Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,293,023 | IS1 (+) Δ3 bp | 57.1% | intergenic (‑101/‑502) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 17 (0.070) | 9/278 | NT | 34.5% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1293022 | 33 (0.130) | intergenic (‑100/‑505) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
* | ? | NC_000913 | 1293026 = | 33 (0.130) | 71 (0.280) | 47/276 | NT | 68.7% | intergenic (‑104/‑501) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
TGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGG > NC_000913/1292873‑1293171 | tGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTg > 2:1356655/1‑150 (MQ=255) tGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTg > 2:1356916/1‑150 (MQ=255) gcgcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGt < 2:1061671/150‑1 (MQ=255) aggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGt > 1:2094119‑M2/124‑150 (MQ=255) atgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCttt > 2:512307‑M2/137‑150 (MQ=255) cacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTa > 2:3901273‑M2/118‑150 (MQ=255) tccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAttt < 2:2667498‑M1/36‑1 (MQ=255) gagTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAttt < 2:335428/150‑1 (MQ=255) tACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGg > 1:1529206‑M2/1‑149 (MQ=255) aCGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaa < 1:2937741‑M2/150‑15 (MQ=255) gATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtga < 2:3804703‑M2/150‑6 (MQ=255) gATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtga < 2:1115203‑M2/150‑6 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataa < 2:2244641‑M1/50‑1 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataa < 1:399354‑M1/50‑1 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaac < 1:2687505‑M2/150‑16 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaac < 1:3421961‑M2/150‑16 (MQ=255) ttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAatat > 2:527433‑M2/115‑150 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAatat < 2:1870062‑M2/54‑1 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAatat < 1:3416238‑M2/54‑1 (MQ=255) gAAATTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATAGGGGTGGTTTTTTGAGGTAATAAAAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGACGCCAAAAAaaat > 2:3981548/1‑150 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttac > 1:1892631‑M2/1‑131 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttac > 2:3454184‑M2/1‑131 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttac > 2:2409178‑M2/1‑131 (MQ=255) tcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCtt < 1:3117742‑M2/57‑1 (MQ=255) tcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCtt < 1:61485‑M2/57‑1 (MQ=255) ctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTc < 1:1309202‑M2/60‑1 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAATGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCAt > 1:1669771‑M2/89‑150 (MQ=255) accccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATa > 2:54175‑M2/106‑150 (MQ=255) gCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttag > 1:891496‑M2/1‑123 (MQ=255) cccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaccagaagccactggagcacctcaaaaacaccctcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaaa < 2:4100498‑M2/47‑1 (MQ=255) gtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccgtgcaatagCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTa < 1:2207714‑M2/69‑1 (MQ=255) ggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacccaatagCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc < 2:3337809‑M2/71‑1 (MQ=255) tCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:2606876‑M2/1‑104 (MQ=255) tCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:2606834‑M2/1‑104 (MQ=255) tGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt > 2:1686348‑M2/1‑112 (MQ=255) tGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt > 2:2054269‑M2/1‑112 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAg < 1:1911527‑M1/79‑1 (MQ=255) agtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAg > 2:297596/1‑150 (MQ=255) gtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTAATAAAATTATCCAGaaaata > 1:3355969/1‑148 (MQ=255) gctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgc < 1:537704‑M2/83‑1 (MQ=255) tgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCgg < 2:2691525‑M2/85‑1 (MQ=255) tcAAACTTTTATTGGGGTTGTTTTTTTATTTAATAATAGATCCTTAATTTCAGTTGTGCAATAGCCTGGAATGTAAGGATTTAAAATTTGTTTTTTATTTTGTGCCGACAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGc < 1:1431354/150‑1 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTATCCAGAAAAGACGCGGc > 2:3722811/1‑150 (MQ=255) aaaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCat > 2:2585546/1‑150 (MQ=255) caaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAg < 1:3533726‑M2/92‑1 (MQ=255) tataTTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca > 1:3741369‑M2/1‑95 (MQ=255) atatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt > 1:1065285‑M2/1‑82 (MQ=255) atTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcc > 2:2300727‑M2/1‑80 (MQ=255) ttGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTa > 2:2758982/1‑150 (MQ=255) ggggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct < 2:453216‑M2/150‑62 (MQ=255) tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGACTGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAttt > 1:2495608‑M2/51‑150 (MQ=255) tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAttt > 2:3010848‑M2/51‑150 (MQ=255) tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAttt > 2:3958620‑M2/51‑150 (MQ=255) gggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt < 1:3101048‑M2/150‑63 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctg < 1:4276536‑M2/150‑66 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac > 1:884426‑M2/47‑150 (MQ=255) gcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac < 1:681055‑M2/86‑1 (MQ=255) gAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca > 1:4069413‑M2/1‑76 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagct < 2:707945‑M2/150‑78 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgcagca > 2:789414‑M2/31‑150 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACg > 2:2368273‑M2/47‑150 (MQ=255) ttatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGa > 1:50175‑M2/44‑150 (MQ=255) ttatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTGTCATAAAATTAGCCAGAACAGACGCGGCATAGCGCCCGCTGTACGCCGATGATTGCGCAGCTCGTGa > 1:2350074‑M2/44‑150 (MQ=255) agCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaccttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcgtctgtttctatcagctgtccctcctg < 2:1218385‑M2/150‑88 (MQ=255) cTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGt < 2:3297939/150‑1 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca < 2:2512092‑M2/150‑92 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca < 1:3351786‑M2/150‑92 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctataagctgtccctcctgttca < 1:1843478‑M2/150‑92 (MQ=255) tAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcag > 1:2580949‑M2/1‑58 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacaga > 1:855667‑M1/1‑58 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacaga > 2:613994‑M1/1‑58 (MQ=255) ttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACtt > 2:3678867‑M2/15‑150 (MQ=255) tggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAATTTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCGGCACGTGTGGTTAAAACTTc < 1:4015258‑M2/137‑1 (MQ=255) ggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTcc < 2:1943725‑M2/138‑1 (MQ=255) ttGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcca > 1:752614‑M2/1‑37 (MQ=255) gggccagtctaCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCt > 2:399354‑M1/12‑150 (MQ=255) aacactatcaataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATGTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCt < 2:1413932‑M2/121‑1 (MQ=255) tgtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgg > 1:2729133‑M2/1‑48 (MQ=255) cAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctactgttcagctactgacggggtg < 2:18594‑M2/150‑107 (MQ=255) ttaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTCTTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCa > 1:596963‑M2/6‑150 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg < 2:642095‑M2/150‑108 (MQ=255) aTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggt > 1:1116450‑M2/1‑42 (MQ=255) ataagttggagtcattaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTc > 2:1984644‑M2/20‑150 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt > 2:1189708‑M2/1‑38 (MQ=255) cAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgta < 2:3064054‑M2/150‑114 (MQ=255) agttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTcaca > 1:3021258‑M2/17‑150 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaa > 2:3304458‑M2/1‑36 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctaatgacggggtggtgcgtaa < 1:2009082‑M2/150‑115 (MQ=255) gAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCgtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggcc > 1:1158290‑M1/1‑38 (MQ=255) ctAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTAt < 2:4248662/149‑1 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaa < 1:3594736‑M2/150‑122 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatga < 2:655587‑M1/150‑29 (MQ=255) aGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaag > 2:1126579‑M2/1‑27 (MQ=255) ggAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagc > 2:247222‑M2/1‑26 (MQ=255) gAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagca > 2:1488679‑M2/1‑25 (MQ=255) aaTTCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcac > 2:4173561‑M2/1‑24 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccg < 1:2809410‑M2/150‑129 (MQ=255) tCAAAATTGTTCTTTATTTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgc > 2:3242993‑M2/1‑21 (MQ=255) aaaTTGTACTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATAACTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATc < 2:2922920/150‑1 (MQ=255) gTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAACAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAgg < 2:3786423/150‑1 (MQ=255) | TGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGG > NC_000913/1292873‑1293171 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |