:1276080/1‑150 (MQ=255) gAAATTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATAGGGGTGGTTTTTTGAGGTAATAAAAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGACGCCAAAAAaaat > 2:3981548/1‑150 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 1:3125103‑M2/1‑104 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga < 1:200146‑M2/150‑47 (MQ=255) aTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag > 1:2086622‑M2/1‑103 (MQ=255) aTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaactta > 2:1928972‑M2/1‑132 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttac > 2:3454184‑M2/1‑131 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttac > 2:2409178‑M2/1‑131 (MQ=255) tcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCtt < 1:61485‑M2/57‑1 (MQ=255) tAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgc < 1:1895907‑M2/150‑52 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAATGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCAt > 1:1669771‑M2/89‑150 (MQ=255) gTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagc > 2:3839688‑M1/1‑100 (MQ=255) gttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaaa > 2:4015258‑M2/86‑150 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg < 1:2892629‑M2/150‑59 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaaattactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg < 1:3524473‑M2/150‑59 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAAt > 2:3947980/1‑150 (MQ=255) gtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccgtgcaatagCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTa < 1:2207714‑M2/69‑1 (MQ=255) cGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc > 1:664132‑M2/1‑90 (MQ=255) ggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacccaatagCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc < 2:3337809‑M2/71‑1 (MQ=255) tCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:2606834‑M2/1‑104 (MQ=255) tCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:2606876‑M2/1‑104 (MQ=255) tCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:2318904‑M2/1‑104 (MQ=255) tcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGa < 1:1847533‑M2/75‑1 (MQ=255) tGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt > 2:1686348‑M2/1‑112 (MQ=255) tGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt > 1:2107275‑M2/1‑112 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAg < 1:1911527‑M1/79‑1 (MQ=255) agtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAg > 2:297596/1‑150 (MQ=255) gtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcac < 1:3315381‑M1/150‑39 (MQ=255) gtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTAATAAAATTATCCAGaaaata > 1:3355969/1‑148 (MQ=255) taATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCC‑‑‑‑‑‑gtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgt < 1:572606‑M2/150‑79 (MQ=255) tgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCgg < 2:2691525‑M2/85‑1 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTATCCAGAAAAGACGCGGc > 2:3722811/1‑150 (MQ=255) aaaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCat > 2:2585546/1‑150 (MQ=255) aaaagtaatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGTAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAg < 1:1364210‑M2/92‑1 (MQ=255) ggggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTTAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct < 2:488148‑M2/150‑62 (MQ=255) tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGACTGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAttt > 1:2495608‑M2/51‑150 (MQ=255) gggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt < 1:3101048‑M2/150‑63 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac > 1:885087‑M2/47‑150 (MQ=255) tttGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCg > 1:4352143/1‑150 (MQ=255) aataatAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggt > 2:3538176‑M2/1‑42 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgcagca > 2:789195‑M2/31‑150 (MQ=255) agagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGTATGggtgatgcttccatcttacttatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgtcttctttttctatcatctgtccctcctgttcttctactgacgtggtggtgcgtaa > 2:1025185‑M2/1‑36 (MQ=255) gagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg < 2:379949‑M2/150‑99 (MQ=255) cTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGt < 1:2571513/150‑1 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaa < 1:3685545‑M2/150‑121 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca < 1:1126579‑M2/150‑92 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca < 2:2512092‑M2/150‑92 (MQ=255) tAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcag > 1:2313174‑M2/1‑58 (MQ=255) tAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTa > 2:326286/1‑150 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaa < 2:939657‑M2/150‑123 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacaga > 2:613994‑M1/1‑58 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacaga > 1:3578615‑M1/1‑58 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacaga > 1:855949‑M1/1‑58 (MQ=255) ttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACtt > 2:3678867‑M2/15‑150 (MQ=255) cAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcaga < 2:1698422‑M1/150‑124 (MQ=255) gtgtgcAAGAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg > 2:3303957‑M2/2‑49 (MQ=255) tgtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgg > 1:3419832‑M2/1‑48 (MQ=255) tgtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgg > 1:2729133‑M2/1‑48 (MQ=255) tgCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccgga > 1:1241691‑M2/1‑17 (MQ=255) ttaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTCTTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCa > 1:596963‑M2/6‑150 (MQ=255) tAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCAAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATg < 1:851731/150‑1 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt > 2:1189708‑M2/1‑38 (MQ=255) cAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgta < 2:3064054‑M2/150‑114 (MQ=255) aaTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatc < 1:1002520‑M2/150‑147 (MQ=255) aTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatct > 2:2001259‑M2/1‑3 (MQ=255) | GTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTT > NC_000913/1292858‑1293152 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |